Správa o činnosti VÚ SAV za rok Virologický ústav Slovenskej akadémie vied

Transcription

1 Virologický ústav Slovenskej akadémie vied Správa o činnosti VÚ SAV za rok 2013

2 Obsah osnovy Správy o činnosti organizácie SAV za rok ) Základné údaje o organizácii 2) Vedecká činnosť 3) Doktorandské štúdium, iná pedagogická činnosť a budovanie ľudských zdrojov pre vedu a techniku 4) Medzinárodná vedecká spolupráca 5) Vedná politika 6) Spolupráca s VŠ a inými subjektmi v oblasti vedy a techniky 7) Spolupráca s aplikačnou a hospodárskou sférou 8) Aktivity pre Národnú radu SR, vládu SR, ústredné orgány štátnej správy SR a iné organizácie 9) Vedecko-organizačné a popularizačné aktivity 10) Činnosť knižnično-informačného pracoviska 11) Aktivity v orgánoch SAV 12) Hospodárenie organizácie 13) Nadácie a fondy pri organizácii SAV 14) Iné významné činnosti organizácie SAV 15) Vyznamenania, ocenenia a ceny udelené pracovníkom organizácie SAV 16) Poskytovanie informácií v súlade so zákonom o slobodnom prístupe k informáciám 17) Problémy a podnety pre činnosť SAV PRÍLOHY A Zoznam zamestnancov a doktorandov organizácie k B Projekty riešené v organizácii C Publikačná činnosť organizácie D Údaje o pedagogickej činnosti organizácie E Medzinárodná mobilita organizácie

3 1. Základné údaje o VÚ SAV 1.1. Kontaktné údaje Názov: Virologický ústav SAV Riaditeľ: MVDr. Juraj Kopáček, DrSc. Zástupca riaditeľa: Ing. Ľudovít Škultéty, PhD. Vedecký tajomník: RNDr. Tatiana Betáková, CSc. Predseda vedeckej rady: Ing. Miroslav Glasa, PhD. Člen snemu SAV: MVDr. Juraj Kopáček, DrSc. Adresa: Dúbravská cesta 9, Bratislava Tel.: 02/ Fax: 02/ virupold@savba.sk Názvy a adresy detašovaných pracovísk: Oddelenie biotechnologických aplikácií Jarková 269/17, Šarišské Michaľany Vedúci detašovaných pracovísk: Oddelenie biotechnologických aplikácií MVDr. Juraj Kopáček, DrSc. Typ organizácie: rozpočtová od roku Údaje o zamestnancoch Tabuľka 1a: počet a štruktúra zamestnancov Štruktúra zamestnancov K K M Ž M Ž K do 35 rokov F P T Celkový počet zamestnancov ,64 51,36 Vedeckí pracovníci ,2 43,2 Odborní pracovníci VŠ ,36 8,16 Odborní pracovníci ÚS ,48 0 Ostatní pracovníci ,6 0

4 Tabuľka 1b: štruktúra vedeckých pracovníkov (kmeňový stav k ) Rodová skladba Pracovníci s hodnosťou Vedeckí pracovníci v stupňoch DrSc. CSc./PhD. prof. doc. I. IIa. IIb. Muži Ženy Tabuľka 1c: štruktúra pracovníkov podľa veku a rodu, ktorí sú riešiteľmi projektov Veková štruktúra (roky) < > 65 Muži Ženy Tabuľka 1d : priemerný vek zamestnancov VÚ SAV k Kmeňoví zamestnanci Vedeckí pracovníci Riešitelia projektov Muži 47,7 48,9 47,3 Ženy 43,0 40,2 40,9 Spolu 44,2 43,2 43, Iné dôležité informácie k základným údajom o organizácii a zmeny za posledné obdobie (v zameraní, v organizačnej štruktúre a pod.) V sledovanom období roka 2013 nedošlo k žiadnym organizačným zmenám. Základnými vedeckými organizačnými jednotkami zostávajú oddelenia, ktorých cieľom je riešenie aktuálnych vedeckých problémov. Zoznam oddelení k : Oddelenie rastlinnej virológie Oddelenie rickettsiológie Oddelenie ekológie vírusov Oddelenie molekulárnej medicíny Oddelenie molekulárnej patogenézy vírusov Oddelenie ortomyxovírusov. Oddelenie biotechnologických aplikácií Nevedeckými organizačnými jednotkami, ktoré sa podieľajú na vytváraní efektívnych a účelných pracovných podmienok vedeckých oddelení sú: Zoznam úsekov VÚ SAV k : právno-organizačný úsek ekonomický úsek technický úsek

