Ľudský mikrobióm a kolorektálny karcinóm

Size: px
Start display at page:

Download "Ľudský mikrobióm a kolorektálny karcinóm"

Transcription

1 308 Ľudský mikrobióm a kolorektálny karcinóm RNDr. Soňa Čierniková, PhD. 1, Mgr. Nikola Ďuríková 1, doc. MUDr. Michal Mego, PhD. 2, RNDr. Lenka Wachsmannová, PhD. 1, Viola Števurková 1, doc. RNDr. Vladimír Zajac, CSc. 1 1 Ústav experimentálnej onkológie, Biomedicínske centrum SAV, Bratislava 2 II. onkologická klinika LF UK a NOÚ, Bratislava Slovenská republika patrí medzi krajiny s najvyšším výskytom kolorektálneho karcinómu v celosvetovom meradle. Vysoká incidencia a mortalita na nádory kolorekta prinášajú potrebu odhalenia nových možností v prevencii, diagnostike a terapii. V súčasnosti sa do popredia výskumu viacerých pracovísk dostáva štúdium úlohy gastrointestinálnej mikroflóry v etiológii viacerých ochorení vrátane kolorektálneho karcinómu. Črevné komenzálne baktérie poskytujú svojmu hostiteľovi viaceré benefity, hrajú významnú úlohu vo vývine a funkčnosti črevného imunitného systému, sú aktívne zahrnuté do vývoja a maturácie črevnej mukózy, do prevencie proti infekciám vyvolaným patogénnymi baktériami, ako aj v degradácii metabolických produktov. Udržanie mikrobiálnej symbiózy je z pohľadu ľudského zdravia nevyhnutnosťou. Výsledky analýz zameraných na identifikáciu bakteriálneho zastúpenia u zdravých ľudí a pacientov potvrdili, že zmena zloženia a štruktúry črevnej mikroflóry môže viesť k rozvoju kolorektálnych premalignít. Mechanizmy, ktorými mikroorganizmy prispievajú k iniciácii alebo rozvoju ochorenia, zahŕňajú indukciu chronického zápalu; biosyntézu genotoxických látok, ktoré interferujú s regulačnými mechanizmami bunkového cyklu; produkciu toxických metabolitov a aktiváciu karcinogénnych zložiek stravy. Podľa experimentálnych aj klinických štúdií je možné modulovať porušenie rovnováhy v gastrointestinálnom trakte podávaním probiotík a transplantáciou črevnej mikroflóry. Využitie animálnych modelov najnovšie poukázalo aj na schopnosť črevných baktérií zvyšovať imunitnú odpoveď proti nádorovým bunkám. Odhalenie úlohy mikroorganizmov v tumorigenéze je teda dôležité nielen z pohľadu prevencie, ale aj protinádorovej liečby. Kľúčové slová: kolorektálny karcinóm, mikrobióm, dysbióza gastrointestinálnej mikroflóry, probiotiká, prevencia a liečba malignít Human microbiome and colorectal cancer Slovak Republic is among the countries with the highest incidence of colorectal cancer worldwide. The high incidence and colorectal cancer mortality brings the need for discovery of new possibilities in the prevention, diagnosis and therapy. The study of gut microbiota role in etiology of several diseases, including colorectal cancer is now coming to the forefront of research in numerous experimental institutes. Commensal bacteria provide several benefits to its host, playing an important role in the development and function of the intestinal immune system, involving in the development and maturation of the intestinal mucosa, preventing the infections caused by pathogenic bacteria, and degradating the metabolic products. Sustaining of microbial symbiosis is necessary for human health. Analysis of bacterial composition in healthy subjects and patients has confirmed that the change of composition and structure of the intestinal microflora can lead to the development of colorectal pre-malignities. The mechanisms by which organisms contribute to the initiation or development of the disease include the chronic inflammation induction; biosynthesis of genotoxic agents that interfere with cell cycle regulatory mechanisms; toxic metabolites production and activation of carcinogenic dietary components. According to the experimental and clinical studies bacterial dysbiosis can be modulated by administration of probiotics and intestinal microflora transplantation. Animal models revealed the ability of intestinal bacteria to enhance the immune response against tumor cells. Uncovering the role of microorganisms in tumorigenesis is therefore not only important for the prevention, but also for cancer treatment. Key words: colorectal cancer, microbiome, dysbiosis of gut microflora, probiotics, cancer prevention and treatment Onkológia (Bratisl.), 2016; roč. 11(5): Úvod Podľa údajov Národného centra zdravotníckych informácií (NCZI) je kolorektálny karcinóm (KRK) najčastejšia malignita tráviaceho traktu v Slovenskej republike. Posledné známe údaje o výskyte nádorov hrubého čreva a rekta na území SR boli poskytnuté na rok 2009, keď bolo zaznamenaných novodiagnostikovaných prípadov u mužov a u žien (1). V posledných rokoch dosahuje incidencia nádorov kolorekta v SR najvyššie hodnoty aj v kontexte globálneho výskytu (2). V etiológii ochorenia zohrávajú kľúčovú úlohu okrem genetických, najmä environmentálne faktory. Intestinálne baktérie sú v úzkom kontakte s ľudskými epitelovými bunkami, preto je už všeobecne prijímaná myšlienka, že mikroflóra gastrointestinálneho traktu výrazne ovplyvňuje etiológiu KRK. Pokroky v technológiách sekvenovania DNA vytvorili oblasť výskumu nazývanú metagenomika, ktorá umožňuje výskum mikrobiálnych spoločenstiev in situ, čiže bez potreby kultivácie. Tieto prístupy sú založené najmä na sekvenovaní génu pre 16S ribozomálnu RNA, ktorý slúži ako fylogenetický a taxonomický marker na identifikáciu členov mikrobiálnej komunity. Získané údaje ukazujú, že črevná mikroflóra môže byť zložená až zo kmeňov baktérií a v počte génov tento tzv. mikrobióm prevyšuje ľudský genóm až 100-násobne (3). V roku 2008 Národný inštitút zdravia (National institutes of Health NIH) predstavil Projekt ľudského mikrobiómu (Common Fund Human Microbiome Project HMP). Cieľom tejto medzinárodnej štúdie je komplexná charakterizácia ľudského mikrobiómu, aby bolo možné skúmať jeho variácie v súvislosti s populáciou, genotypom, ochoreniami, vekom, výživou a vonkajším prostredím. Inými slovami, ide o snahu vyvinúť referenčnú vzorku sekvencií mikrobiálneho genómu (4).

