Varijacije u broju kopija
|
|
- Loren Long
- 6 years ago
- Views:
Transcription
1 Varijacije u broju kopija 1. Novo pitanje genomike : Genom čoveka ili genomi ljudi? Genomika je naučna oblast koja je nastala kao rezultat dostignuća molekularne biologije i razvoja tehnika kojima je moguće odrediti redosled nukleotida u molekulima nukleinskih kiselina. Naziv genomika nastao je dodavanjem sufiksa omika na reč gen. Sufiks omika je grčkog porekla i znači sve, svako, potpuno, kompletno. Predmet istraživanja genomike su genomi kako živećih tako i izumrlih vrsta. Početak 21. veka obeležen je završetkom najvećeg i najskupljeg naučnog projekta iz oblasti molekularne biologije, dešifrovanje sekvence genoma čoveka. Internacionalni konzorcijum Genom čoveka rezultate svoga rada objavljuje 15. februara godine u časopisu Nature. Samo dan kasnije tim naučnika kompanije Celera Genomics objavljuje svoje rezultate dešifrovanja genoma čoveka u časopisu Science. Tom prilikom data je i preliminarna procena da genomi različitih individua poseduju 99,9% identičnu sekvencu. Aprila godine dobijena je kompletna sekvenca genoma čoveka, dok je broj gena procenjen na oko u oktobru godine. Od tada, svake godine svedoci smo nove revizije broja gena čoveka. Prema skorašnjim podacima naš genom poseduje manje od gena za proteine. Rezultati projekta ENCODE (eng. Encyclopedia of DNA Elements) pokazuju da genom čoveka poseduje više gena za regulatorne molekule RNK nego gena za proteine (Tabela 1). Tabela 1. Inventar genoma čoveka Vrste gena Broj gena Geni za proteine Geni za duge nekodirajuće RNK Geni za male nekodirajuće RNK 9882 Psudogeni Ukupan broj gena Do početka godine kompletno su dešifrovani genomi preko vrsta, dok su za preko vrsta objavljeni preliminarni draftovi genoma. U toku je i sekvenciranje preko genoma. Na osnovu dešifrovanja genoma razlizičitih vrsta razvila se i nova naučna disciplina komparativna genomika. Osnovni cilj ove naučne discipline je upoređivanje genoma različitih vrsta u cilju identifikacija njihovih sličnosti i razlika, naročito na nivou gena i drugih funkcionalnih elemenata genoma, kao što su promotori i regulatorni elemenati. Na osnovu rezultata ovih istraživanja smatra se da će komparativna genomika pomoći u razumevanju funkcija i evolucije genoma. Jedan od glavnih ciljeva genomike je i istraživanje genoma čoveka, njegove strukture i funkcije. Zahvaljujući tehnološkom napretku u poslednjih deset godina sve je veći broj laboratorija koje su u mogućnosti da vrše brzo i relativno jeftino sekvenciranje kompletnih 1
2 genoma individua, kao i da vrše upoređivanja iščitanih genoma u cilju identifikacije sličnosti i razlika. Poređenjem sekvenci genoma različitih individua, pokazano je da postoje kvantitativne strukturne razlike u genomima ljudi koje se danas nazivaju varijacije u broju kopija (eng. copy number variation, CNV). To su segmenti molekula DNK veličine od 50bp do 1Mb (ili veći) koji se u jednom genomu pojavljuje u različitom broju kopija u odnosu na referentni genom. Varijacije u broju kopija su kvantitativne strukturne varijante genoma. Pored kvantitativnih, razlikuju se i pozicione strukturne varijante (translokacije) i orijentacione strukturne varijante (inverzije). Kombinacijom genskog čipa i komparativne genomske hibridizacije razvijena je nova molekularno-biološka metoda koja se naziva komparativna genomska hibridizacija bazirana na genskom čipu (acgh) (slika 1). Komparativna genomska hibridizacija je molekularno-biološka metoda za ispitivanje duplikacija i delecija velikih hromozomskih regiona, i numeričkih hromozomskih aberacija. Korišćenjem acgh moguće je vršiti simulatno upoređivanje genoma dve individue. Razvoj ove metode omogućen je konstruisanjem genskog čipa na kome je istačkan genom jedne osobe predstavljen u vidu oligonukleotida. Zbog prirode istačkanih proba ovako istačkan genski čip naziva se genski čip reprezentativnih oligonukleotida (eng. Representational Oligonucleotide Microarray), a sama analiza poznata je po svom engleskom akronimu ROMA (eng. Representational Oligonucleotide Microarray Analysis). Rezolucija prvih oligonukleotidnih genskih čipova koji su se koristili tokom razvoja metode acgh iznosila je 30kb. Slika 1. Komparativna genomska hibridizacija bazirana na genskom čipu (acgh). Ova metoda bazira se na simultanoj hibridizaciji dve genomske DNK (izolovane iz uzoraka poreklom od dve osobe) na genskom čipu na čijoj podlozi se nalazi istačkan genom treće osobe. 2
3 U analizi inidividualnih razlika između genoma ljudi, pored acgh, svoju primenu imaju i strategije nove generacije sekvenciranja. Svaki sekvenciran genom može biti predmet analize CNV ako se sekvenca tog genoma uporedi sa sekvencom nekog prethodno očitanog genoma korišćenjem odgovarajućih bioinformatičkih algoritama. Danas, postoji najmanje 12 različitih metodoloških platofirmi za detekciju i analizu razlika između genoma različitih individua. One se međusobno razlikuju po korišćenim metodama za identifikaciju razlika u genomima ljudi (različite modifikacije acgh ili različite strategije nove generacije sekvenciranja) i po matematičkim algoritimima za selekciju i analizu dobijenih rezultata. Zajednička osobina prethodno navedenih platformi je neophodnost da se identifikovane razlike u genomima analiziranih individua potvrde korišćenjem neke od konvencionalnih metoda molekularne biologije kao što su: fluorescentna in situ hibridizacija (FISH); lančana reakcija polimerizacije u realnom vremenu (eng. real-time PCR), sekvenciranja definisane sekvence molekula DNK ili multipleks amplifikacija ligiranih proba (metoda MLPA). Multipleks amplifikacija ligiranih proba (eng. Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification, MLPA) je metoda koja omogućava brzo detektovanje promena u broju kopija (delecija ili duplikacija). Najznačajnija odlika MLPA je što se ne umnožavaju ciljne sekvence DNK, već probe koje hibridizuju s njima. Svaka MLPA proba sastoji se od dva oligonukleotida, koja hibridizuju sa susednim ciljnim sekvencama na takvom rastojanju da između njih može da se odigra proces ligacije (slika 2). MLPA probe Hibridizacija Ligacija PCR Slika 2. Multipleks amplifikacija ligiranih proba (MLPA). Metoda podrazumeva denaturaciju DNK (nije prikazana na slici), hibridizaciju MLPA proba sa ciljnima sekvencama, amplifikaciju ligiranih proba PCR-om. Umnoženi fragmenti se identifikuju i kvantifikuju fragment analizom. Jedan oligonukleotid svake MLPA probe na 3 kraju sadrži sekvencu komplementarnu specifičnoj ciljnoj sekvenci, dok na 5 kraju sadrži sekvencu koja je zajednička za sve MLPA probe i komplementaran je fluorescentno obeleženom PCR prajmeru. Drugi oligonukleotid svake MLPA probe na 5 kraju poseduje sekvencu komplementarnu specifičnoj ciljnoj sekvenci, na 3 kraju sadrži sekvencu zajedničku za sve MLPA probe koja je komplementarna neobeleženom prajmeru. Između ova dva kraja nalazi se insert ili stuffer 3