5 2. Vedecká činnosť 2.1. Domáce projekty Tabuľka 2a: zoznam domácich projektov riešených v roku 2013 Počet projektov Čerpané financie za rok 2013 (v ) ŠTRUKTÚRA PROJEKTOV 1. Vedecké projekty, ktoré boli r financované VEGA 2. Projekty, ktoré boli r financované APVV A B spolu A pre organizáciu B 3. Projekty OP ŠF ,96 4. Projekty centier excelentnosti SAV Iné projekty (FM EHP, ŠPVV, Vedecko-technické projekty, ESF, na objednávku rezortov a pod.) A - organizácia je nositeľom projektu B - organizácia sa zmluvne podieľa na riešení projektu 2.2. Medzinárodné projekty Medzinárodné projekty riešené v roku 2013 Tabuľka 2b: zoznam medzinárodných projektov riešených v roku 2013 Počet projektov Čerpané financie za rok 2013 (v ) ŠTRUKTÚRA PROJEKTOV A A B pre spolu organi- B záciu 1. Projekty 7. Rámcového programu EÚ ,66 2. Multilaterálne projekty v rámci vedeckých programov COST, ERANET, INTAS, EUREKA,

6 ESPRIT, PHARE, NATO, UNESCO, CERN, IAEA, ESF (European Science Foundation), ERDF a iné 3. Projekty v rámci medzivládnych dohôd o vedecko-technickej spolupráci 4. Bilaterálne projekty 5. Podpora medzinárodnej spolupráce z národných zdrojov (MVTS, APVV,...) 6. Iné projekty financované alebo spolufinancované zo zahraničných zdrojov A - organizácia je nositeľom projektu B - organizácia sa zmluvne podieľa na riešení projektu 2.3. Najvýznamnejšie výsledky vedeckej práce Základný výskum Protilátky špecifické pre C terminálnu časť PB1-F2 proteínu majú protektívny efekt voči letálnej infekcii vírusom chrípky PB1-F2 je malý chrípkový proteín kódovaný alternatívnym čítacím rámcom PB1 génového segmentu. Hoci PB1-F2 je neštruktúrny proteín viriónu, dochádza počas chrípkovej infekcie aj k indukcii protilátok rozpoznávajúcich PB1-F2. Ich biologický význam ako aj detailná charakterizácia imunogenicity PB1-F2 boli doposiaľ neznáme. Na odhalenie týchto otázok sme realizovali rozsiahle experimentálne štúdie, ktoré dokázali, že pri pasívnej aj aktívnej imunizácii sa prednostne indukujú protilátky rozpoznávajúce N terminálnu časť PB1-F2. Tie však počas chrípkovej infekcie nezohrávajú významnú úlohu. Naproti tomu imunizácia C terminálnym koncom PB1-F2 favorizujúca indukciu len C terminálne špecifických protilátok má protektívny efekt počas letálnej infekcie vírusom chrípky. Uvedené výsledky jasne dokazujú vplyv PB1-F2 na imunologické vlastnosti vírusu chrípky typu A. Antibodies specific to C terminal part of the PB1-F2 confer protection effect against lethal influenza virus infection PB1-F2 is a small influenza A virus (IAV) protein encoded by an alternative reading frame of the PB1gene. Despite PB1-F2 is nonstructural protein, during IAV infection, antibodies topb1- F2 proteins are induced. Detailed immunological maps as well as biological relevance of the anti PB1-F2 antibodies were elusive. To reach such goal, we had performed extensive study to found out above mentioned enigmas. Mostly N-terminal specific antibodies were detected in polyclonal sera raised to complete PB1-F2. Passive and active immunization revealed that antibodies recognizing the N-terminal part of the PB1-F2 molecule have no remarkable effect on the course of IAV infection. Interestingly immunization with C terminal part of the PB1-F2 favoring induction of the antibodies against the C-terminal region of PB1-F2 possesses protection potential in mice against virus infection. Such results clearly prove contribution of PB1-F2 to immunological features of the influenza A virus.