2 309 Zastúpenie bakteriálnej mikroflóry v tráviacom trakte človeka Ľudská mikroflóra sa začína budovať až po narodení. Okrem spôsobu pôrodu je pre profilovanie mikrobiálnej komunity rozhodujúce aj dojčenie, napriek tomu, že materské mlieko sa dlho považovalo za sterilné. V skutočnosti je však pre dieťa hlavným zdrojom probiotických baktérií zastupujúcich rody Lactobacillus, Enterococcus, a Bifidobacterium. Proces budovania mikroflóry sa ustáli v prvých 2 3 rokoch života. Počas života sa mikrobiálna kompozícia mení, zvyšuje sa diverzita aj početnosť baktérií (obrázok 1) (5). Najväčšiu komplexnosť dosahuje počas dospelosti, pričom niekoľkým stovkám fylotypov dominujú kmene Bacteroidetes a Firmicutes (5). Každý jedinec dosiahne homeostatické štádium zloženia črevnej mikroflóry, ktoré ostáva relatívne stabilné väčšinu dospelosti. Napriek tomu, že kompozícia mikroflóry medzi ľuďmi varíruje na úrovni kmeňov, celkový fylogenetický profil je možné kategorizovať len do limitovaného počtu tzv. enterotypov. Dosiaľ boli identifikované tri hlavné enterotypy, pričom v každom z nich dominujú iné metabolické dráhy (6). Tieto enterotypy sa odlišujú v dominantnom zastúpení jedného z týchto druhov: Bacterioides pre enterotyp 1; Prevotella pre enterotyp 2; Ruminococcus pre enterotyp 3. Získanie určitého enterotypu závisí od dlhodobého štýlu stravovania. Stravovanie založené na príjme živočíšnej stravy bohatej na tuky a bielkoviny dáva za vznik enterotypu 1 a 3. Strava bohatá na karbohydráty zasa vedie k tvorbe enterotypu 2. V neskorších štádiách života sa mikroflóra stáva opäť dynamická a viac homogénna, pričom je charakteristická zvýšenou prítomnosťou kmeňa Proteobacteria a úbytkom bifidobaktérií. Čo sa týka distribúcie mikroflóry v tráviacom trakte, poznáme dva gradienty. V prvom rade sa hustota osídlenia zvyšuje od proximálnej k distálnej časti tráviaceho systému. Zatiaľ čo žalúdok obsahuje 10 1 mikrobiálnych buniek na gram, hrubé črevo až buniek na gram. Zastúpenie baktérií je menšie v tkanive a mukóze čreva, naopak, vysoké zastúpenie je pozorované v lúmene. Pre proximálnu časť sústavy sú typické aeróbne baktérie, ale v distálnych častiach prevažujú anaeróby. Aeróby vytvárajú tzv. scavenger efekt tým, že spotrebovávajú kyslík v reakciách oxidatívnej fosforylácie pri energetickom metabolizme. Aborálnym smerom klesá redoxný potenciál, čo umožňuje rast anaeróbom citlivým na prítomnosť kyslíka. Rozdiely v zastúpení badáme aj v rámci samotného hrubého čreva a sú dôsledkom rôznych metabolických aktivít Obrázok 1. Zastúpenie bakteriálnej mikroflóry v priebehu života (5) v jednotlivých častiach. V slepom čreve a v proximálnej časti hrubého čreva je kyslé ph (5 6) a veľmi intenzívna fermentácia a produkcia mastných kyselín s krátkym reťazcom, pričom je pre tento úsek príznačný rýchly rast baktérií. Naopak, v distálnej časti sa ph hodnota blíži k neutrálnym hodnotám a dochádza k ustáleniu bakteriálnej populácie. Druhý gradient hovorí o diverzite bakteriálnych fylogenetických skupín, pričom diverzita stúpa v súlade s hustotou osídlenia (7). Úloha mikroflóry vo fyziológii čreva Jednou z hlavných funkcií črevnej mikroflóry je fermentácia nestráviteľných zvyškov potravy a hlienu (mucus) tvoreného bunkami epitelu. Nestráviteľné karbohydráty zahŕňajú polysacharidy, ako sú celulóza, hemicelulóza a pektíny; niektoré oligosacharidy, ktoré sa nestihli stráviť, a neabsorbované cukry a alkoholy. Cieľom takejto fermentácie je tvorba mastných kyselín s krátkym reťazcom, ako sú predovšetkým butyrát, acetát a propionát. Väčšina butyrátu je spotrebovaná epitelom hrubého čreva, keďže je hlavným zdrojom energie pre kolonocyty a prekurzor syntézy lipidov sliznice. Acetát a propionát sa nachádzajú v portálnej krvi a sú metabolizované v pečeni (propionát) alebo v periférnych tkanivách, najmä vo svaloch (acetát). Anaeróbny metabolizmus peptidov a proteínov takisto vyúsťuje do tvorby mastných kyselín s krátkym reťazcom, ale produkuje aj potenciálne toxické zlúčeniny, ako sú amíny, amoniak, fenoly, thioly a indoly. Fyziologické kmene E.coli, ale aj iné baktérie, sa môžu podieľať na tvorbe vitamínov B 12, K 1 a K 2. Časté a dlhodobé užívanie antibiotík môže viesť k narušeniu syntézy týchto vitamínov a ich nedostatku (8). Prítomnosť komenzálnych baktérií je dôležitá aj pre všetky obranné systémy. Biologický tlak črevných mikroorganizmov je nevyhnutný na udržiavanie správnej slizničnej bariérovej funkcie. Špecifická obrana proti invazívnym baktériám je udržiavaná kontinuálnym monitorovaním črevného obsahu črevným imunitným systémom (GALT). Tento systém je schopný rozpoznať rozdiely medzi invazívnymi organizmami a neškodnými antigénmi, ako sú proteíny v potrave a komenzálne mikroorganizmy. Okrem nešpecifickej bariérovej funkcie sú črevné bunky schopné rozpoznať zachované mikrobiálne štruktúry pomocou Toll-Like receptorov. Aktivácia týchto receptorov vyúsťuje do zápalovej imunitnej odpovede, a to vďaka lipolysacharidom, ktoré sú súčasťou bunkovej steny grampozitívnych baktérií. Keď baktérie narušia slizničnú líniu enterocytov, sú atakované bunkami vrodeného imunitného systému, ako sú makrofágy a dendritické bunky. Takto je zabezpečená neustála komunikácia medzi črevnými baktériami a GALT (9). Gastrointestinálna mikroflóra v kolorektálnej tumorigenéze Napriek tomu, že črevná mikroflóra sa dlho považovala výlučne za komenzálnu, v súčasnosti sa čoraz viac dáva do pozornosti jej úloha v etiológii viacerých ochorení vrátane KRK (10). Animálne štúdie ukázali, že prítomnosť špecificky pozmenenej črevnej mikroflóry má priamy súvis s vývinom rakoviny hrubého čreva súvisiacej s kolitídou (colitis-associated cancer) (11). Schulz a kol. potvrdili dôležitosť recipročnej interakcie medzi hostiteľom a environmentálnymi faktormi v selekcii mikroflóry zohrávajúcej úlohu

3 310 Obrázok 2. Schéma pôsobenia črevných baktérií v kolorektálnej karcinogenéze (16) v karcinogenéze. Získané údaje naznačujú, že samotná črevná tumorigenéza sprostredkovaná bakteriálnou dysbiózou môže byť prostredníctvom mikroflóry prenosná medzi jedincami s genetickou predispozíciou (12). Charakterizácia fylogenetického zastúpenia mikroorganizmov v čreve, ako aj stolici pacientov s KRK poukázala na výrazné rozdiely v porovnaní so zdravými osobami. Systematický prehľadový článok publikovaný v roku 2015 ukazuje na zvýšenú prítomnosť baktérií, ako sú Fusobacteria, Alistipes, Porphyromonadaceae, Coriobacteridae, Staphylococcaceae, Akkermansia spp. and Methanobacteriales u pacientov s kolorektálnym karcinómom. Naopak, niektoré taxóny sú výrazne redukované, napríklad Bifidobacterium, probiotické druhy menovite Lactobacillus a Ruminococcus, butyrát produkujúce baktérie konkrétne Faecalibacterium spp., Roseburia a Treponema (13). Výsledky tzv. nested case-control štúdie ukazujú na signifikantnú koreláciu medzi vznikom KRK a užívaním antibiotík (penicilíny, cefalosporíny, nitroimidazoly a TMP-SMX) rok pred diagnostikovaním ochorenia. Potlačenie komenzálnej mikroflóry antibiotikami vedie k vážnym problémom s trávením potravy a rozvoju oportunistickej infekcie. Takéto črevné abnormality často vedú k zvýšeniu permeability črevnej steny a úniku proteínov do krvného obehu, kde pôsobia ako antigén. V prípade penicilínov bolo preukázané zvýšené riziko vzniku tohto typu rakoviny aj pri podaní viac ako 10 rokov pred diagnostikovaním, pričom toto riziko stúpalo úmerne s počtom cyklov užívania a intenzitou dávok týchto antibiotík. Keďže vývin nádorov kolorekta trvá v priemere rokov, tieto výsledky sú v súlade s hypotézou, že prítomnosť, resp. neprítomnosť určitých komenzálnych baktérií má priamy vplyv na vznik KRK u ľudí, a teda, že antibiotická liečba by mohla zohrávať úlohu v etiológii kolorektálnej tumorigenézy. Štatisticky signifikantné výsledky boli dosiahnuté len v prípade penicilínov. Výsledky antibiotík, ktoré sa predpisujú v malej miere, nemali dostatočnú štatistickú silu, čo však nevylučuje ich participáciu v iniciácii ochorenia (14). Okrem prác zameriavajúcich sa na identifikáciu korelačných vzťahov, publikácie z posledného obdobia dokazujú kauzálny vzťah medzi črevnou mikroflórou a vznikom, či progresiou KRK. Pri iniciácii nádorového procesu hovoríme o tzv. driver baktériách, ktoré rôznymi mechanizmami prispievajú k poškodzovaniu DNA črevných epitelových buniek. Druhy ako Bacteroides, Shigella, Citrobacter, Salmonella E.coli sú prítomné v nadbytku najmä v skorých štádiách KRK vrátane adenómov a vymiznú z kancerózneho tkaniva s progresiou nádoru. Po naštartovaní procesu tumorigenézy dochádza k zmenám prostredia v čreve, čoho výsledkom je nadmerný rast oportunistických baktérií tzv. passenger baktérií a pokles v počte driver baktérií. Passenger baktérie podporujú rozvoj nádoru, ale sú aj súčasťou zdravej mikroflóry, i keď v minimálnom množstve. Vznikom nádorového mikroprostredia dochádza k ich zvýhodneniu a premnoženiu (15). Mechanizmy iniciácie a propagácie KRK črevnými baktériami Mechanizmy, ktorými črevné mikroorganizmy prispievajú k iniciácii alebo rozvoju KRK, zahŕňajú indukciu chronického zápalu; biosyntézu genotoxických látok, ktoré interferujú s regulačnými mechanizmami bunkového cyklu; produkciu toxických metabolitov a aktiváciou karcinogénnych zložiek stravy (obrázok 2) (16). Chronický zápal je asociovaný so zvýšeným rizikom vzniku kolorektálnych malignít, a to pomocou indukcie mutácií, inhibíciou apoptózy alebo stimuláciou angiogenézy a proliferácie buniek črevného epitelu. K vzniku chronického zápalu dochádza vďaka nerovnováhe v zastúpení črevnej mikroflóry, čo pomáha zvyšovaniu permeability mukózy, translokácii baktérií a aktivácii systémov vrodenej a získanej imunity. Aktivácia mechanizmov vrodenej imunity vedie k nadmernému uvoľňovaniu prozápalových cytokínov ako IL-12, IL-23, TNF-α a INF-γ s následnou aktiváciou buniek vrodeného imunitného systému (T- aj B-lymfocytov) a rôznych zápalových mediátorov. Jedným z hlavných dôsledkov takejto zápalovej odpovede je aktivácia transkripčných faktorov špecifických kľúčových signálnych dráh ako NF- κb a STAT3 v epitelových bunkách čreva (17). Chronický zápal takisto dáva za vznik reaktívnym formám kyslíka a dusíka, čo vedie k oxidatívnemu stresu, poškodeniu DNA, nadmernej proliferácii, až napokon k tvorbe kolorektálnych adenómov a karcinómov. Zápalové procesy však môžu byť suprimované pomocou IL-10 derivovaného z T a T regulačných lymfocytov. Enterotoxické Bacteroides fragilis patria medzi driver baktérie vďaka genotoxickému efektu ich toxínu na epitelové bunky čreva. Tento toxín stimuluje uvoľnovanie buniek epitelu (z angl. shedding) vďaka štiepeniu E-kadherínu, čím sa do cytoplazmy uvoľní dovtedy viazaný β-katenín a dochádza k aktivácii Wnt signálnej dráhy. Okrem narušenia črevnej bariéry poškodením medzibunkových adherentných spojení sa teda spustí aj nadmerná proliferácia. Toxín Bacteroides fragilis navyše aktivuje NF- κb, čoho výsledkom je uvoľňovanie cytokínov podieľajúcich sa na zápalovej odpovedi mukózy čreva. Napriek tomu, že toxín Bacteroides fragilis je považovaný za toxín, ktorý sa na vzniku KRK podieľa v najvyššej miere, súčasné štúdie ukazujú, že toxíny, ktoré sú najviac transkribované v nádorových tkanivách pacientov, produkujú baktérie E.coli, Salmonella enterica a Shigella flexneri (18). Niektoré komenzálne kmene E.coli sú schopné produkovať kolibaktín (z angl. colibactin), ktorý spôsobuje dvojvláknové zlomy DNA v kolonocytoch. Mechanizmy systému opráv zlyhávajú v oprave týchto lézií, čo má za následok akumuláciu chromozomálnych abnormalít, a teda aj mutácií vedúcich k tumorigenéze.