4 sekvenca različite dužine. Ligacijom oligonukleotida MLPA probe (koji su hibridizovali sa susednim ciljnim sekvencama) formiraju se uspešno ligirane probe koje imaju identične sekvence na 5 i 3 krajevima. Zahvaljujući ovoj njihovoj osobini omogućena je istovremena amplifikacija i do 50 različitih MLPA proba korišćenjem samo jednog para prajmera. Kao rezultat procesa amplifikacije ligiranih MLPA proba, nastaju PCR produkti jedinstvene dužine, odnosno kombinacija jedinstvenih, PCR-om umnoženih fragmenata čiji je opseg dužina od nekoliko desetina do nekoliko stotina bp. Umnoženi fragmenti se analiziraju fragment analizom, metodom za razdvajanje fragmenata molekula DNK na osnovu njihovih dužina sa senzitivnošću od 1bp. Primenom specifičnog softvera za obradu podataka utvrđuje se broj kopija (delecija ili duplikacija) analiziranih segmenata molekula DNK. U prošloj deceniji, naučnici su koristili različite nazive za identifikovane kvantitativne strukturne razlike u genomima ljudi. Jonathan Sebat ih je nazvao polimorfizmi u broju kopija (eng. copy number polymorphism, CNP), dok ih je Anthony John Lafrate nazvao velika skala varijacija u broju kopija (eng. large-scale copy-number variation, LCV). Eray Tuzun je identifikovane razlike nazvao ISV (eng. intermediate sized variant, ISV). Svi ovi pojmovi danas su objedinjeni pojom CNV. Najznačajniji eksperimenti u periodu otkrića i identifikacije varijacija u broju kopija u genomu čoveka nalaze se u tabeli 2. Tabela 2. Eksperimenti kojima je otkriveno postojanje varijacija u broju kopija Godina Naučnici Otkrića Wigler i Lucito Otkriće tehnike ROMA (genski čip reprezentativnih oligonukleotida) Iafrate i saradnici 255 duplikacija i delecija između genoma 55 nesrodnih individua Sebat i saradnici 221 razlika između genoma 20 nesrodnih individua Tuzin i saradnici 241 razlika i 56 inverzija između genoma datog od strane internacionalnog konzorcijuma Genom čoveka (HGP) i genoma anonimnog muškarca Conrad i saradnici Upoređivanjem dva genoma identifikovali 586 delecionih varijanti veličine od 300bp do 1,2Mb, pri čemu su 92 gena bilo kompletno deletirana dok su 109 gena bila delimično deletirana Hinds i saradnici Identifikovali 215 potencijalnih delecionih varijanti veličine od 70bp do 10kb kod 24 nesrodnih individua Redon i saradnici Identifikovali 1,447 CNVs koje zauzimaju veličinu od 360Mb (12% genoma) i sadrže hiljade gena (3000), lokuse povezane sa bolestima čoveka, funkcionalne elemente i segmetne duplikacije tokom analize genoma 270 individua iz 4 evropske populacije Lipson i saradnici Optimizacija metode acgh i unapređenje matematičkog algoritma za analizu dobijenih rezultata Prvobitno korišćeni termin polimorfizam zamenjen je terminom varijanta jer se polimorfizam definiše kao genetička varijanta sa učestalošću ređeg alela 1%. Dosadašnja 4
5 istraživanja pokazuju da su određene CNV u opštoj populaciji prisutne sa frekvencom manjom od 1% te se zbog toga ne ubrajaju u polimorfizame sekvenci molekula DNK. Upravo zbog male učestalosti pojedinih CNV, i pored razlika u genomima pojedinačnih individua koje mogu da obuhvataju i 15% ukupne dužine genoma, još uvek se na genome različitih ljudi gleda kao na jedinstven genom čoveka. Drugim rečima, ove razlike ne daju osnovu da se govori o genomima ljudi umesto o jedinstvenom genomu čoveka. Na taj način osnažuju se etički, moralni i socijalni principi na kojima se baziraju savremena istraživanja genoma čoveka i obesmišljena svaka nenaučna namera konstruisanja tzv. novih naučnih činjenica koje bi opravdavali neku novu eugenetiku. 2. Opšte odlike varijacija u broju kopija Po svojoj prirodi, CNV mogu biti duplikacije, delecije ili insercije sekvence molekula DNK, i kompleksniji genetički rearanžmani koji obuhvataju veći broj hromozoma (kompleksne CNV). Varijacije u broju kopija po tipu duplikacija dele se na tandemske i multialelske. Tandemske duplikacije podrazumevaju duplikacije određenog segmenta molekula DNK koji se u svim analiziranim genomima dupliciraju na isti način, dok multialelske duplikacije podrazumevaju duplikacije čiji se broj dupliciranih segmenata molekula DNK razlikuje između analiziranih genoma (slika 3). Kompleksna CNV podrazumeva segment molekula DNK koji u jednom genomu može biti dupliciran a u drugom deletiran. Sve, do sada otkrivene, CNV mogu se naći u katalogu genetičkih varijanti genoma čoveka (eng. Database of Genomic Variants, DGV) na internet strani Slika 3. Tipovi varijacija u broju kopija (CNV). Varijacija u broju kopija je segment molekula DNK koji u jednom genomu u odnosu na drugi genom može biti a. deletiran, b. tandemski dupliciran, c. insertovan, d. različiti broj puta dupliciran (multialelska duplikacija) ili e. može biti kompleksno izmenjen u smislu duplikacija i delecija (kompleksna CNV). U genomu čoveka detektovano je i prisustvo triplikata. Po svojoj strukturi razlikuju se dva tipa triplikata. Tipu I pripadaju segmenti molekula DNK koji predstavljaju tandemski 5
6 ponovljene triplikate, a tipu II triplikati koji su međusobno invertni i razdvojeni segmentima molekula DNK koji su duplicirani (slika 4). Slika 4. Triplikati kao varijacije u broju kopija. a. Triplikati tipa I predstavljaju tandemski ponovljene (po principu glava-rep) tri kopije određenog segmenta molekula DNK; b. Triplikati tipa II su triplikati koji su međusobno invertni i razvojeni segmentima molekula DNK koji su duplicirani. CNV po tipu duplikacija treba razlikovati od mikrosatelita i minisatelita. Istovremeno, CNV po tipu delecija treba razlikovati od mikro-delecija veličine od preko 1 Mb koje se ubrajaju u hromozomske aberacije. Takođe, u CNV po tipu insercija ne ubrajaju se insercije nastale kao posledica aktivnosti transpozona. Poslednjih godina, pojedini autori insercije i ne ubrajaju u CNV. Preliminarna istraživanja pokazuju da se preko 99% CNV nasleđuju, dok tokom života jedne individue de novo nastaje 1% CNV. Takođe, prema dosadašnjim analizama genom jedne individue poseduje najmanje 12 CNV u odnosu na referentni genom čoveka. U istraživanjima distribucije CNV u genomima ljudi kao referentni genom uzima se genom iščitan tokom projekta Genom čoveka. CNV u protein kodirajućim delovima genoma najčešće obuhvataju gene za proteine uključene u puteve prenosa signala u ćelijama imunskog sistema, međućelijskoj komunikaciji i interakciji sa spoljašnom sredinom (čulo mirisa npr.). Takođe, geni za proteine uključene u mehanizme transpozicije prisutni su u različitom broju kopija kao posledica CNV. Duplikacija gena ne znači obavezno i povećan nivo ekspresije proteinskog produkta. Na ekspresiju dupliciranih gena utiče pozicioni efekat, kao i da li varijacija u broju kopija obuhvata regulatorne elemente gena. U slučajevima kada CNV po tipu duplikacije obuhvata i regulatorni region, ekspresija gena može biti povećana (slika 5a). Međutim, duplikacije koje ne obuhvataju regulatorne elemente (slika 5b) ili multialelske duplikacije (slika 5c) usled pozicionog efekta, ne moraju biti povezane sa povećanim nivom ekspresije dupliciranog gena. Na kraju, duplikacija može dovesti do promena u strukturi hromatinske petlje koja ograničava region molekula DNK u kojima regulatorni elementi ostvaruju svoj efekat na ekspresiju gena. U takvim okolnostima, ekspresija dupliciranog gena može biti značajno smanjena ili potpuno blokirana (slika 5d). 6