7 Obr. Detekcia protilátok špecifických pre rôzne úseky PB1-F2 v imunnom myšom sére Fig. Detection of region specific anti PB1-F2 antibodies in the mouse immune sera Vedecké výstupy: Kosik I, Hollý J, Russ G. PB1-F2 expedition from the whole protein through the domain to aa residue function. In Acta Virologica : international journal, 2013, vol. 57, no. 2, p ( IF2012). ( Current Contents). ISSN X.T Kosik I, Krejnusova I, Práznovská M, Russ G. The multifaceted effect of PB1-specific antibodies on influenza A virus infection. In Virology, 2013, vol. 447, no. 1-2, p ( IF2012). ( Current Contents). ISSN Aplikačný typ Charakterizácia nového divergentného kmeňa vírusu šarky slivky (PPV) adaptovaného na čerešne a vývoj molekulárnej techniky jeho detekcie Vírus šarky slivky (PPV) je RNA vírus patriaci medzi ekonomicky najvýznamnejšie patogény ovocných drevín. Drvivá väčšina izolátov PPV nie je schopná infikovať červené kôstkoviny a niekoľko doteraz objavených izolátov adaptovaných na čerešne bolo zaradených do kmeňa PPV-C (Cherry). Nedávno sme v povodí rieky Volgy v Rusku na stromoch višní objavili atypické izoláty PPV, ktoré nebolo možné spoľahlivo typizovať pomocou bežných detekčných testov. Porovnanie kompletných sekvencii genómu ukázalo len % zhodu na nukleotidovej úrovni v porovnaní s ostatnými kmeňmi PPV. Fylogenetická analýza jednoznačne zaradila atypické izoláty do samostatného klastra s najväčšou podobnosťou k izolátom kmeňa PPV-C a v menšej miere kmeňa PPV-W. Na základe biologických vlastností (schopnosť prirodzene infikovať višne) a charakterizácii genómu reprezentujú tieto PPV izoláty nový vysoko divergentný kmeň PPV, pre ktorý bolo navrhnuté označenie PPV-CR (Cherry Russian). Unikátne konzervované aminokyselinové mutácie v polyproteínoch PPV-C a PPV-CR sú väčšinou distribuované v centrálnej časti P1, NIa a N-terminálnej časti CP proteínov a môžu predstavovať potenciálnych kandidátov zodpovedných za adaptáciu PPV

8 na čerešne. Variabilita pozorovaná medzi PPV-CR izolátmi (0 2.6% divergencia v parciálnej CP sekvencii), ako aj prítomnosť v rôznych lokalitách naznačuje efektívne rozšírenie a konkurencieschopnosť týchto izolátov. Vzhľadom k tomu, že tento kmeň predstavuje potenciálne vynárajúci sa (emerging) patogén pre územie EÚ, bola na základe dostupných sekvencii vyvinutá a validovaná špecifická detekčná RT-PCR metóda schopná spoľahlivo zachytiť izoláty kmeňa PPV-CR, ktorá môže byť efektívne využitá v rutinnej diagnostike. Characterization of a new divergent cherry-adapted strain of Plum pox virus (PPV) and development of molecular tool for its detection Plum pox virus (PPV) is an RNA virus belonging to the most economically important pathogens of fruit trees. The vast majority of PPV isolates are unable to infect cherries and so far, rare PPV isolates adapted to cherry hosts have been assigned to the PPV-C (cherry) strain. Recently, we have discovered unusual PPV isolates from sour cherry trees in the Volga river basin of Russia, not reliably recognised by conventional detection tests. The comparison of complete genome sequences has shown only % nucleotide identity with other PPV strains. Phylogenetic analyses clearly assigned the unusual isolates to a distinct cluster, most closely related to the PPV-C and, to a lesser extent, PPV-W strain. Based on the biological properties (found to naturally infect sour cherry trees) and genome characterization, these PPV isolates represent a new highly divergent strain of PPV, for which the name PPV-CR (Cherry Russian) was proposed. The unique amino acids conserved among PPV-CR and PPV-C cherry-infecting isolates are mostly distributed within central part of P1, NIa and the N-terminus of the CP, making them potential candidates for genetic determinants of the ability to infect cherry species or of adaptation to these hosts. The variability observed within PPV-CR isolates (0-2.6% nucleotide divergence in partial CP sequences) and the identification of these isolates in different localities and cultivations suggest the efficient establishment and competitiveness of the PPV-CR in the environment. As this strain represent a potential emerging pathogen for the EU territory, a specific RT-PCR has been vallidated, developed based on the available viral sequences, able to intercept the isolates of PPV-CR strains, which can be applied in the effective routine detection. Obr. Symptómy spôsobené vírusom šarky slivky (kmeň PPV-CR) na višni. Fig. Symptoms caused by Plum pox virus (strain PPV-CR) on sour cherry.