4 312 Okrem toxínov môžu byť do procesov vzniku nádorov hrubého čreva a rekta zapojené aj produkty fermentácie proteínov. V prípade, že dochádza k zvýšenému príjmu proteínov stravou, v hrubom čreve vzniká nadbytok sulfidov, nitrátov, amínov, amoniaku a aminokyselín s rozvetveným reťazcom (19). Tieto produkty fermentácie proteínov môžu stimulovať rast sulfát redukujúcich baktérií ako Deltaproteobacteria a Firmicutes. Práve produkcia sulfánu môže navodiť poškodenie črevnej sliznice a spôsobiť závažné poškodenie DNA v ľudských bunkách. Črevná mikroflóra zohráva dôležitú úlohu aj v metabolizme žlčových kyselín. Sekundárne žlčové kyseliny sa považujú za genotoxické a podporujúce procesy tumorigenézy. Kyselina deoxycholová poškodzuje mukózu črevného traktu, podieľa sa na zvyšovaní oxidačného stresu, poškodzovaní DNA a podporuje rast nádorov (20). Modulácia črevnej mikroflóry Experimentálne aj klinické štúdie dokázali, že porušenie rovnováhy v gastrointestinálnom trakte je možné modulovať účinkom probiotík. V bežne dostupných probiotikách sú najčastejšie zastúpené bakteriálne rody Lactobacillus a Bifidobacterium a indikáciou na ich podávanie je napr. rotavírusová infekcia, rádioterapia, chemoterapia a antibiotická liečba (21). Probiotické baktérie produkujú antimikrobiálne látky, ako sú bakteriocíny, kyselina mliečna, reuterín, peroxid vodíka a dekonjugované žlčové kyseliny, vďaka ktorým sú schopné inhibovať patogénne baktérie. Niektoré probiotické baktérie môžu súperiť s patogénmi o nutrienty alebo adherovať na bunky črevného epitelu a fyzicky tak blokovať adherovanie patogénov. V našich štúdiách sme potvrdili, že probiotické baktérie E. faecium M-74 by mohli vytesniť patogénne baktérie u pacientov s familiárnou adenomatóznou polypózou (22). Vplyvom kombinácie probiotika a prebiotika na kolorektálny karcinóm sa zaoberala štúdia SYNKAN. Prebiotiká sú selektívne fermentované zložky potravy (inulín a trans-galakto-oligosacharidy), ktoré umožňujú špecifické zmeny aktivity, ako aj kompozície črevnej mikroflóry, pričom tieto zmeny pôsobia pozitívne na zdravie konzumenta. Súčasťou projektu SYNKAN bola: a) in vitro štúdia zameraná na selekciu najvhodnejšieho synbiotického preparátu, b) in vivo štúdia zameraná na aplikáciu najvhodnejšieho preparátu potkanom s chemicky indukovaným KRK, c) intervenčná klinická štúdia zameraná na účinky preparátu na ľudí. Výsledky projektu preukázali, že podávanie Lactobacillus rhamnosus a Bifidobacterium animalis ssp. Lactis BB-12 v kombinácii s inulínom a oligofruktózou viedlo k výraznému zníženiu výskytu rakoviny hrubého čreva, k zvýšeniu produkcie butyrátu, k zníženiu poškodenia DNA a aj k stimulácii imunitného systému prostredníctvom NK buniek a zvýšených hladín IL-10 produkovaných v Peyerových plakoch (23). Účinnosť a bezpečnosť probiotického kmeňa E. faecium M74 u neutropenických pacientov so solídnymi a hematologickými malignitami sa hodnotila v dvoch malých klinických štúdiách. Výsledky poukázali na bezpečnosť podávaného probiotického kmeňa, no jeho účinnosť v prevencii febrilnej neutropénie u leukemických pacientov nebola preukázaná (24, 25). Najnovšia štúdia na súbore pacientov s kolorektálnym karcinómom liečených chemoterapiou s irinotecanom potvrdila bezpečnosť aplikácie probiotík onkologickým pacientom a poukázala na zníženie výskytu a závažnosti gastrointestinálnej toxicity podávanej liečby (26). Na riešenie závažných dysbióz však probiotiká nespĺňajú kvantitatívne požiadavky. Jedna orálna dávka probiotík obsahuje väčšinou 3- až 4-násobne nižší počet mikroorganizmov ako hrubé črevo. Tento počet baktérií sa ešte prestupom cez tráviaci trakt výrazne redukuje. Navyše, ex vivo kultiváciou môže pri baktériách dôjsť k strate adaptácií na prostredie čreva. Z týchto dôvodov je v súčasnosti veľká snaha o zavedenie tzv. transplantácie črevnej mikroflóry do klinickej praxe. Prenos vzorky črevnej mikroflóry zo zdravého donora na založenie stabilnej mikrobiálnej komunity predstavuje sľubný liečebný proces mnohých ochorení vrátane chronických zápalových ochorení čreva (27). Záver Človek existuje vo vzájomnej symbióze s mikroorganizmami, ktoré kolonizujú kožu a slizničné epitelové tkanivá. Udržanie mikrobiálnej symbiózy je z pohľadu ľudského zdravia nevyhnutnosťou. Komplex interakcií medzi hostiteľom a gastrointestinálnou mikroflórou sa v súčasnosti dostáva do popredia výskumu viacerých pracovísk. Hoci črevná mikroflóra môže potenciovať a podporovať chronický zápal a tumorigenézu, niektoré údaje z myšacích modelov poukázali na schopnosť črevných baktérií redukovať poškodenie indukované chemicky a zmierniť zápalové reakcie, ktoré vedú k vzniku nádorov v hrubom čreve (28). Navyše, mikroflóra dokáže zvyšovať imunitnú odpoveď proti nádorovým bunkám mobilizovaním buniek imunitného systému, a to nielen v čreve, ale aj v rámci celého tela. Preto je odhalenie úlohy mikroorganizmov v tumorigenéze dôležité nielen z pohľadu prevencie, ale aj protinádorovej liečby. Štúdie na zvieratách liečených prostredníctvom imunoterapie poukázali na prvotné zmenšenie nádorovej masy, ktoré bolo zastavené eradikáciou črevnej mikroflóry podaním antibiotík (29). Podobné pozorovania zníženej odpovede na protinádorovú liečbu po podaní antibiotík sa preukázali aj v skupine zvierat liečených cyklofosfamidom (30). Ak by sa tieto výsledky potvrdili aj u ľudí, je možné, že by sa prítomnosť, resp. neprítomnosť určitých druhov črevných baktérií mohla brať do úvahy pri výbere vhodnej nádorovej terapie. Navyše, v prípade stanovenia bakteriálnych druhov zodpovedných za naštartovanie imunitného systému a zlepšenej odpovede na podávanú liečbu sa otvára možnosť modulácie mikroorganizmov v prospech vylepšenia účinkov terapie. Poďakovanie Práca a experimenty boli podporené grantmi vedeckej grantovej agentúry VEGA 2/0170/13 a 2/0096/11 a grantom Agentúry pre podporu výskumu a vývoja APPV Literatúra 1. Diba ChS. (ed.) Incidencia zhubných nádorov v Slovenskej republike Národné centrum zdravotníckych informácií. Národný onkologický register SR ISBN Holmes D. A disease of growth. Nature. 2015;521(7551):S2 S3. 3. Mai V, Draganov PV. Recent advances and remaining gaps in our knowledge of assotiations between gut microbiota and human health. J Gastroenterol. 2009;15(1): Peterson J, NIH HMP Working Group, et al. Genome Res. 2009;19(12): Ottman N, Smidt H, de Vos WM, et al. The function of our microbiota: who is out there and what do they do? Front Cell Infect Microbiol. 2012;2: Hollister EB, Gao C, Versalovic J. Compositional and functional features of the gastrointestinal microbiome and their effects on human health. Gastroenterology. 2014;146(6): Sekirov I, Russell SL, Antunes LC, et al. Gut microbiota in health and disease. Physiol. Rev. 2010;90(3): Zbořil V. a kolektív. Mikroflóra trávicího traktu. Praha: Grada Publishing Macpherson A, Uhr T. Induction of protective IgA by intestinal dendritic cells carrying commensal bacteria. Science. 2004;303(5664): Ciernikova S, Mego M, Hainova K, et al. Modification of microflora imbalance: future directions for prevention and treatment of colorectal cancer? Neoplasma. 2015;62(3): Klimesova K, Kverka M, Zakostelska Z, et al. Altered gut microbiota promotes colitis-associated cancer in IL-1 receptor-associated kinase M-deficient mice. Inflamm Bowel Dis. 2013;19(6): Schulz MD, Atay C, Heringer J, et al. High-fat-diet-mediated dysbiosis promotes intestinal carcinogenesis independently of obesity. Nature. 2014;514(7523):