7 Slika 5. Efekat CNV na eksresiju gena. a. CNV po tipu duplikacije može uzrokovati povećan nivo ekspresije gena ukoliko duplikacija obuhvata i regulatorni region datog gena; b. U slučajevima kada CNV ne obuhvata regulatorni region, ekspresija gena može biti samo neznatno uvećana i pored toga što je gen prisutan u dve kopije; c. Kada je gen dupliciran kao posledica kompleksne CNV, jedna kopija gena (locirana na drugom hromozomu) može biti potpuno utišana usled pozicionog efekta, d. Smanjen nivo ekspresije dupliciranog gena može biti posledica promene u strukturi hromatinske petlje koja nastaje kao posledica CNV i koja ograničava domen dejstva okolnih regulatornih regiona. Međutim, najveće iznenađenje bilo je otkriće kompletno deletiranih gena u genomima pojedinih individua bez efekata na normalno funkcionisanje organizma, odnosno bez povezanosti takvih delecija sa patofiziološkim mehanizma razvoja bolesti. Procenjeno je da oko 3000 gena čoveka mogu biti meta delimične ili kompletne delecije. Do danas je u genomu čoveka identifikovano preko 100 gena za proteine koji su kompletno dilatirani kao posledica postojanja CNV. Jedino objašnjenje za prisustvo delecija gena bez efekta na funkcionisanje ćelija je da ćelije imaju sposobnost uključivanja kompenzatornih mehanizama ili aktiviranja alternativnih metaboličkih puteva kojima imaju mogućnost anuliranja nedostatka pojedinačnog gena. Pored genoma čoveka, CNV otkrivene su i u genomima drugih vrsta kao što su šimpanze (2006. godine), laboratorijski miševi (2007. godine), pernate životinje (2008. godine), rezuzus makaki (2008. godine), psi (2009. godine), krave (2010. godine). Pored genoma životinja, CNV detektovane su i u genomima biljaka kao što je Arabidopsis thaliana (2008. godine) ili kukuruz (2009. godine). Varijacije u broju kopija detektovane su i kod Drosophila (2007. godine), pivskog kvasca (2008. godine) i Caenorhabditis elegans (2010. godine). Od ukupno 331 detektovane CNV u genomu šimpaze, njih 74 obuhvata iste regione genoma kao i kod čoveka. Uočeni obrazac distribucije CNV u genomima šimpanze i čoveka podržava hipotezu da je dupliciranje gena bio jedan od mehanizama povećanja broja gena u genomima tokom evolucije. 7
8 3. Molekularni mehanizmi nastanaka varijacija u broju kopija Do danas nije poznat tačan molekularni mehanizam nastanka CNV (slika 6). Moguće je da CNV nastaju kao posledica određenih replikacionih i rekombinacionih procesa: a) nealelske homologne rekombinacije b) nehomolognog (prostog) spajanja krajeva (NHEJ) kao mehanizma reparacije dvolančanih prekida c) mehanizma FoSTeS tokom reparacije prekida u molekulu DNK d) transpozicije L1 elemenata. Slika 6. Molekularni mehanizmi nastanka CNV. a. nealelska homologna rekombinacija, b. nehomologno spajanje krajeva, c. reparacijom prekida u molekulu DNK mehanizmom FoSTeS, d. tokom transpozicije L1 elemenata. Nealelska homologna rekombinacija na tri načina može dovesti do duplikacija ili delecija segmenta molekula DNK. Duplikacije i delecije mogu biti posledica kako interhromozomskog (slika 7a), tako i intrahromozomskog (slika 7b) krosingovera. Rezultat nealelske homologne rekombinacije koja se odvija u okviru iste hromatide može biti delecija određenog segmenta molekula DNK (slika 7c). Kao posledica odvijanja nealelske homologne rekombinacije između sestrinskih hromatida formira se izohromozom koji sadrži segment molekula DNK koji je invertovan (slika 7d). Dvolančani prekidi u molekulu DNK čoveka najčešće se repariraju nehomologim spajanjem krajeva. Ovaj mehanizam može biti uzrok delecije određenog segmenta molekula DNK (slika 6b). Transpozicija retrotranspozona može generisati duplikacije u genomu čoveka koje se zbog načina nastanka nazivaju i retro CNV (slika 6d). 8
9 Slika 7. Nealelska homologna rekombinacija. Kao rezultat nealelske homologne rekombinacije može doći do delecije ili duplikacije segmenta molekula DNK koji se rekombinuje. a. Nealelska homologna rekombinacija između dva hromozoma za posledicu može imati deleciju ili duplikaciju segmenta molekula DNK; b. Genetički rearanžmani po tipu delecije ili duplikacije rezultat su i nealelske homologne rekombinacije koja se odigrava unutar jednog hromozoma; c. Ukoliko se ova vrsta rekombinacije odigrava u okviru jedne hromatide, rezultat je delecija segmenta molekula DNK koji se rekombinuje; d) Ako se nealaleska homologna rekombinacija odigrava između dve sestrinske hromatide rezultat može biti genetički rearanžman po tipu inverzije (izohromozom). Kompleksne CNV verovatno nastaju kao posledica reparacije jednolančanih prekida u molekulu DNK tokom replikacije mehanizmom koji je poznat po svojoj skraćenici mehanizam FoSTeS (eng. fork stalling and template switching, FoSTeS) (slika 6c). Mehanizam FoSTeS aktivira se zaustavljanjem replikacione viljuške na mestu jednolančanog prekida u molekulu DNK. Zbog zaustavljanja i kolapsa replikacione viljuške zaostajući lanac se razdvaja od lanca koji je bio matrica za njegovu sintezu. Zaostajući lanac, na osnovu mikrohomologije, nastavlja replikaciju korišćenjem druge replikacione viljuške koja se nalazi u blizini one koja je zaustavljena na mestu jednolančanog prekida. U zavisnosti da li se nova replikaciona viljuška nalazi uzvodno ili nizvodno od mesta jednolančanog prekida, nastavak replikacije dovodi do delecije ili duplikacije određenog segmenta molekula DNK. Nastali duplicirani segmenti mogu biti direktno ponovljeni ili invertovani. 4. Varijacije u broju kopija i bolesti čoveka Neposredno nakon otkrića varijacija u broju kopija počela su istraživanja o mogućoj ulozi CNV u patogenezi bolesti čoveka. Dosadašnja istraživanja pokazala su snažnu asocijaciju pojedinih CNV koje obuhvataju protein kodirajuće gene sa razvojem psihijatrijskih bolesti (uključujući i autizam), gojaznosti, psorijaze (autoimunska bolest kože), šećerne bolesti, zapaljenskih bolesti creva, itd. Poslednjih godina istražuje se moguća uloga CNV u procesima neoplastične transformacije koji su odogovorni za razvoj karicinoma debelog creva, pluća i prostate. Za neke bolesti čoveka molekularno-biološkim analizama pokazano je da su jedini do sada utvrđeni genetički uzročnici razvoja bolesti CNV. Takve bolesti se bez obzira na kliničku sliku ili organ koji pogađaju jednim imenom nazivaju oboljenja broja kopija (eng. copynumber disorder). Određene kongentalne bolesti srca ili bubrega su neke od njih. 9
10 Međutim, CNV koje obuhvataju gene za proteine mogu imati i pozitivan efekat po individue koji je poseduju. Primer su infektivne bolesti, kao što su infekcija HIV-a ili malarija. Naime, upoređivanjem distribucije CNV u 13 gena za proteine kod zdrave dece i njihovih vršnjaka zaraženih HIV-om u populaciji Brazila pokazana je pozitivna korelacija između broja kopija gena DEFB104 i rezistentnosti na infekciju ovim virusom. U okviru farmakogenomike danas se intezivno istražuje uloga CNV u individualnim odgovorima na primenjenu terapiju za lečenje brojnih bolesti čoveka. Kada je genom čoveka u pitanju, u toku je veliki naučni projekat koji za cilj ima identifikaciju varijacija u broju kopija (eng. Copy Number Variation Project) u genomima 269 nasumično izabranih individua iz svih krajeva sveta (Amerike, Evrope, Kine, Japana, Nigerije, itd,). Cilj ovog projekta je i otkriće uloge CNV u fenomenima odgovornim za ekspresiju genoma. Kao jedno od ključnih pitanja budućih istraživanja izdvaja se pitanje značaja CNV za evoluciju genoma čoveka. Dosadašnja istraživanja ukazuju da CNV po tipu duplikacija koje obuhvataju protein kodirajuće gene u genomu čoveka imaju adaptivini značaj preko efekta povećanja doze gena. 10