5 Borges-Canha M, Portela-Cidade JP, Dinis-Ribeiro M, et al. Role of colonic microbiota in colorectal carcinogenesis: a systematic review. Rev Esp Enferm Dig. 2015;107(11): Nobel YR, Cox LM, Kirigin FF, et al. Metabolic and metagenomic outcomes from early-life pulsed antibiotic treatment. Nat Commun. 2015;6: Tjalsma H, Boleij A, Marchesi JR, et al. A bacterial driver passenger model for colorectal cancer: beyond the usual suspects. Nature Reviews Microbiology. 2012;10: Nistal E, Fernández-Fernández N, Vivas S, et al. Factors Determining Colorectal Cancer: The Role of the Intestinal Microbiota. Front Oncol. 2015;5: Keku TO, Dulal S, Deveaux A, et al. The gastrointestinal microbiota and colorectal cancer. American Journal of Physiology - Gastrointestinal and Liver Physiology. 2015;308(5):G351 G Schwabe RF, Wang TC. Bacteria deliver a genotoxic hit. Science. 2012;338: Nyangale EP, Mottram DS, Gibson GR. Gut microbial activity, implications for health and disease: the potential role of metabolite analysis. J Proteome Res. 2012;11(12): Rubin DC, Shaker A, Levin MS. Chronic intestinal inflammation: inflammatory bowel disease and colitis-associated colon cancer. Front Immunol. 2012;3: Mego M, Holec V, Drgona L, et al. Probiotic bacteria in cancer patients undergoing chemotherapy and radiation therapy. Complement Ther Med. 2013;21(6): Mego M, Májek J, Konceková R, et al. Intramucosal bacteria in colon cancer and their elimination by probiotic strain Enterococcus faecium M-74 with organic selenium. Folia Microbiol. 2005;50(5): Van Loo J, Clune Y, Bennett M, Collins JK. The SYN- CAN project: goals, set-up, first results and settings of the human intervention study. Br J Nutr. 2005;93 Suppl1:S91 S Mego M, Ebringer L, Drgona L, et al. Prevention of febrile neutropenia in cancer patients by probiotic strain Enterococcus faecium M -74. Pilot study phase I. Neoplasma. 2005;52: Mego M, Koncekova R, Mikuskova E, et al. Prevention of febrile neutropenia in cancer patients by probiotic strain Enterococcus faecium M-74. Phase II study. Support Care Cancer. 2006;14: Mego M, Chovanec J, Vochyanova-Andrezalova I, et al. Prevention of irinotecan induced diarrhea by probiotics: a randomized double blind, placebo controlled pilot study. Complement Ther Med. 2015;23(3): Borody TJ, Khoruts A. Fecal microbiota transplantation and emerging applications. Nature reviews gastroenterology and hepatology. 2012;9: Zhan Y, Chen PJ, Sadler WD, et al. Gut microbiota protects against gastrointestinal tumorigenesis caused by epithelial injury. Cancer Res. 2013;73(24): Iida N, Dzutsev A, Stewart CA, et al: Commensal bacteria control cancer response to therapy by modulating the tumor microenvironment. Science. 2013;342(6161): Viaud S, Saccheri F, Mignot G, et al: The intestinal microbiota modulates the anticancer immune effects of cyclophosphamide. Science. 2013;342(6161): RNDr. Soňa Čierniková, PhD. Oddelenie genetiky Ústav experimentálnej onkológie BMC SAV Dúbravská cesta 9, Bratislava sona.ciernikova@savba.sk

Možnosti uplatnenia probiotík v onkológii

Možnosti uplatnenia probiotík v onkológii 224 Možnosti uplatnenia probiotík v onkológii MUDr. Vladimír Holec 1, 2, MUDr. Agáta Holecová 1, doc. RNDr. Vladimír Zajac, CSc. 2, 4, prof. MUDr. Ľudovít Danihel, PhD. 2, Mgr. Zuzana Adamčíková 4, doc.

More information

GUT MICROBIOME WHAT IS IT? WHY IS IT IMPORTANT FOR HUMAN HEALTH?

GUT MICROBIOME WHAT IS IT? WHY IS IT IMPORTANT FOR HUMAN HEALTH? GUT MICROBIOME WHAT IS IT? WHY IS IT IMPORTANT FOR HUMAN HEALTH? Corrie Whisner, PhD School of Nutrition and Health Promotion Arizona State University Center for Research on Ingredient Safety Annual Meeting

More information

Gut Lung Axis Implication of the Gut Microbiota beyond its niche

Gut Lung Axis Implication of the Gut Microbiota beyond its niche Gut Lung Axis Implication of the Gut Microbiota beyond its niche Reema Subramanian PhD Candidate (4 th year) Supervisor: Prof. Margaret Ip Department of Microbiology, CUHK Joint Graduate Student Seminar

More information

Diagnostika a liečba relabovaného a refraktérneho DLBCL

Diagnostika a liečba relabovaného a refraktérneho DLBCL Diagnostika a liečba relabovaného a refraktérneho DLBCL Miriam Ladická Národný onkologický ústav Vysoká účinnosť Akceptovateľná Liečba ochorenia toxicita Minimálne neskoré NÚ cca 1/3 pacientov s DLBCL

More information

Probiotiká ako prevencia pri vzniku hnačky pri liečbe irinotekanom cytostatikum, dvojito zaslepená štúdia - klinická fáza III.

Probiotiká ako prevencia pri vzniku hnačky pri liečbe irinotekanom cytostatikum, dvojito zaslepená štúdia - klinická fáza III. Probiotiká ako prevencia pri vzniku hnačky pri liečbe irinotekanom cytostatikum, dvojito zaslepená štúdia - klinická fáza III. Mego M, Chovanec J, Vochyánová-Andrezálová I, Konkolovský P, Mikulová M, Recková

More information

Gut Microbiota and IBD. Vahedi. H M.D Associate Professor of Medicine DDRI

Gut Microbiota and IBD. Vahedi. H M.D Associate Professor of Medicine DDRI Gut Microbiota and IBD Vahedi. H M.D Associate Professor of Medicine DDRI 1393.3.1 2 GUT MICROBIOTA 100 Trillion Microbes - 10 times more than cells in our body Collective weight of about 1kg in human

More information

Faecalibacterium prausnitzii

Faecalibacterium prausnitzii Faecalibacterium prausnitzii is an anti-inflammatory commensal bacterium identified by gut microbiota analysis of Crohn disease patients PNAS 105(43): 16731-16736, 2008. Speaker: Ming-Cheng Chen Advisor:

More information

Microbiome as Predictor of Benefit and Toxicity in Cancer Immunotherapy

Microbiome as Predictor of Benefit and Toxicity in Cancer Immunotherapy Microbiome as Predictor of Benefit and Toxicity in Cancer Immunotherapy Giuliana Magri, Ph.D Optimizing Immunotherapy New Approaches, Biomarkers, Sequences and Combinations PRBB Auditorium, Barcelona October

More information

The effect of probiotics on animal health: a focus on host s natural intestinal defenses

The effect of probiotics on animal health: a focus on host s natural intestinal defenses The effect of probiotics on animal health: a focus on host s natural intestinal defenses Guillaume Tabouret Animal Health Dept. Joint Unit 1225 Host Pathogens Interactions History of probiotics and definition

More information

Microbiome GI Disorders

Microbiome GI Disorders Microbiome GI Disorders Prof. Ram Dickman Neurogastroenterology Unit Rabin Medical Center Israel 1 Key Points Our gut microbiota Were to find them? Symbiosis or Why do we need them? Dysbiosis or when things

More information

The role of gut microbiome in IBS

The role of gut microbiome in IBS The role of gut microbiome in IBS Chung Owyang, MD H. Marvin Pollard Professor of Internal Medicine Professor of Molecular and Integrative Physiology Chief, Division of Gastroenterology Director, Pollard

More information

The Gut Microbiome: 101 Justin Carlson University of Minnesota

The Gut Microbiome: 101 Justin Carlson University of Minnesota The Gut Microbiome: 101 Justin Carlson University of Minnesota Where are we now? 360 B.C. 2003 Human Gut Microbes Associated With Obesity Ley et al., Nature. 2006. Consumer Driven Science For Better of

More information

Bibliografia Microbiota

Bibliografia Microbiota Bibliografia Microbiota Systematic Review: Gut Microbiota in Fecal Samples and Detection of Colorectal Neoplasms. The role of the intestinal microbiome in ocular inflammatory disease. The gut microbiome

More information

Understanding probiotics and health

Understanding probiotics and health Understanding probiotics and health Gemma Laws MSc Student Microbiology and Immunology Department The gut microbiota The name given to the total microbial population living in our intestine Bacteria, fungi,

More information

Recent Patterns in Stomach Cancer Descriptive Epidemiology in the Slovak Republic with Reference to International Comparisons

Recent Patterns in Stomach Cancer Descriptive Epidemiology in the Slovak Republic with Reference to International Comparisons ORIGINAL ARTICLE Recent Patterns in Stomach Cancer Descriptive Epidemiology in the Slovak Republic with Reference to International Comparisons Aktuálne charakteristiky deskriptívnej epidemiológie nádorov

More information

SIMPOSIO Il microbiota intestinale e la sua modulazione nelle patologie dell asse intestino cervello. Microbiota e IBS.

SIMPOSIO Il microbiota intestinale e la sua modulazione nelle patologie dell asse intestino cervello. Microbiota e IBS. SIMPOSIO Il microbiota intestinale e la sua modulazione nelle patologie dell asse intestino cervello Microbiota e IBS Cesare Cremon Policlinico S. Orsola Malpighi Azienda Ospedaliero - Universitaria di

More information

Mechanizmy vzniku rezistencie a možnosti zlepšenia odpovedi na hormonálnu liečbu u pacientok s pokročilým karcinómom prsníka

Mechanizmy vzniku rezistencie a možnosti zlepšenia odpovedi na hormonálnu liečbu u pacientok s pokročilým karcinómom prsníka Karcinóm prsníka patrí medzi najčastejšie malígne ochorenia u žien. 70 % nádorov prsníka exprimuje hormonálne receptory (HR), 1 ktoré sú považované za hlavný prediktívny faktor odpovede na hormonálnu liečbu.

More information

Onkologický pacient a riziko vzniku venózneho tromboembolizmu (VTE) MUDr. Viliam Bugáň

Onkologický pacient a riziko vzniku venózneho tromboembolizmu (VTE) MUDr. Viliam Bugáň Onkologický pacient a riziko vzniku venózneho tromboembolizmu (VTE) MUDr. Viliam Bugáň V EU v nasledujúcich 30 minútach: 3 4 5 31 V dôsledku VTE zomrie v EU viac ako 2-násobok súčtu obetí: dopravných nehôd,

More information

Role of colonic microbiota in colorectal carcinogenesis: A systematic review

Role of colonic microbiota in colorectal carcinogenesis: A systematic review 1130-0108/2015/107/11/659-671 Revista Española de Enfermedades Digestivas Copyright 2015 Arán Ediciones, S. L. Rev Esp Enferm Dig (Madrid) Vol. 107, N.º 11, pp. 659-671, 2015 ORIGINAL PAPERS Role of colonic

More information

The role of nutrition in optimum gastrointestinal health

The role of nutrition in optimum gastrointestinal health The role of nutrition in optimum gastrointestinal health Kelly A. Tappenden, Ph.D., R.D., FASPEN Kraft Foods Human Nutrition Endowed Professor University Distinguished Teacher-Scholar University of Illinois

More information

SLOVENSKÁ POĽNOHOSPODÁRSKA UNIVERZITA V NITRE FAKULTA AGROBIOLÓGIE A POTRAVINOVÝCH ZDROJOV VPLYV PROBIOTÍK A PREBIOTÍK NA IMUNITNÝ SYSTÉM

SLOVENSKÁ POĽNOHOSPODÁRSKA UNIVERZITA V NITRE FAKULTA AGROBIOLÓGIE A POTRAVINOVÝCH ZDROJOV VPLYV PROBIOTÍK A PREBIOTÍK NA IMUNITNÝ SYSTÉM SLOVENSKÁ POĽNOHOSPODÁRSKA UNIVERZITA V NITRE FAKULTA AGROBIOLÓGIE A POTRAVINOVÝCH ZDROJOV 1131297 VPLYV PROBIOTÍK A PREBIOTÍK NA IMUNITNÝ SYSTÉM 2011 Mária Hrašková SLOVENSKÁ POĽNOHOSPODÁRSKA UNIVERZITA

More information

4/17/2019 DISCLOSURES OBJECTIVES GI MICROBIOME & HEALTH: A REVIEW. Nancy C. Kois, MD, FCAP Contemporary Pathology Services. There are no disclosures

4/17/2019 DISCLOSURES OBJECTIVES GI MICROBIOME & HEALTH: A REVIEW. Nancy C. Kois, MD, FCAP Contemporary Pathology Services. There are no disclosures GI MICROBIOME & HEALTH: A REVIEW Nancy C. Kois, MD, FCAP Contemporary Pathology Services DISCLOSURES There are no disclosures OBJECTIVES Definitions: GI microbiota, GI microbiome, probiotic, prebiotic

More information

Increasing barrier function with multispecies probiotics

Increasing barrier function with multispecies probiotics Increasing barrier function with multispecies probiotics Elsbeth Pekelharing, MSc Science Liaison We strive for the most effective microbiome management solutions with our evidence-based & indication-specific

More information

The enteric microbiota: Implications for IBD. Eugene B. Chang, M.D. University of Chicago

The enteric microbiota: Implications for IBD. Eugene B. Chang, M.D. University of Chicago The enteric microbiota: Implications for IBD Eugene B. Chang, M.D. University of Chicago On a per cell basis, humans are mostly prokaryote 100 90 80 70 60 50 40 30 20 10 0 EuK ProK The microbial flora

More information

Intestinal Microbiota in Health and Disease

Intestinal Microbiota in Health and Disease Intestinal Microbiota in Health and Disease February 27, 2015 Master s Course in Gastroenterology Prof. Kathy McCoy 1 Overview Overview of Gut Microbiota Microbiota in Health Microbiota in Disease 2 Gut

More information

Názov vysokej školy, názov fakulty: Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach Lekárska fakulta

Názov vysokej školy, názov fakulty: Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach Lekárska fakulta INFORMAČNÉ LISTY PREDMETOV Názov vysokej školy, názov fakulty: Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach Študijný program: Psychiatria Garantuje: prof.mudr.cyril Höschl,DrSc. Zabezpečuje: MUDr. Eva

More information

The Gut Microbiota: Evidence For Gut Microbes as Contributors to Weight Gain

The Gut Microbiota: Evidence For Gut Microbes as Contributors to Weight Gain The Gut Microbiota: Evidence For Gut Microbes as Contributors to Weight Gain Michael T. Bailey, Ph.D. Center for Microbial Pathogenesis The Research Institute, Nationwide Children s Hospital Department

More information

Examining the effects of pre and probiotics on gut microbiota during the ageing process

Examining the effects of pre and probiotics on gut microbiota during the ageing process Session: Reviewing key ingredients shaping nutrition for healthy ageing Tuesday 22 nd November 2016 Examining the effects of pre and probiotics on gut microbiota during the ageing process Louise R Wilson

More information

Gut Microbiome Essentials

Gut Microbiome Essentials CORE COMPONENTS I: Gut Microbiome Essentials 2016 Tom Fabian, PhD Module Outline 1. Microbiome overview: getting a sense of the microbiome, research, what we know 2. Bacteria: features, functions, communities

More information

Prehľad potenciálnych onkomarkerov detekcie skorých fáz rakoviny vaječníkov

Prehľad potenciálnych onkomarkerov detekcie skorých fáz rakoviny vaječníkov PŘEHLED Prehľad potenciálnych onkomarkerov detekcie skorých fáz rakoviny vaječníkov Overview of Potential Oncomarkers for Detection of Early Stages of Ovarian Cancer Urban P. 1, Bilecová-Rabajdová M. 1,

More information

2/3/2011. Adhesion of Bifidobacterium lactis HN019 to human intestinal

2/3/2011. Adhesion of Bifidobacterium lactis HN019 to human intestinal PROBIOTICS LEARNING THE WHY AND WHEN PROBIOTICS DEFINITION live micro-organisms organisms that are beneficial to the host organism WHO: Live organisms which, when administered in adequate amounts, confer

More information

BUTYRATE PRODUCING BACTERIA AS PROBIOTIC TREATMENT IN IBD

BUTYRATE PRODUCING BACTERIA AS PROBIOTIC TREATMENT IN IBD INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON IBD RESEARCH FUNDED BY PATIENTS' ORGANISATIONS BUTYRATE PRODUCING BACTERIA AS PROBIOTIC TREATMENT IN IBD Annelies Geirnaert Laboratory of Microbial Ecology and Technology (LabMET),

More information

Diet, Microbiome and Health Cindy D. Davis

Diet, Microbiome and Health Cindy D. Davis Diet, Microbiome and Health Cindy D. Davis davisci@mail.nih.gov OFFICE OF DIETARY SUPPLEMENTS 1 Outline 1.What is the microbiome? 2.How does it vary over the lifespan? 3.What is the evidence that diet

More information

Role of the Gut Microbiota in Autoimmunity

Role of the Gut Microbiota in Autoimmunity Role of the Gut Microbiota in Autoimmunity Pavan Bhargava, MD - Neuroimmunology Fellow Division of Neuroimmunology and Neurological Infections Johns Hopkins University, Baltimore, MD. May, 2015 None Disclosures