11 Ključni koncepti U okviru genomike, razvojem metode komparativne genomske hibridizacije bazirane na genskom čipu (acgh) počela je analiza individualnih razlika u genomima ljudi i ustanovljeno je da se zbog varijacija u broju kopija genomi ljudi međusobno razlikuju preko 12%. Varijacije u broju kopija (CNV) su segmenti molekula DNK veličine od 50bp do 1Mb ili veći koji se u jednom genomu pojavljuje u različitom broju kopija u odnosu na referentni genom. Po svojoj prirodi, CNV mogu biti duplikacije, delecije ili insercije sekvence molekula DNK, ili kompleksniji genetički rearanžmani koji obuhvataju veći broj hromozoma (kompleksne CNV). U CNV ubrajaju se i triplikati koji se po svojoj prirodi dele u triplikate tipa I i tipa II. Varijacije u broju kopija su kvantitativne strukturne varijante genoma. Dosadašnja istraživanja pokazuju da se određene CNV u opštoj populaciji registruju sa frekvencom manjom od 1%, zbog čega se ne ubrajaju u polimorfizam sekvenci molekula DNK. Upravo zbog toga, i pored razlika u genomima pojedinačnih individua koje mogu da obuhvataju i 15% ukupne dužine genoma a nastaju kao posledica CNV, još uvek se na genome ljudi gleda kao na jedinstven genom. U slučaju da CNV po tipu duplikacija obuhvataju gene, ekspresija takvih gena zavisi od toga da li je duplikacija tandemska ili multialelska i da li duplikacija obuhvata i regulatorne regione dupliciranog gena. CNV otkrivene su i u genomima šimpanza, laboratorijskih miševa, kokošaka, rezuzus majmuna, pasa, krava, Arabidopsis thaliana, kukuruza, pivskog kvasca, Drosophila i Caenorhabditis elegans. Mogući molekularni mehanizmi nastanka CNV su: nealelska homologna rekombinacije, nehomologno spajanje krajeva tokom reparacije dvolančanih prekida, reparacija prekida u molekulu DNK mehanizmom FoSTeS ili transpozicija L1 elemenata. Pojedine CNV koje gene za proteine asocirane su sa razvojem psihijatrijskih bolesti, autizma, gojaznosti, psorijaze (bolest kože), šećerne bolesti, zapaljenskih bolesti creva, itd. Poslednjih godina istražuje se i uloga CNV u procesima neoplastične transformacije koji su odogovorni za razvoj karicinoma kolona, pluća i prostate. U toku je veliki naučni projekat koji za cilj ima identifikaciju svih varijacija u broju kopija u genomu čoveka (eng. Copy Number Variation Project). Ciljevi ovog projekta su i ispitivanje uloge CNV u procesima odgovornim za ekspresiju genoma, kao i njihovog značaja za evoluciju genoma čoveka. 11
12 Pitanja 1. Šta su varijacije u broju kopija (CNV)? 2. Zašto se varijacije u broju kopija ne ubarajaju u polimorfizme sekvence molekula DNK? 3. Koje vrste duplikacija se ubrajaju u CNV? 4. Šta je ROMA tehnika, a šta metoda acgh? 5. Koje se molekularno-biološke metode koriste za proveru identifikovanih CNV? 6. Koji su molekularno-biološki mehanizmi odgovorni za nastanak CNV? 7. Kakve efekte CNV mogu imati na ekspresiju gena? 8. Koji je značaj CNV u istraživanjima molekularne osnove bolesti čoveka? 9. Pored genoma čoveka, kod kojih vrsta je detektovana pojava CNV? 10. Koji su ciljevi Projekta Varijacije u broju kopija? 12
13 Literatura 1. Carter NP. Methods and strategies for analyzing copy number variation using DNA microarrays. Nat Genet. 2007; 39(7 Suppl):S Conrad DF, Pinto D, Redon R, Feuk L, Gokcumen O, Zhang Y, Aerts J, Andrews TD, Barnes C, Campbell P, Fitzgerald T, Hu M, Ihm CH, Kristiansson K, Macarthur DG, Macdonald JR, Onyiah I, Pang AW, Robson S, Stirrups K, Valsesia A, Walter K, Wei J; Wellcome Trust Case Control Consortium, Tyler-Smith C, Carter NP, Lee C, Scherer SW, Hurles ME. Origins and functional impact of copy number variation in the human genome. Nature. 2010;464(7289): He Y, Hoskins JM, McLeod HL. Copy number variants in pharmacogenetic genes. Trends Mol Med. 2011;17(5): Iafrate AJ, Feuk L, Rivera MN, Listewnik ML, Donahoe PK, Qi Y, Scherer SW, Lee C. Detection of large-scale variation in the human genome. Nat Genet. 2004; 36(9): Lee C, Scherer SW. The clinical context of copy number variation in the human genome. Expert Rev Mol Med. 2010;12:e8. 6. Li W, Olivier M. Current analysis platforms and methods for detecting copy number variation. Physiol Genomics. 2013;45(1): Perry GH, Tchinda J, McGrath SD, Zhang J, Picker SR, Cáceres AM, Iafrate AJ, Tyler-Smith C, Scherer SW, Eichler EE, Stone AC, Lee C. Hotspots for copy number variation in chimpanzees and humans. Proc Natl Acad Sci U S A. 2006; 103(21): Redon R, Ishikawa S, Fitch KR, Feuk L, Perry GH, Andrews TD, Fiegler H, Shapero MH, Carson AR, Chen W, Cho EK, Dallaire S, Freeman JL, González JR, Gratacòs M, Huang J, Kalaitzopoulos D, Komura D, MacDonald JR, Marshall CR, Mei R, Montgomery L, Nishimura K, Okamura K, Shen F, Somerville MJ, Tchinda J, Valsesia A, Woodwark C, Yang F, Zhang J, Zerjal T, Zhang J, Armengol L, Conrad DF, Estivill X, Tyler-Smith C, Carter NP, Aburatani H, Lee C, Jones KW, Scherer SW, Hurles ME. Global variation in copy number in the human genome. Nature. 2006; 444(7118): Sebat J, Lakshmi B, Troge J, Alexander J, Young J, Lundin P, Månér S, Massa H, Walker M, Chi M, Navin N, Lucito R, Healy J, Hicks J, Ye K, Reiner A, Gilliam TC, Trask B, Patterson N, Zetterberg A, Wigler M. Large-scale copy number polymorphism in the human genome. Science. 2004;305(5683): Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of CNVs in 16,000 cases of eight common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2010; 464(7289):
Informacioni sistemi i baze podataka
Fakultet tehničkih nauka, Novi Sad Predmet: Informacioni sistemi i baze podataka Dr Slavica Kordić Milanka Bjelica Vojislav Đukić Primer radnik({mbr, Ime, Prz, Sef, Plt, God, Pre}, {Mbr}), projekat({spr,
More informationOtkazivanje rada bubrega
Kidney Failure Kidney failure is also called renal failure. With kidney failure, the kidneys cannot get rid of the body s extra fluid and waste. This can happen because of disease or damage from an injury.
More information0.1% variance attributed to scattered single base-pair changes SNPs
April 2003, human genome project completed: 99.9% of genome identical in all humans 0.1% variance attributed to scattered single base-pair changes SNPs It has been long recognized that variation in the
More informationTHE FREQUENCY OF ALLELIC LETHALS AND COMPLEMENTATION MAPS IN NATURAL POPULATIONS OF DROSOPHILA MELANOGASTER FROM MEXICO. Victor M.
UDC 575.2: 595.773.4 Original scientific paper THE FREQUENCY OF ALLELIC LETHALS AND COMPLEMENTATION MAPS IN NATURAL POPULATIONS OF DROSOPHILA MELANOGASTER FROM MEXICO Victor M. SALCEDA Departamento de
More informationKidney Failure. Kidney. Kidney. Ureters. Bladder. Ureters. Vagina. Urethra. Bladder. Urethra. Penis
Kidney Failure Kidney failure is also called renal failure. With kidney failure, the kidneys cannot get rid of the body s extra fluid and waste. This can happen because of disease or damage from an injury.
More informationMinistarstvo unutrašnjih poslova Uprava policije Crne Gore Forenzički centar Grupa za hemijska ispitivanja, Grupa za DNK analize
Dodatak Sertifikatu o akreditaciji - identifikacioni broj: ATCG- 0037 Annex to Accreditation Certificate-Identification : ATCG-0037 Dodatak Sertifikatu o akreditaciji sa akreditacionim brojem Li 14.19
More informationGenomic structural variation
Genomic structural variation Mario Cáceres The new genomic variation DNA sequence differs across individuals much more than researchers had suspected through structural changes A huge amount of structural
More informationPrehrana i prehrambena suplementacija u sportu
Prehrana i prehrambena suplementacija u sportu Pregled istraživanja Damir Sekulić Kreatin monohidrat Ostojić, S. (2004) Creatine supplementation in young soccer players Int J Sport Nutr Exerc Metab. 4(1):95-103.
More informationUloga obiteljskog liječnika u prepoznavanju bolesnika s neuroendokrinim tumorom
Uloga obiteljskog liječnika u prepoznavanju bolesnika s neuroendokrinim tumorom Dr.sc. Davorin Pezerović OB Vinkovci 11.05.2017. For Za uporabu use by Novartisovim speakers predavačima and SAMO appropriate
More informationPHENOTYPIC CONNECTION OF THE MAIN BODY PARTS OF RABBITS AND LAYERS
Biotechnology in Animal Husbandry 27 (2), p 259-263, 2011 ISSN 1450-9156 Publisher: Institute for Animal Husbandry, Belgrade-Zemun UDC 637. 55/636.52 DOI:10.2298/BAH1102259K PHENOTYPIC CONNECTION OF THE
More informationDETEKCIJA I KARAKTERIZACIJA GENOMSKE NESTABILNOSTI TUMORA MOZGA GLIJALNOG POREKLA
UNIVERZITET U BEOGRADU BIOLOŠKI FAKULTET Vedrana Milinković DETEKCIJA I KARAKTERIZACIJA GENOMSKE NESTABILNOSTI TUMORA MOZGA GLIJALNOG POREKLA doktorska disertacija Beograd, 2013 UNIVERSITY OF BELGRADE
More informationDodatak Sertifikatu o akreditaciji sa akreditacionim brojem Li Annex to Accreditation Certificate - Accreditation Number Li 14.