More information

HOW THE MICROBIOME AFFECTS OUR HEALTH

HOW THE MICROBIOME AFFECTS OUR HEALTH HOW THE MICROBIOME AFFECTS OUR HEALTH THE INTESTINAL BARRIER AND INTESTINAL PERMEABILITY Intestinal Barrier: a functional body Defense from translocation of dietary antigens, bacteria or bacterial endotoxins

More information

Dysbiosis & Inflammation

Dysbiosis & Inflammation MASTERING THE MICROBIOME: Dysbiosis & Inflammation 2017 Tom Fabian, PhD It is reasonable to propose that the composition of the microbiome and its activities are involved in most, if not all, of the biological

More information

Erlotinib v 1. línii liečby nemalobunkového pľúcneho karcinómu

Erlotinib v 1. línii liečby nemalobunkového pľúcneho karcinómu Erlotinib v 1. línii liečby nemalobunkového pľúcneho karcinómu MUDr. Peter Kasan Oddelenie klinickej onkológie KPaF I SZU a UN, Bratislava Ružinov Súhrn Kasan P. Erlotinib v 1. línii liečby nemalobunkového

More information

The Potential For Microbiome Modification In Critical Illness. Deborah Cook

The Potential For Microbiome Modification In Critical Illness. Deborah Cook The Potential For Microbiome Modification In Critical Illness Deborah Cook To review Objectives The microbiome & concepts about its modification during critical illness Interventions Predisposition to

More information

Antioxidanty a ich úloha pri prevencii a liečbe rakoviny

Antioxidanty a ich úloha pri prevencii a liečbe rakoviny 22 Klinická farmácia Antioxidanty a ich úloha pri prevencii a liečbe rakoviny MUDr. Peter Minárik, PhD. 1, 2, doc. MVDr. Tatiana Kimáková, PhD. 3 1 Ústav zdravotníckych disciplín, Vysoká škola zdravotníctva

More information

Nové znenie informácií o lieku výňatky z odporúčaní výboru PRAC týkajúcich sa signálov

Nové znenie informácií o lieku výňatky z odporúčaní výboru PRAC týkajúcich sa signálov 25 January 2018 EMA/PRAC/35594/2018 Corr 1 Pharmacovigilance Risk Assessment Committee (PRAC) Nové znenie informácií o lieku výňatky z odporúčaní výboru PRAC týkajúcich sa signálov Prijaté na zasadnutí

More information

Slide 1. Slide 2 Learning outcomes. Slide 3. Year 1 MBChB Lecture 15 Introduction to the Gut Microbiota. The importance of microbiota

Slide 1. Slide 2 Learning outcomes. Slide 3. Year 1 MBChB Lecture 15 Introduction to the Gut Microbiota. The importance of microbiota Slide 1 Year 1 MBChB Lecture 15 Introduction to the Gut Microbiota Professor Barry Campbell Gastroenterology Research Unit Cellular & Molecular Physiology, Institute of Translational Medicine bjcampbl@liv.ac.uk

More information

Vývoj imunitného systému detí a možnosti jeho ovplyvnenia

Vývoj imunitného systému detí a možnosti jeho ovplyvnenia Vývoj imunitného systému detí a možnosti jeho ovplyvnenia Zuzana Rennerová 1, Zuzana Abaffyová 2, Miloš Jeseňák 3 1 Pneumo-alergo centrum, člen skupiny Falck, Bratislava 2 Imuline, Bratislava 3 Klinika

More information

Antibiotic Resistance and Probiotics - A Metagenomic Viewpoint

Antibiotic Resistance and Probiotics - A Metagenomic Viewpoint Antibiotic Resistance and Probiotics - A Metagenomic Viewpoint Neerja Hajela, PhD General Manager-Science & Regulatory Affairs Yakult Danone India Pvt. Ltd. Outline of the Presentation Global Epidemiology

More information

The role of intestinal microbiota in metabolic disease-a novel therapeutic target.

The role of intestinal microbiota in metabolic disease-a novel therapeutic target. Michael Connolly Department of Food Biosciences, The University of Reading The role of intestinal microbiota in metabolic disease-a novel therapeutic target. University of Reading 2008 www.reading.ac.uk

More information

9/18/2018. The Physiological Roles of the Intestinal Microbiota. Learning Objectives

9/18/2018. The Physiological Roles of the Intestinal Microbiota. Learning Objectives The Physiological Roles of the Intestinal Microbiota Kelly A. Tappenden, Ph.D., R.D., FASPEN Professor and Head, Kinesiology and Nutrition University Distinguished Teacher-Scholar University of Illinois

More information

!Microbiology Profile, stool

!Microbiology Profile, stool LAB #: F000000-0000-0 PATIENT: Sample Patient ID: P12345 SEX: Female AGE: 37 CLIENT #: 12345 DOCTOR: Doctor's Data, Inc. 3755 Illinois Ave. St. Charles, IL 60174!Microbiology Profile, stool BACTERIOLOGY

More information

Overview of the Microbiome in Health and Disease Cindy D. Davis

Overview of the Microbiome in Health and Disease Cindy D. Davis Overview of the Microbiome in Health and Disease Cindy D. Davis davisci@mail.nih.gov OFFICE OF DIETARY SUPPLEMENTS 1 Outline 1.What is the microbiome? 2.What is the evidence that diet can influence the

More information

GROUP 5. Jerrold R. Turner Nathalie Delzenne Wenke Feng Reuben Wong Thierry Piche Yehuda Ringel Irina Kirpich Brant Johnson

GROUP 5. Jerrold R. Turner Nathalie Delzenne Wenke Feng Reuben Wong Thierry Piche Yehuda Ringel Irina Kirpich Brant Johnson GROUP 5 Jerrold R. Turner Nathalie Delzenne Wenke Feng Reuben Wong Thierry Piche Yehuda Ringel Irina Kirpich Brant Johnson Todd Klaenhammer Eamonn Quigley A. The Intestinal Epithelial Cell Barrier B. IEC

More information

UNIVERZITA VETERINÁRSKEHO LEKÁRSTVA A FARMÁCIE V KOŠICIACH

UNIVERZITA VETERINÁRSKEHO LEKÁRSTVA A FARMÁCIE V KOŠICIACH UNIVERZITA VETERINÁRSKEHO LEKÁRSTVA A FARMÁCIE V KOŠICIACH Vplyv koordinačných zlúčenín zinku s farmakologicky účinnými ligandmi na rast probiotických laktobacilov a patogénnych baktérií DIPLOMOVÁ PRÁCA

More information

The impact of the microbiome on brain and cognitive development

The impact of the microbiome on brain and cognitive development The Gut-Brain Axis The impact of the microbiome on brain and cognitive development Diane Stadler, PhD, RD Oregon Health & Sciences University, Portland, Oregon Lao-American Nutrition Institute With acknowledgements

More information

potravinárstvo IMPORTANCE OF PREBIOTIC AND PROBIOTIC: THE ROLE OF GALACTOOLIGOSACHARIDES AS PREBIOTIC ADDITIVES: A REVIEW

potravinárstvo IMPORTANCE OF PREBIOTIC AND PROBIOTIC: THE ROLE OF GALACTOOLIGOSACHARIDES AS PREBIOTIC ADDITIVES: A REVIEW Potravinarstvo, vol. 7, 2013, no. 1, p. 28-35 doi:10.5219/251 Received: 4 January 2013. Accepted: 12 February 2013. Available online: 28 February 2013 at www.potravinarstvo.com 2013 Potravinarstvo. All

More information

The Microbiome & the Effect on Health

The Microbiome & the Effect on Health The Microbiome & the Effect on Health Dr. Wendy Abraham Naturopathic Physician Microbial genes outnumber our genes 100-150:1 No 2 people share the same microbial make-up genes encode proteins proteins

More information

Microbioma intestinale e carcinogenesi Maria Rosalia Pasca

Microbioma intestinale e carcinogenesi Maria Rosalia Pasca Microbioma intestinale e carcinogenesi Maria Rosalia Pasca Workshop Genetica e neoplasie del colon-retto: il ruolo delle analisi molecolari all interno del programma di screening 10 Novembre 2016, Grand

More information

Formulations and Availability 900 BILLION 5,319 HIGH POTENCY PROBIOTIC PEDIATRIC ADULT GERIATRIC PROVEN BY RESEARCH. HIGH-POTENCY. NO SHORTCUTS.

Formulations and Availability 900 BILLION 5,319 HIGH POTENCY PROBIOTIC PEDIATRIC ADULT GERIATRIC PROVEN BY RESEARCH. HIGH-POTENCY. NO SHORTCUTS. Formulations and Availability S TU D I E S PE R D I S E A S E 39 LIVER Liver Disease, Cirrhosis, Liver Failure, Hepatic Encephalopathy S TU D I E S PE R AG E G RO U P Visbiome Regular Product Code: 693-0412-01

More information

The number of microorganisms residing in our intestines is 10 times the number of our somatic and germ cells.