Dodatak Sertifikatu o akreditaciji - identifikacioni broj: ATCG-0037 Issue date of Annex: 27.09.207. Dodatak Sertifikatu o akreditaciji sa akreditacionim brojem Li 4.9 Annex to Accreditation Certificate
More informationSimeonov, A. et al.: Determination of influence and differences in... Sport Science 10 (2017) Suppl 1:
DETERMINATION OF INFLUENCE AND DIFFERENCES IN SPECIFIC PROFESSIONAL SAMPLE OF EXAMINEES Aleksandar Simeonov¹, Zoran Radić¹ and Ratko Pavlović² ¹Faculty of Physical Education, Sport and Health, University
More informationEffect of Arterial Blood Pressure and Renin and Aldosterone Levels in Dogs
UDC 616.12-008.331.1:636.7 577.175.5:636.7 577.15:636.7 original scientific paper Acta Agriculturae Serbica, Vol. XIV, 28 (2009) 59-66 Effect of Arterial Blood Pressure and Renin and Aldosterone Levels
More informationSupplementary note: Comparison of deletion variants identified in this study and four earlier studies
Supplementary note: Comparison of deletion variants identified in this study and four earlier studies Here we compare the results of this study to potentially overlapping results from four earlier studies
More informationINTERRELATIONSHIP BETWEEN THERMAL IMAGING DATA AND DAIRY TRAITS IN RED-AND-WHITE COWS**
Biotechnology in Animal Husbandry 23 (5-6), p 277-282, 2007 ISSN 1450-9156 Publisher: Institute for Animal Husbandry, Belgrade-Zemun UDC 636.234 INTERRELATIONSHIP BETWEEN THERMAL IMAGING DATA AND DAIRY
More informationTHE POTENTIALS AND LIMITATIONS OF STATISTICS AS A SCIENTIFIC METHOD OF INFERENCE *
UDC 311 Biljana Popovi Prirodno-matemati ki fakultet Niš THE POTENTIALS AND LIMITATIONS OF STATISTICS AS A SCIENTIFIC METHOD OF INFERENCE * Rezime Statistics is a scientific method of inference based on
More informationBIO-132 Population Genetics of Human Copy Number Variations:
BIO-132 Population Genetics of Human Copy Number Variations: Models and Simulation of their Evolution Along and Across the Genomes September 16, 2007 Abstract Population genetic models play a significant
More informationAN OVERVIEW OF THE TRENDS OF CARDIOVASCULAR DISEASES IN BIH
Original scientific article DOI: 10.5644/PI2017.168.04 AN OVERVIEW OF THE TRENDS OF CARDIOVASCULAR DISEASES IN BIH Aida Ramić-Čatak Institute for Public Health of the Federation of BiH Corresponding author:
More informationMarija Knezevic 1, Jelena Mladenovic 2, Gordana Kovacevic 3, Slavica Ostojic 3, Jelena Milin Lazovic 1,4, Vedrana Milic Rasic 1,2 1.
Genetip- fenotip korelacija kod spinalne mišićne atrofije (SMA) Marija Knežević 1, Jelena Mladenović 2, Gordana Kovačević 3, Slavica Ostojić 3, Jelena Milin Lazovića 1,4, Vedrana Milić Rašića, 1,2 1 Medicinski
More informationDetection of foot-and-mouth disease virus and identification of serotypes in East Azerbaijan province of Iran
VETERINARSKI ARHIV 76 (5), 413-419, 2006 Detection of foot-and-mouth disease virus and identification of serotypes in East Mehran Alamdari 1,2, Seyed Ali Ghorashi 1 *, Malahat Ahmadi 2, and Reyhaneh Salehi-Tabar
More informationDOI /VETGL N UDC : Nišavić Jakov, Zorić Andrea, Milić Nenad** Ključne reči: PCV2, molekularne metode
PREGLEDNI RAD / REVIEW PAPER DOI 10.2298/VETGL1606249N UDC 636.4.09:616.98-07 PRIMENA MOLEKULARNIH METODA U DIJAGNOSTICI INFEKCIJE SVINJA IZAZVANE SVINJSKIM CIRKOVIRUSOM 2* THE APPLICATION OF MOLECULAR
More informationScience. Webinar Series. CNVs vs SNPs: 16 July, Participating Experts: Understanding Human Structural Variation in Disease
Science Webinar Series CNVs vs SNPs: 16 July, 2008 Understanding Human Structural Variation in Disease Brought to you by the Science/AAAS Business Office Participating Experts: Charles Lee, Ph.D. Harvard
More informationTHE EFFECT OF DIFFERENT ENERGY AND PROTEINS LEVELS IN DIET ON PRODUCTION PARAMETERS OF BROILER CHICKEN FROM TWO GENOTYPES**
Biotechnology in Animal Husbandry 23 (5-6), p 551-557, 2007 ISSN 1450-9156 Publisher: Institute for Animal Husbandry, Belgrade-Zemun UDC 636.084.52 THE EFFECT OF DIFFERENT ENERGY AND PROTEINS LEVELS IN
More informationPopulation Drinking and Gender Gap in Suicide Mortality in Russia
Original paper DOI: 10.20471/dec.2017.53.02.02 Received September 6, 2017, accepted after revision November 2, 2017 Population Drinking and Gender Gap in Suicide Mortality in Russia Yury E. Razvodovsky
More informationSredišnja medicinska knjižnica
Središnja medicinska knjižnica Rinčić, Martina (2014) Molekularna citogenetika nekih neurorazvojnih poremećaja. Doktorska disertacija, Sveučilište u Zagrebu. http://medlib.mef.hr/2177 University of Zagreb
More informationA HARD RAIN'S A-GONNA FALL: TEACHING STATISTICS FOR THE SOCIAL SCIENCES. Tanja Jevremov & Petar Milin University of Novi Sad
A HARD RAIN'S A-GONNA FALL: TEACHING STATISTICS FOR THE SOCIAL SCIENCES Tanja Jevremov & Petar Milin University of Novi Sad Social Science & Stats Prof. Petar Milin Dr Vanja Ković Dr Ljiljana Mihić Dr
More informationEFFECT OF BODY WEIGHT OF GOATS AND LACTATION ORDER ON THE GROWTH RATE OF KIDS IN THE SUCKLING PERIOD
Biotechnology in Animal Husbandry 27 (3), p 1193-1200, 2011 ISSN 1450-9156 Publisher: Institute for Animal Husbandry, Belgrade-Zemun UDC 636.082.4 DOI: 10.2298/BAH1103193Z EFFECT OF BODY WEIGHT OF GOATS
More informationMYSTICAL EXPERIENCE TO MEASURABLE DESCRIPTION: THE RELATIONSHIP BETWEEN SPIRITUALITY AND FLOW IN GOLF UDC :130.1
FACTA UNIVERSITATIS Series: Physical Education and Sport Vol. 12, N o 1, 2014, pp. 1-10 Original research article MYSTICAL EXPERIENCE TO MEASURABLE DESCRIPTION: THE RELATIONSHIP BETWEEN SPIRITUALITY AND
More informationTHE EFFECT OF VARIOUS LEVEL OF SKIPJACK TUNA BONE MEAL (Katsuwonus pelamis L) IN RATION ON BROILER CARCASS TENDERNESS AND ABDOMINAL FAT
Biotechnology in Animal Husbandry 27 (4), p 1727-1731, 2011 ISSN 1450-9156 Publisher: Institute for Animal Husbandry, Belgrade-Zemun UDC 636.087.6 DOI: 10.2298/BAH1104727L THE EFFECT OF VARIOUS LEVEL OF
More informationRaznolikost gena HLA-DRB4 u Hrvatskoj
Sveučilište u Zagrebu Prirodoslovno- matematički fakultet Biološki odsjek Leona Radmanić Raznolikost gena HLA-DRB4 u Hrvatskoj Diplomski rad Zagreb, 2017. Ovaj rad izrađen je u Kliničkoj jedinici za tipizaciju
More informationTHE DIFFERENCES IN AEROBIC CAPACITY OF PHYSICALLY ACTIVE FEMALES IN RELATION TO THEIR AGE UDC :053.2
FACTA UNIVERSITATIS Series: Physical Education and Sport Vol. 10, N o 2, 2012, pp. 81-88 Original empirical article THE DIFFERENCES IN AEROBIC CAPACITY OF PHYSICALLY ACTIVE FEMALES IN RELATION TO THEIR
More informationQUANTITATIVE MORPHOLOGY AS A PROGNOSTIC FACTOR IN FELINE SPONTANEOUS CUTANEOUS SQUAMOUS CELL CARCINOMAS
Research article UDK: 636.8.09:616.428-006.6 DOI: 10.2478/acve-2018-0022 QUANTITATIVE MORPHOLOGY AS A PROGNOSTIC FACTOR IN FELINE SPONTANEOUS CUTANEOUS SQUAMOUS CELL CARCINOMAS SIMEONOV Radostin a * a
More informationCOLOR INFLUENCES IDENTIFICATION OF THE MOVING OBJECTS MORE THAN SHAPE
PSIHOLOGIJA, 2009, Vol. 42 (1), str. 79-93 UDC 159.937.51 DOI :10.2298/PSI0901079V COLOR INFLUENCES IDENTIFICATION OF THE MOVING OBJECTS MORE THAN SHAPE Vesna Vidaković 1 and Sunčica Zdravković Department
More informationZavod za tipizaciju tkiva Klinika za urologiju Klinički bolnički centar Zagreb Kišpatićeva Zagreb
PREGLEDNI RAD REVIEW PAPER Zavod za tipizaciju tkiva Klinika za urologiju Klinički bolnički centar Zagreb Kišpatićeva 12 10000 Zagreb GEN HLA-B27: POLIMORFIZAM, EVOLUCIJA, RASPODJELA I POVEZANOST SA SPONDILOARTROPATIJAMA
More informationPsoriasis vulgaris (PsV) is a common chronic
ORIGINAL ARTICLE Serbian Journal of Dermatology and Venereology 2014; 6 (4): 161-166 Polymorphism rs11465553 in the Interleukin-17F Gene in Serbian Patients with Psoriasis and Healthy Controls Svetlana
More informationINITIAL MODEL OF MEN'S MUSCLE STRUCTURE INDICATORS DEFINED BY THE METHOD OF MULTICHANNEL BIOELECTRICAL IMPEDANCE UDC
FACTA UNIVERSITATIS Series: Physical Education and Sport Vol. 11, N o 1, 2013, pp. 23-33 Original research article INITIAL MODEL OF MEN'S MUSCLE STRUCTURE INDICATORS DEFINED BY THE METHOD OF MULTICHANNEL
More informationBIOMECHANICAL MODEL OF VERTEBRA BASED ON BONE REMODELING
FACTA UNIVERSITATIS Series: Medicine and Biology Vol.11, No 1, 2004, pp. 35-39 UC 617-089.843:616.711]:611.018.4:612.017 BIOMECHANICAL MODEL OF VERTEBRA BASED ON BONE REMODELING Janko D. Jovanović 1, Miomir
More informationPERSONALISED THERAPY OF BREAST CANCER SIGNALLING PATHWAYS AND TARGETED THERAPY OF BREAST CANCER
UDK: 618.19-006-08 L. Beketić-Orešković: Personalised therapy of breast cancer signalling pathways and Review targeted article therapy of breast cancer Received: 5 September 2014 Accepted: 24 September
More informationPublic awareness and perception of clinical trials in Montenegro A
ISSN 2334-9492 (Online) Hospital Pharmacology. 2015; 2(3):317-321 UDC: 616-071(497.16) Public awareness and perception of clinical trials in Montenegro Snežana S. Mugoša 1, Berina I. Kučević 1, Marta S.
More informationCOGNITIVE COMPLEXITY OF PARANOID PATIENTS
FACTA UNIVERSITATIS Series: Medicine and Biology Vol.12, No 2, 2005, pp. 113-117 UC 159.9:616.895.7 COGNITIVE COMPLEXITY OF PARANOID PATIENTS Snežana Manojlović, Julijana Nikolić-Popović Psychiatric Clinic,
More informationČukulin, B.: Differences in test results of the explosive power evaluation of high school Sport Science 8 (2015) 1: 57 62
DIFFERENCES IN TEST RESULTS OF THE EXPLOSIVE POWER EVALUATION OF HIGH SCHOOL STUDENTS THROUGHOUT THE ACADEMIC YEAR Bruno Čukulin High School Vrbovec, Vrbovec, Croatia Original scientific paper Abstract
More informationOPORAVAK VRHUNSKIH SPORTISTA: PREGLED SAVREMENIH METODA
P R E GLEDNI Č L A N A K U D C 7 9 6. 0 1 5. 2 6 : 6 1 2. 7 6 6 OPORAVAK VRHUNSKIH SPORTISTA: PREGLED SAVREMENIH METODA Veljović D, Međedović B, Ostojić SM Departman za sport, Fakultet za sport i turizam,
More informationQUALITY OF LIFE AMONG PATIENTS WITH DEPRESSION KVALITET ŽIVOTA PACIJENATA SA DEPRESIJOM
PROFESSIONAL PAPER STRUČNI RAD PROFESSIONAL PAPER STRUČNI RAD QUALITY OF LIFE AMONG PATIENTS WITH DEPRESSION Sandra Matovic, Slobodan Jankovic Department of Pharmacology and Toxicology, Faculty of Medical
More informationANALIZA POLIMORFIZAMA GENA ZA CD86, CTLA-4, TNF I IL-10 KOD BOLESNIKA SA PEMFIGUSOM U SRBIJI
UNIVERZITET U BEOGRADU MEDICINSKI FAKULTET Srđan D. Tanasilović ANALIZA POLIMORFIZAMA GENA ZA CD86, CTLA-4, TNF I IL-10 KOD BOLESNIKA SA PEMFIGUSOM U SRBIJI Doktorska disertacija Beograd, 2016 UNIVERSITY
More informationBreast Cancer. Breast Tissue
Breast Cancer Cancer cells are abnormal cells. Cancer cells grow and divide more quickly than healthy cells. Some cancer cells may form growths called tumors. All tumors increase in size, but some tumors
More informationENGLESKO NAZIVLJE VEZANO ZA FITNES / ENGLISH FITNESS-RELATED TERMINOLOGY
ENGLESKO NAZIVLJE VEZANO ZA FITNES / ENGLISH FITNESS-RELATED TERMINOLOGY What is the meaning of the term fitness? Random House Webster's Electronic Dictionary and Thesaurus. (1992). fit-ness (fit'nis)
More informationSystematic Analysis for Identification of Genes Impacting Cancers
Systematic Analysis for Identification of Genes Impacting Cancers Arpita Singhal Stanford University Saint Francis High School ABSTRACT Currently, vast amounts of molecular information involving genomic
More informationChallanges in evaluation of coronary artery disease in patients with diabetes
Challanges in evaluation of coronary artery disease in patients with diabetes Branko Beleslin, MD, PhD, FESC, FACC Cardiology Clinic, Clinical centre of Serbia Medical faculty, University of Belgrade Scope
More informationINFLUENCE OF HEARING AGE AND UNDERSTANDING VERBAL INSTRUCTIONS IN CHILDREN WITH COCHLEAR IMPLANTS 2
Specijalna edukacija i rehabilitacija (Beograd), Vol. 12, br. 3. 275-289, 2013. Sanja ĐOKOVIĆ 1 * Selena TODOROVIĆ** University of Belgrade Faculty of Special Education and Rehabilitation* Institute for
More informationNEUROENDOKRINA KONTROLA FIZIOLOŠKIH PROCESA ADENOHIPOFIZA
NEUROENDOKRINA KONTROLA FIZIOLOŠKIH PROCESA ADENOHIPOFIZA ADENOHIPOFIZA Identifikovati tri familije hormona adenohipofize i uočiti glavne strukturne razlike među ovim hormonima Objasniti mehanizme regulacije
More informationIvana D. Damnjanović
Univerzitet u Nišu Medicinski fakultet Ivana D. Damnjanović Uloga i značaj alfa-lipoinske kiseline i nesteroidnih antiinflamatornih lekova u hemoprevenciji i indukciji apoptoze ćelija karcinoma kolona
More informationUTVRĐIVANJE POVEZANOSTI GENSKOG POLIMORFIZMA COMT, TNF-α, TNFR1, IL-1α I IL-10 SA RIZIKOM POJAVE RANE PREEKLAMPSIJE I NJENIH KOMPLIKACIJA
UNIVERZITET U BEOGRADU FARMACEUTSKI FAKULTET Tijana M. Krnjeta UTVRĐIVANJE POVEZANOSTI GENSKOG POLIMORFIZMA COMT, TNF-α, TNFR1, IL-1α I IL-10 SA RIZIKOM POJAVE RANE PREEKLAMPSIJE I NJENIH KOMPLIKACIJA
More informationPrimena fluorescentne in situ hibridizacije u hematologiji
Strana 986 VOJNOSANITETSKI PREGLED Vojnosanit Pregl 2012; 69(11): 986 993. OPŠTI PREGLED UDC: 575::576.3]::616.15-07/-08 DOI: 10.2298/VSP1211986M Primena fluorescentne in situ hibridizacije u hematologiji
More informationTHE AGE AND HOUSING SYSTEM EFFECTS ON THE GROWTH OF BROILERS**
Biotechnology in Animal Husbandry 23 (5-6), p 519-525, 2007 ISSN 1450-9156 Publisher: Institute for Animal Husbandry, Belgrade-Zemun UDC 636.033 THE AGE AND HOUSING SYSTEM EFFECTS ON THE GROWTH OF BROILERS**
More informationZavod za tipizaciju tkiva Klinički zavod za laboratorijsku dijagnostiku Klinički bolnički centar Zagreb Kišpatićeva Zagreb
IZVORNI ZNANSTVENI RAD ORIGINAL SCIENTIFIC PAPER Zavod za tipizaciju tkiva Klinički zavod za laboratorijsku dijagnostiku Klinički bolnički centar Zagreb Kišpatićeva 12 10000 Zagreb HAPLOTIPSKE VEZE DVA
More informationMihajlović, I. and Tončev, I.: Establishment of the foot arch initial status... Sport Science 1 (2008) 2:44 49
ESTABLISHMENT OF THE FOOT ARCH INITIAL STATUS IN PRE-SCHOOL CHILDREN Ilona Mihajlović and Ivan Tončev Faculty of Sport and Physical Education, University of Novi Sad, Serbia Original scientific paper Abstract
More informationOriginalan naučni rad UDK 619: SAVREMENE METODE LABORATORIJSKE DIJAGNOSTIKE U VETERINARSKOJ MEDICINI I MOGUĆNOSTI NJIHOVE PRIMENE
Originalan naučni rad UDK 619:616-017 SAVREMENE METODE LABORATORIJSKE DIJAGNOSTIKE U VETERINARSKOJ MEDICINI I MOGUĆNOSTI NJIHOVE PRIMENE Tamaš Petrović, Maja Velhner, Jelena Petrović, Igor Stojanov, Živoslav
More informationAnaliza ekspresije celokupnog genoma u cilju identifikacije ključnih gena i mikro RNK za nastanak urođenih anomalija bubrega i urinarnog trakta čoveka
UNIVERZITET U BEOGRADU BIOLOŠKI FAKULTET Ivan G. Jovanović Analiza ekspresije celokupnog genoma u cilju identifikacije ključnih gena i mikro RNK za nastanak urođenih anomalija bubrega i urinarnog trakta
More informationLetter. 18: by Cold Spring Harbor Laboratory Press; ISSN /08; Genome Research 1
Letter Analysis of copy number variants and segmental duplications in the human genome: Evidence for a change in the process of formation in recent evolutionary history Philip M. Kim, 1,8 Hugo Y.K. Lam,
More informationUloga B limfocita u razvoju multiple skleroze i eksperimentalnog autoimunskog encefalomijelitisa
UDK: 616.832-004.2-02:612.112 doi:10.5937/pomc10-3867 Uloga B limfocita u razvoju multiple skleroze i eksperimentalnog autoimunskog encefalomijelitisa Role of B cells in the development of multiple sclerosis
More informationFAKULTET VETERINARSKE MEDICINE UNIVERZITETA U BEOGRADU. Doc dr Nenad Andrić, DVM
FVM FAKULTET VETERINARSKE MEDICINE UNIVERZITETA U BEOGRADU EEG Doc dr Nenad Andrić, DVM 2/16 EPILEPSIJA - 0,5% do 5,7% kod pasa - 0,5% do 1% kod mačakaaka - 20-40% epilepsija su refraktarne Berendt M.