The number of microorganisms residing in our intestines is 10 times the number of our somatic and germ cells. The number of microorganisms residing in our intestines is 10 times the number of our somatic and germ cells. The number of microorganisms residing in our intestines is 10 times the number of our somatic

More information

general meeting 1 20 October 2016

general meeting 1 20 October 2016 general meeting 1 20 October 2016 introductions today s topics the human microbiome about the study the human microbiome the human microbiome human microbiota: the microorganisms that live within and on

More information

2200 GI Effects Comprehensive Profile Stool Interpretation At-a-Glance

2200 GI Effects Comprehensive Profile Stool Interpretation At-a-Glance P: 1300 688 522 E: info@nutripath.com.au A: PO Box 442 Ashburton VIC 3142 TEST PATIENT Sample Test Name Sex : F Date Collected : 00-00-0000 111 TEST ROAD TEST SUBURB LAB ID: 00000000 UR#:0000000 TEST PHYSICIAN

More information

PROBIONA. PROBIOTICS with 5 bacterial strains. Suitable during and after the use of antibiotics to restore intestinal microflora.

PROBIONA. PROBIOTICS with 5 bacterial strains. Suitable during and after the use of antibiotics to restore intestinal microflora. PROBIONA Probiotic supplement for adults PROBIOTICS with 5 bacterial strains Suitable during and after the use of antibiotics to restore intestinal microflora. 2.850 billion cfu per capsule guaranteed

More information

Current Concepts in VAP: Stress Ulcer Prophylaxis & Probiotics. Deborah Cook

Current Concepts in VAP: Stress Ulcer Prophylaxis & Probiotics. Deborah Cook Current Concepts in VAP: Stress Ulcer Prophylaxis & Probiotics Deborah Cook Objectives VAP The Old: Gastropulmonary route of infection The New: Microbiome modification Role of acid suppression Influence

More information

Microbiome and Asthma

Microbiome and Asthma 제 12 차천식연구회 COPD 연구회공동심포지엄 Microbiome and Asthma 한양대학교병원호흡기알레르기내과 김상헌 Disclosure 내용 1 Lung Microbiome 2 Lung Microbiome and Asthma 3 Gut Microbiome and Asthma Microbiome and Microbiota human microbiome

More information

Fecal Microbiota Transplantation for Severe sepsis and Diarrhea : a Case Report

Fecal Microbiota Transplantation for Severe sepsis and Diarrhea : a Case Report Fecal Microbiota Transplantation for Severe sepsis and Diarrhea : a Case Report Qiurong Li Institute of General Surgery, Jinling Hospital Nanjing Univeristy Gut Microbiota 100 trillion cells 10-fold of

More information

Differential responses of human colonic ILCs to gut commensal bacteria altered during HIV infection

Differential responses of human colonic ILCs to gut commensal bacteria altered during HIV infection Differential responses of human colonic ILCs to gut commensal bacteria altered during HIV infection Moriah J. Castleman, Ph.D. Laboratory of Dr. Cara Wilson University of Colorado Anschutz Medical Campus

More information

The human microbiome and how it affects heath. Nafisa M. Jadavji, PhD

The human microbiome and how it affects heath. Nafisa M. Jadavji, PhD The human microbiome and how it affects heath Nafisa M. Jadavji, PhD NafisaJadavji@cunet.carleton.ca Lecture Outline Housekeeping Introduction Research Initiatives to Understand Microbiome Microbiota Development

More information

7/30/2018. Nutricia North America 1. Learning Objectives

7/30/2018. Nutricia North America 1. Learning Objectives Probiotics, Prebiotics and the Role of the Infant Intestinal Microbiota in Health and Allergic Disease Kelly Tappenden, Ph.D, R.D. Kelly Tappenden, Ph.D, R.D. Professor and Department Head Department of

More information

Bringing Synbiotic Interventions in Cancer to Practice: from bench to bedside The UC Davis Foods for Health Institute

Bringing Synbiotic Interventions in Cancer to Practice: from bench to bedside The UC Davis Foods for Health Institute Bringing Synbiotic Interventions in Cancer to Practice: from bench to bedside The UC Davis Foods for Health Institute Jennifer T. Smilowitz, PhD Associate Director, Human Studies Research jensm@ucdavis.edu

More information

HMP is lead by NIH but is an International Consortium.

HMP is lead by NIH but is an International Consortium. Human Microbiome The Human Microbiome Project was one of the spin offs of the Human Genome Project. The HMP project started in 2007 with the overall goal of Characterizing the Human Microbiome and determine

More information

Diet and the Human Gut Microbiome: Whose diet is it anyway?

Diet and the Human Gut Microbiome: Whose diet is it anyway? Soy Nutrition Institute Meeting Minneapolis, MN August 23-24, 2018 Diet and the Human Gut Microbiome: Whose diet is it anyway? Johanna W. Lampe, PhD, RD Public Health Sciences Division Fred Hutchinson

More information

Prevention and Therapy of Antibiotic Associated Diarrhea (ADD) through Probiotics

Prevention and Therapy of Antibiotic Associated Diarrhea (ADD) through Probiotics Prevention and Therapy of Antibiotic Associated Diarrhea (ADD) through Probiotics DGMIM, 15.-16.10.2010 16.10.2010 Stuttgart Prof. Rémy Meier, MD GI-Department University Hospital Liestal, Switzerland

More information

Microbial Adaptations of the Microbiome. Damian R. Plichta, PhD Director of Bioinformatics

Microbial Adaptations of the Microbiome. Damian R. Plichta, PhD Director of Bioinformatics Microbial Adaptations of the Microbiome Damian R. Plichta, PhD Director of Bioinformatics Tailored shotgun metagenomics Microbiome model for biomarker discovery microbiome incoming species conditional

More information

Il microbiota come mediatore dell interazione tra l uomo e le sostanze che ingerisce

Il microbiota come mediatore dell interazione tra l uomo e le sostanze che ingerisce Cosmofarma(BO), 06.05.2017 Il microbiota come mediatore dell interazione tra l uomo e le sostanze che ingerisce Marina Elli, PhD Multifactorial determinants shaping human microbiome (Blandino et al. 2016)

More information

Probiotics: Their Role in Medicine Today. Objectives. Probiotics: What Are They? 11/3/2017

Probiotics: Their Role in Medicine Today. Objectives. Probiotics: What Are They? 11/3/2017 Probiotics: Their Role in Medicine Today Viki Barr Pharm.D., BCPS AQ ID Assistant Professor, Pharmacy Practice Rosalind Franklin University of Medicine and Science Clinical Pharmacist, Infectious Diseases

More information

Microbiome in You: Optimizing Gut Bacteria for Better IBD Management

Microbiome in You: Optimizing Gut Bacteria for Better IBD Management Microbiome in You: Optimizing Gut Bacteria for Better IBD Management KT Park, M.D., M.S. Assistant Professor Co-Director, Stanford Children s Inflammatory Bowel Disease Center Stanford University School

More information

Molekulárne markery cielenej liečby u vybraných onkologických malignít

Molekulárne markery cielenej liečby u vybraných onkologických malignít 64 Molekulárne markery cielenej liečby u vybraných onkologických malignít RNDr. Katarína Hlinková Oddelenie klinickej onkológie, Národný onkologický ústav, Bratislava Získanie znalostí v oblasti patogenézy

More information

Molecular Analysis of the Intestinal Microflora in IBD. Gerald W. Tannock

Molecular Analysis of the Intestinal Microflora in IBD. Gerald W. Tannock Molecular Analysis of the Intestinal Microflora in IBD Gerald W. Tannock Department of Microbiology & Immunology, University of Otago, Dunedin, New Zealand Commensalism The uncultured bacterial world is

More information

Exploration of the microbiota in inflammatory diseases. Matthew Stoll MD Research Computing Day September 13, 2012

Exploration of the microbiota in inflammatory diseases. Matthew Stoll MD Research Computing Day September 13, 2012 Exploration of the microbiota in inflammatory diseases Matthew Stoll MD Research Computing Day September 13, 2012 We re surrounded by bugs Human body contains 100 trillion microbes Out-number human cells

More information

Kombinácie selektované s dôrazom na indikácie

Kombinácie selektované s dôrazom na indikácie Probiotiká Dophilus Probiotiká Mliečne baktérie obsahujú podľa prof. L. Ebringera enzýmy, ktoré sú viazané na bunkovú stenu a niekoľko peptidáz, ktoré štiepia zložky potravín na peptidy s rôznymi účinkami.

More information

Probiotics, Prebiotics and the Role of the Infant Intestinal Microbiota in Health and Allergic Disease. Kelly Tappenden, Ph.D, R.D.

Probiotics, Prebiotics and the Role of the Infant Intestinal Microbiota in Health and Allergic Disease. Kelly Tappenden, Ph.D, R.D. Probiotics, Prebiotics and the Role of the Infant Intestinal Microbiota in Health and Allergic Disease Kelly Tappenden, Ph.D, R.D. Kelly Tappenden, Ph.D, R.D. Professor and Department Head Department of

More information

Effects of probiotics in the treatment of alcoholic hepatitis: randomized controlled multicenter study

Effects of probiotics in the treatment of alcoholic hepatitis: randomized controlled multicenter study Effects of probiotics in the treatment of alcoholic hepatitis: randomized controlled multicenter study Lactobacillus subtilis/streptococcus faecium Lactobacillus rhamnosus R0011/acidophilus R0052 Ki Tae

More information

Il microbiota intestinale: come regola la riserva e la spesa energetica? Gerardo Nardone.