More informationUticaj polimorfizama FKBP5 gena, traume u detinjstvu i neuroticizma na rizik od psihotičnog poremećaja
UNIVERZITET U BEOGRADU MEDICINSKI FAKULTET Marina M. Mihaljević Uticaj polimorfizama FKBP5 gena, traume u detinjstvu i neuroticizma na rizik od psihotičnog poremećaja Doktorska disertacija Beograd, 2017
More informationNature Biotechnology: doi: /nbt.1904
Supplementary Information Comparison between assembly-based SV calls and array CGH results Genome-wide array assessment of copy number changes, such as array comparative genomic hybridization (acgh), is
More informationMOLEKULARNI MARKERI HRONIČNE INFLAMACIJE I APOPTOZE KOD INFLAMATORNIH BOLESTI CREVA
UNIVERZITET U BEOGRADU BIOLOŠKI FAKULTET Biljana B. Stanković MOLEKULARNI MARKERI HRONIČNE INFLAMACIJE I APOPTOZE KOD INFLAMATORNIH BOLESTI CREVA doktorska disertacija Beograd, 2015 UNIVERSITY OF BELGRADE
More informationGordana Cvetković*, Goran Plavec*, Ilija Tomić*, Vesna Ilić, Zvonko Magić, Željka Tatomirović, Dobrivoje Novković*, Rade Milić*, Vukojica Karličić*
Volumen 66, Broj 2 VOJNOSANITETSKI PREGLED Strana 149 ORIGINALAN Č L A N A K UDC: 616.24-006.6-085:575.10 Prediktivni značaj mutacija u K-ras onkogenu za hemioterapijske protokole na bazi platine kod bolesnika
More informationCNV Detection and Interpretation in Genomic Data
CNV Detection and Interpretation in Genomic Data Benjamin W. Darbro, M.D., Ph.D. Assistant Professor of Pediatrics Director of the Shivanand R. Patil Cytogenetics and Molecular Laboratory Overview What
More informationANALYSIS OF PSYCHIATRIC HEREDITY IN PATIENTS WITH AGORAPHOBIA AND PANIC DISORDER
ANALYSIS OF PSYCHIATRIC HEREDITY IN PATIENTS WITH AGORAPHOBIA AND PANIC DISORDER Danka Nestorovic 1 Milan Latas 1,2 1 School of Medicine, University of Belgrade, Belgrade, Serbia 2 Clinic for Psychiatry,
More informationPRAĆENJE HIMERIZMA ANALIZOM GENETIĈKIH MARKERA NAKON ALOGENE TRANSPLANTACIJE MATIĈNIH ĆELIJA HEMATOPOEZE KOD DECE OBOLELE OD HEMATOLOŠKIH BOLESTI
UNIVERZITET U BEOGRADU MEDICINSKI FAKULTET Aleksandra Krstić PRAĆENJE HIMERIZMA ANALIZOM GENETIĈKIH MARKERA NAKON ALOGENE TRANSPLANTACIJE MATIĈNIH ĆELIJA HEMATOPOEZE KOD DECE OBOLELE OD HEMATOLOŠKIH BOLESTI
More informationPSYCHOSIS IN ACQUIRED IMMUNE DEFICIENCY SYNDROME: A CASE REPORT
PSYCHOSIS IN ACQUIRED IMMUNE DEFICIENCY SYNDROME: A CASE REPORT Milena Stašević 1 Ivana Stašević Karličić 2,3 Aleksandra Dutina 2,3 UDK: 616.895-02-07 1 Clinic for mental disorders Dr Laza Lazarevic, Belgrade,
More informationGENETIKA AUTOIMUNOSNIH BOLESTI
SVEUČILIŠTE U ZAGREBU PRIRODOSLOVNO-MATEMATIČKI FAKULTET BIOLOŠKI ODSJEK GENETIKA AUTOIMUNOSNIH BOLESTI GENETICS OF AUTOIMMUNE DISEASES SEMINARSKI RAD Maja Fabijanić Preddiplomski studij molekularne biologije
More informationNEARLY TWO DECADES OF QTC DISPERSION IN CARDIOLOGY
FACTA UNIVERSITATIS Series: Medicine and Biology Vol.14, No 3, 2007, pp. 107-111 UC 616.12-073.97 NEARLY TWO DECADES OF QTC DISPERSION IN CARDIOLOGY Dragan Djordjevic, Marina Deljanin Ilic, Ivan Tasic
More informationSTUDY OF THE MORPHOLOGY OF OVARY AND CYTOLOGY OF OOCYTE AS BASIS FOR ESTABLISHING METHODS IVM, IVF AND EMBRYO TRANSFER**
Biotechnology in Animal Husbandry 23 (5-6), p 243-252, 2007 ISSN 1450-9156 Publisher: Institute for Animal Husbandry, Belgrade-Zemun UDC 636.082.453 STUDY OF THE MORPHOLOGY OF OVARY AND CYTOLOGY OF OOCYTE
More informationSUSCEPTIBILITY TO BREAST CANCER AND INTRON 3 INS/DEL GENETIC POLYMORPHISM OF DNA DOUBLE-STRAND BREAK REPAIR GENE XRCC4
J Med Biochem 2015; 34 (4) DOI: 10.2478/jomb-2014-0051 UDK 577. 1 : 61 ISSN 1452-8258 J Med Biochem 34: 409 413, 2015 Original paper Originalni nau~ni rad SUSCEPTIBILITY TO BREAST CANCER AND INTRON 3 INS/DEL
More informationT. Georgieva 1, P. Zorovski 1. Abstract. Introduction. Original scientific paper Originalan naučni rad UDK: (497.2) DOI: 10.
Original scientific paper Originalan naučni rad UDK: 633.13(497.2) DOI: 10.7251/AGREN1301105G The Content of Non-essential Amino Acids in the Grains of Winter and Spring Varieties of Oats (Avena sativa
More informationEVALUATION OF INDOOR BACKGROUND IONIZING RADIATION PROFILE OF A PHYSICS LABORATORY UDC
FACTA UNIVERSITATIS Series: Working and Living Environmental Protection Vol. 3, N o 1, 2006, pp. 1-8 EVALUATION OF INDOOR BACKGROUND IONIZING RADIATION PROFILE OF A PHYSICS LABORATORY UDC 546.296 Yehuwdah
More informationCNV detection. Introduction and detection in NGS data. G. Demidov 1,2. NGSchool2016. Centre for Genomic Regulation. CNV detection. G.
Introduction and detection in NGS data 1,2 1 Genomic and Epigenomic Variation in Disease group, Centre for Genomic Regulation 2 Universitat Pompeu Fabra NGSchool2016 methods: methods Outline methods: methods
More informationODREðIVANJE HAPLOTIPOVA HLA-DRB ANALIZOM MIKROSATELITA D6S2878 U HRVATSKOJ POPULACIJI
Sveučilište u Zagrebu Prirodoslovno matematički fakultet Biološki odsjek Marijana Bašić ODREðIVANJE HAPLOTIPOVA HLA-DRB ANALIZOM MIKROSATELITA D6S2878 U HRVATSKOJ POPULACIJI Diplomski rad Zagreb, 2009.