Il microbiota intestinale: come regola la riserva e la spesa energetica? Gerardo Nardone. Il microbiota intestinale: come regola la riserva e la spesa energetica? Gerardo Nardone nardone@unina.it Department of Medicine and Surgery Gastroenterology Unit University Federico II, of Naples, Italy

More information

2/13/2018. What s bugging you? Relevance of the Human Microbiome in Health and Disease Heidi H. Kong, MD, MHSc, FAAD Dermatology Branch

2/13/2018. What s bugging you? Relevance of the Human Microbiome in Health and Disease Heidi H. Kong, MD, MHSc, FAAD Dermatology Branch What s bugging you? Relevance of the Human Microbiome in Health and Disease Heidi H. Kong, MD, MHSc, FAAD Dermatology Branch DISCLOSURE OF RELATIONSHIPS WITH INDUSTRY Heidi H Kong, MD, MHSc, FAAD U017:

More information

Ján Števlík V. interná klinika, FNsP, Bratislava, pracovisko Ružinov

Ján Števlík V. interná klinika, FNsP, Bratislava, pracovisko Ružinov KLIMAKTÉRIUM A KARDIOVASKULÁRNY SYSTÉM Ján Števlík V. interná klinika, FNsP, Bratislava, pracovisko Ružinov Predĺženie života žien v ostatnom storočí znamená významné predĺženie podielu života po menopauze.

More information

Probiotics: Targeting obesity

Probiotics: Targeting obesity Probiotics: Targeting obesity Azadeh Nadjarzadeh, PhD in Nutrition Nutrition and Food Security Research Centre, Shahid Sadoughi University of Medical Sciences, Yazd, Iran azadehnajarzadeh@gmail.com Among

More information

A CENTRAL ROLE FOR MICROBIOTA IN PREGNANCY AND EARLY LIFE? Sacha Sidani, MD, FRCPC NASOM/GÉMOQ Annual Conference 2016

A CENTRAL ROLE FOR MICROBIOTA IN PREGNANCY AND EARLY LIFE? Sacha Sidani, MD, FRCPC NASOM/GÉMOQ Annual Conference 2016 A CENTRAL ROLE FOR MICROBIOTA IN PREGNANCY AND EARLY LIFE? Sacha Sidani, MD, FRCPC NASOM/GÉMOQ Annual Conference 2016 Disclosure 2 Objectives Review the basic concepts of microbiota structure and function

More information

Inflammation is Essential for Microbial-Induced Carcinogenic Properties in the Intestine

Inflammation is Essential for Microbial-Induced Carcinogenic Properties in the Intestine Inflammation is Essential for Microbial-Induced Carcinogenic Properties in the Intestine Department of Medicine and Department of Infectious Diseases & Pathology University of Florida, Gainesville Microbiome:

More information

Consistent and Reproducible Production of a Microbiota-based Drug for Recurrent C. difficile

Consistent and Reproducible Production of a Microbiota-based Drug for Recurrent C. difficile Consistent and Reproducible Production of a Microbiota-based Drug for Recurrent C. difficile Infection: Application of a Novel Diagnostic for Dysbiosis Courtney Jones, BS Rebiotix Inc. Roseville, MN USA

More information

PREBIOTIC MECHANISMS OF ACTION

PREBIOTIC MECHANISMS OF ACTION PREBIOTIC MECHANISMS OF ACTION Seema Hooda, Kelly S. Swanson, George C. Fahey, Jr. Department t of Animal Sciences Division of Nutritional Sciences University of Illinois at Urbana-Champaign Institute

More information

Research and development new symbiotic product and its clinical effect

Research and development new symbiotic product and its clinical effect Research and development new symbiotic product and its clinical effect Almagul Kushugulova, DMSc, akushugulova@nu.edu.kz Center for Life Sciences, Nazarbayev University, Astana, Kazakhstan First stage:

More information

Issues at Hand. Inflammatory Bowel Disease Paradigm. Diet changes the fecal microbiome. Experience with diet in IBD

Issues at Hand. Inflammatory Bowel Disease Paradigm. Diet changes the fecal microbiome. Experience with diet in IBD Diet s Role in IBD David Suskind M.D. Professor of Pediatrics Director of Clinical Gastroenterology Division of Gastroenterology University of Washington Seattle Children s Hospital Issues at Hand Inflammatory

More information

HLAVNÍ TÉMA. Peter Rohoň 1, Daniela Žáčková 2 1. Hemato-onkologická klinika FN a LF UP v Olomouci 2

HLAVNÍ TÉMA. Peter Rohoň 1, Daniela Žáčková 2 1. Hemato-onkologická klinika FN a LF UP v Olomouci 2 CHRONICKÁ MYELOCYTOVÁ LEUKÉMIA OD MOLEKULOVEJ PATOGENÉZY K CIELENEJ LIEČBE Peter Rohoň 1, Daniela Žáčková 2 1 Hemato-onkologická klinika FN a LF UP v Olomouci 2 Interní hematoonkologická klinika FN a LF

More information

Analysis of the effect of probiotics on shaping human gut microbiota

Analysis of the effect of probiotics on shaping human gut microbiota Analysis of the effect of probiotics on shaping human gut microbiota Masahira HATTORI Center for Omics and Bioinformatics, The University of Tokyo http://www.cb.k.u-tokyo.ac.jp/hattorilab

More information

VITAMINS, MINERALS AND THE GUT

VITAMINS, MINERALS AND THE GUT VITAMINS, MINERALS AND THE GUT Nutrients Looking at individual nutrients that are involved with gut health can be misleading This is not about taking individual nutrients It supports more a whole food

More information

2/2009 LEKÁRNICI ODPORÚČAJÚ 2009 ANKETA. časopis pre odborníkov lekární NOVÉ POZNATKY V OBLASTI PROBIOTÍK FARMACEUTICKÉ DESATORO O PROBIOTIKÁCH

2/2009 LEKÁRNICI ODPORÚČAJÚ 2009 ANKETA. časopis pre odborníkov lekární NOVÉ POZNATKY V OBLASTI PROBIOTÍK FARMACEUTICKÉ DESATORO O PROBIOTIKÁCH 2/2009 časopis pre odborníkov lekární NOVÉ POZNATKY V OBLASTI PROBIOTÍK FARMACEUTICKÉ DESATORO O PROBIOTIKÁCH PROBIOTIKÁ A PREVENCIA ALERGIE U DETÍ PROBIOTIKÁ ICH TERAPEUTICKÉ A PREVENTÍVNE VYUŽITIE PROBIOTICKÉ

More information

More than a gut feeling: How the microbiota improves health

More than a gut feeling: How the microbiota improves health More than a gut feeling: How the microbiota improves health Amanda Ramer-Tait, PhD Harold and Esther Edgerton Assistant Professor of Immunology and Microbiology Department of Food Science, University of

More information

Myalgic encephalomyelitis: A highly prevalent debilitating disease

Myalgic encephalomyelitis: A highly prevalent debilitating disease Myalgic encephalomyelitis: A highly prevalent debilitating disease Persistent, debilitating fatigue associated with numerous physical and neurocognitive symptoms Disease severity can range from moderate

More information

השפעת חיידקים פרוביוטיים

השפעת חיידקים פרוביוטיים השפעת חיידקים פרוביוטיים החיים בחלל )המעי(... על רון שאול יחידת גסטרו ילדים מרכז רפואי רמב"ם Introduction The intestinal microflora primarily in the large bowel consists mostly on benign bacterial species

More information

Probiotics for Primary Prevention of Clostridium difficile Infection

Probiotics for Primary Prevention of Clostridium difficile Infection Probiotics for Primary Prevention of Clostridium difficile Infection Objectives Review risk factors for Clostridium difficile infection (CDI) Describe guideline recommendations for CDI prevention Discuss

More information

PROBIOTICS: WHO S WHO AND WHAT S WHAT IN THE GUT PROBIOTICS: WHAT ARE THEY, AND HOW DO THEY WORK? Karen Jensen, (Retired ND)

PROBIOTICS: WHO S WHO AND WHAT S WHAT IN THE GUT PROBIOTICS: WHAT ARE THEY, AND HOW DO THEY WORK? Karen Jensen, (Retired ND) PROBIOTICS: WHO S WHO AND WHAT S WHAT IN THE GUT Karen Jensen, (Retired ND) Today many people are aware of the benefits of maintaining a healthy gut. As a result, probiotic use is becoming ever more popular.

More information

Human intestinal microbiology and probiotics

Human intestinal microbiology and probiotics Human intestinal microbiology and probiotics Michiel Kleerebezem Wageningen Centre for Food Sciences Wageningen University NIZO food research P.O. Box 20 6710 BA Ede The Netherlands phone: +31-(0)318-659629

More information

INTESTINAL MICROBIOTA EXAMPLES OF INDIVIDUAL ANALYSES

INTESTINAL MICROBIOTA EXAMPLES OF INDIVIDUAL ANALYSES EXAMPLES OF INDIVIDUAL ANALYSES INTESTINAL MICROBIOTA Microbiota in the animal or human intestine has evolved together with the host. Consequently, the gastrointestinal tract could be considered a metacommunity,

More information

Welke rol speelt het microbioom bij malaborptie? - Microbiome and malabsorption -

Welke rol speelt het microbioom bij malaborptie? - Microbiome and malabsorption - Welke rol speelt het microbioom bij malaborptie? - Microbiome and malabsorption - Daisy Jonkers Division Gastroenterology-Hepatology Maastricht University Medical Center+ 20 april 2017 d.jonkers@maastrichtuniversity.nl

More information