More informationCOMPLEX FOOTBALL TRAINING S INFLUENCE ON THE QUALITATIVE CHANGES OF THE BASIC MOTOR ABILITIES
COMPLEX FOOTBALL TRAINING S INFLUENCE ON THE QUALITATIVE CHANGES OF THE BASIC MOTOR ABILITIES Eldin Jelešković, Munir Talović, Haris Alić and Izet Bajramović Faculty of sport and physical education, University
More informationUčestalost pojave i molekularna karakterizacija virusa mozaika lubenice poreklom iz Srbije
Pestic. fitomed. (Beograd), 25(3), 2010, 213-230 UDC: 632.38:635.61:58.038 Pestic. Phytomed. (Belgrade), 25(3), 2010, 213-230 Naučni rad * Scientific paper DOI: 10.2298/PIF1003213V Učestalost pojave i
More informationDavor Sporiš, Silvio Bašić, Ivana Šušak, Zrinka Čolak and Ivana Marković
Acta Clin Croat 2013; 52:11-15 Original Scientific Paper Predictive factors for early identification of pharmaco epilepsy Davor Sporiš, Silvio Bašić, Ivana Šušak, Zrinka Čolak and Ivana Marković Department
More informationSTANIČNE LINIJE U ISTRAŽIVANJU MALIGNIH TUMORA CELL LINES IN CANCER RESEARCH SEMINARSKI RAD
SVEUČILIŠTE U ZAGREBU PRIRODOSLOVNO MATEMATIČKI FAKULTET BIOLOŠKI ODSJEK STANIČNE LINIJE U ISTRAŽIVANJU MALIGNIH TUMORA CELL LINES IN CANCER RESEARCH SEMINARSKI RAD Valentina Hribljan Preddiplomski studij
More informationGenome-Wide Analysis of Copy Number Variations in Normal Population Identified by SNP Arrays
54 The Open Biology Journal, 2009, 2, 54-65 Open Access Genome-Wide Analysis of Copy Number Variations in Normal Population Identified by SNP Arrays Jian Wang 1,2, Tsz-Kwong Man 1,3,4, Kwong Kwok Wong
More informationPouzdanost CINtec TM p16 INK4a citološkog imunohistohemijskog testa u skriningu prekanceroznih lezija grlića materice
Volumen 65, Broj 3 VOJNOSANITETSKI PREGLED Strana 211 ORIGINALNI Č L A N C I UDC: 618.146 078.3:618.146 006.6 Pouzdanost CINtec TM p16 INK4a citološkog imunohistohemijskog testa u skriningu prekanceroznih
More informationUDRUŽENOST POLIMORFIZMA GENA TLRs 2,3,4 i CD14 KOD BOLESNIKA SA ORALNIM LIHEN PLANUSOM (OLP).
UNIVERZITET U BEOGRADU STOMATOLOŠKI FAKULTET Dragan M. Stanimirović UDRUŽENOST POLIMORFIZMA GENA TLRs 2,3,4 i CD14 KOD BOLESNIKA SA ORALNIM LIHEN PLANUSOM (OLP). Doktorska disertacija Beograd, 2014 PODACI
More informationZavod za tipizaciju tkiva Klinički zavod za laboratorijsku dijagnostiku Klinički bolnički centar Zagreb Kišpatićeva Zagreb 2
IZVORNI ZNANSTVENI RAD ORIGINAL SCIENTIFIC PAPER 1 Zavod za tipizaciju tkiva Klinički zavod za laboratorijsku dijagnostiku Klinički bolnički centar Zagreb Kišpatićeva 12 10000 Zagreb 2 Klinika za reumatske
More informationthe Intravenous Glucose Bolus
7 Biljana Nedeljković Beleslin 1, Jasmina Ćirić, Miloš Stojanović, Mirjana Stojković, Slavica Savić, Tijana Lalić, Tanja Nišić, Marija Miletić, Miloš Žarković Insulin Pulsatility After the Intravenous
More informationD. Pali, Kedibone Yvonne Modika, Sophia Elisabeth Coetzee, Jovanka Levi, Bojana Koki, Nedeljka Peno
PROTEIN DISPERSIBILITY INDEX AND PROTEIN SOLUBILITY IN POTASSIUM HYDROXID AS INDICATORS OF THE DEGREE OF FULL- FAT SOYBEAN HEAT TREATMENT INDEKS DISPERZIJE BJELAN EVINA I RASTVORLJIVOST BJELAN EVINA U
More informationEKSPRESIJA C-MYC PROTO-ONKOGENA U PREMALIGNIM I MALIGNIM PROMENAMA GRLIĆA MATERICE
Original article Originalni naučni rad UDK 6.146-006.6:575 Medicus 2007; 8(1): 15-19 EXPRESSION OF C-MYC PROTO-ONCOGENE IN PREMALIGNANT AND MALIGNANT UTERINE CERVIX LESIONS Zoran Protrka 1, Slobodanka
More informationA VISUAL BASIC PROGRAM FOR DESIGNING OF GEAR PAIR FOR FRONT POWER TAKE-OFF UNIT OF HIGHER HP TRACTORS
Univerzitet u Beogradu Poljoprivredni fakultet Institut za poljoprivrednu tehniku Naučni časopis POLJOPRIVREDNA TEHNIKA Godina XLII Broj 3, 2017. Strane: 19 28 University of Belgrade Faculty of Agriculture
More informationUTICAJ SELENA NA ZDRAVLJE MLEČNE ŽLEZDE KRAVA
Letopis naučnih radova Godina 35 (2011), broj I, strana 87-91 UDK: 546.23:591.469 Originalni naučni rad Original scientific paper UTICAJ SELENA NA ZDRAVLJE MLEČNE ŽLEZDE KRAVA Ivana Davidov, Stanko Boboš,
More informationCULTURAL COGNITIVE DISSONANCE IN MIGRATION AND ETHNIC INTEGRATION
Borile Simone, PhD UDC 316.7(100) ; 325.1(100) ; 323.1(100) Scuola Superiore Universitaria Originalni naučni rad per Mediatori Linguistici Primljen: 1. 10. 2015. CIELS, Padova Italia Odobren: 15. 11. 2015.
More informationPUBLIC AWARENESS, UNDERSTANDING AND ATTITUDES TOWARDS EPILEPSY IN MONTENEGRO
Acta Clin Croat 2017; 56:399-405 Original Scientific Paper 1020471/acc2017560306 PUBLIC AWARENESS, UNDERSTANDING AND ATTITUDES TOWARDS EPILEPSY IN MONTENEGRO Sanja Vodopić 1,2 and Slavica Vujisić 1,2 1
More informationUloga tipizacije humanog papiloma virusa i citologije u ranom otkrivanju recidiva cervikalne intraepitelne neoplazije
Strana 314 VOJNOSANITETSKI PREGLED Volumen 68, Broj 4 ORIGINALNI Č LANAK UDC: 618.146-006-036.87-07:[616-076.5:578 DOI: 10.2298/VSP1104314Z Uloga tipizacije humanog papiloma virusa i citologije u ranom
More informationMolekularna kariotipizacija nov pristup u kliničkoj i laboratorijskoj genetici
Kratki pregledni članak/mini-review Molekularna kariotipizacija nov pristup u kliničkoj i laboratorijskoj genetici Molecular karyotyping a new approach in clinical and laboratory genetics Luca Lovrečić
More informationZASTUPLJENOST POJEDINIH OKIDAČA KOD OBOLELIH OD GLAVOBOLJE FREQUENCY OF CERTAIN TRIGGERS IN PATIENTS SUFFERING FROM HEADACHES
27 Vol. 41 (2016) br. 1 Originalni rad UDK 616.857 ISSN 0350-2899. - God. 41, br. 1 (2016),str. 27-32. COBISS.SR-ID 222030860 ZASTUPLJENOST POJEDINIH OKIDAČA KOD OBOLELIH OD GLAVOBOLJE FREQUENCY OF CERTAIN
More informationet al.. A homozygous deletion of a normal variation locus in a patient with hearing loss from nonconsanguineous parents
A homozygous deletion of a normal variation locus in a patient with hearing loss from non-consanguineous parents Jeroen Knijnenburg, Saskia a J Lesnik Oberstein, Klemens Frei, Trevor Lucas, Antoinet C
More informationDOI: /AVB P UDK 619: /.07 THE EFFECT OF ORGANIC MILK PRODUCTION ON CERTAIN MILK QUALITY PARAMETERS
Acta Veterinaria (Beograd), Vol. 61, No. 4, 415-421, 2011. DOI: 10.2298/AVB1104415P UDK 619:637.12.04/.07 THE EFFECT OF ORGANIC MILK PRODUCTION ON CERTAIN MILK QUALITY PARAMETERS POPOVI]-VRANJE[ ANKA*,
More informationTHE ROLE OF MAST CELLS IN CARBON TETRACHLORIDE INDUCED RAT SKELETAL MUSCLE TISSUE DAMAGE
Original article UDC: XXXX doi:10.5633/amm.2019.0202 THE ROLE OF MAST CELLS IN CARBON TETRACHLORIDE INDUCED RAT SKELETAL MUSCLE TISSUE DAMAGE Ljubiša M. Lilić 1, Dragan Toskić 1, Rade Ž. Stefanović 1,
More informationumerenog konzumiranja piva.
umerenog konzumiranja piva. Sažeti prikaz aktuelne naučne literature 4 th Četvrto izdanje 2008 Pivo je jedno od najstarijih pića. Ono je u većoj ili manjoj meri dalo pečat svim drevnim civilizacijama,
More information