9 Vedecké výstupy: Glasa M, Prikhodko Y, Predajňa L, Nagyová A, Shneyder Y, Zhivaeva T, Šubr Z, Cambra M, Candresse T. Characterization of sour cherry isolates of Plum pox virus from the Volga basin in Russia reveals a new cherry strain of the virus. Phytopathology, 2013, vol. 103, no. 9, p Šubr Z, Glasa M. Unfolding the secrets of Plum pox virus: from epidemiology to genomics. Acta Virologica, 2013, vol. 57, no. 2, p Medzinárodné vedecké projekty Význam kliešťového proteínu, subolesin pri infekcii vírusom kliešťovej encefalitídy v kontexte vývoja proti-kliešťových vakcín. Vírus kliešťovej encefalitídy (TBEV) spôsobuje jedno z najnebezpečnejších kliešťami prenášaných ochorení v Európe a Ázii. Napriek dostupným vakcínam voči TBEV počet ochorení v poslednom období stúpa. Proti-kliešťové vakcíny predstavujú inovatívnu stratégiu pre súčasnú prevenciu viacerých kliešťami prenášanými ochorení. Proteín z kliešťa, subolesin (SUB), bol považovaný za vhodného kandidáta vo vývoji proti-kliešťových vakcín. V rámci medzinárodnej spolupráce s Prof. Jose de la Fuente (Instituto de Investigaciòn en Recursos Cinegéticos, Ciudad Real, Španielsko) sme sledovali expresiu SUB pred a počas cicania kliešťov druhu kliešť obyčajný (Ixodes ricinus) infikovaných s TBEV a vplyv imunizácie na prenos vírusu. Pozorovali sme, že infekcia vírusom spôsobuje zvýšenú expresiu SUB. Vplyvom imunizácie so SUB neprichádzalo k očakávanej redukcii prenosu TBEV, ani k ochrane myší pred ochorením. Práve naopak, imunizácia viedla k zvýšeniu hladiny vírusu v kliešťoch aj k intenzívnejšiemu prenosu. Naše výsledky ukázali význam SUB pri vrodenej imunite kliešťa voči TBEV a zároveň ukázali, že nie je vhodným kandidátom na proti-kliešťovú vakcínu, ktorá by mala zabrániť aj prenosu TBEV. Importance of the tick protein subolesin during tick-borne encephalitis virus infection in the context of anti-tick vaccine development. Tick-borne encephalitis virus (TBEV) causes one of the most dangerous tick-borne disease in Europe and Asia. Although effective vaccines for TBEV are available, human TBEV cases recently increase. Anti-tick vaccines encompass an innovative strategy to prevent tick-borne diseases. The tick protein subolesin (SUB) was considered as a promising candidate for the development of the anti-tick vaccines. In frame of the international collaboration with Prof. Jose de la Fuente (Instituto de Investigaciòn en Recursos Cinegéticos, Ciudad Real, Spain) we studied SUB expression after and during feeding of TBEV infected castor bean tick (Ixodes ricinus) and the effect of immunization on TBEV transmission. We have detected that SUB expression is induced in TBEV infected ticks. Unexpectedly, SUB immunization neither reduced the infection nor protected the mice. In contrast, the immunization led to increased levels of virus infection and transmission. Our results indicated the role of SUB in tick innate immunity against TBEV and suggested that SUB might not be a good candidate for anti-tick vaccine preventing also TBEV transmission.

10 Obr. Expresia génu pre subolesin (fialové zafarbenie) v slinných žľazách kliešťa obyčajného (Ixodes ricinus) infikovaných vírusom kliešťovej encefalitídy. Fig. Expression of subolesin (violet staining) in salivary glands of tick-borne encephalitis virus infected castor bean tick (Ixodes ricinus). Vedecké výstupy: Havlikova S, Lickova M, Ayllon N, Roller L, - Kazimirova M, Slovak M, -Moreno-Cid, J.A., Perez De La Lastra J. M, Klempa B, De Lea Fuente J.: Immunization with recombinant subolesin does not reduce tick infection with tick-borne encephalitis virus nor protect mice against disease. In Vaccine, 2013, vol. 31, no. 12, p ( IF2012). ( Current Contents). ISSN X. Havlikova S, Lickova M, Klempa B. Non-viraemic transmission of tick-borne viruses. In Acta Virologica : international journal, 2013, vol. 57, no. 2, p ( IF2012). ( Current Contents). ISSN X.

11 2.4. Publikačná činnosť (úplný zoznam je uvedený v Prílohe C) Tabuľka 2c: štatistika vybraných kategórií publikácií PUBLIKAČNÁ A EDIČNÁ ČINNOSŤ 1. Vedecké monografie vydané v domácich vydavateľstvách (AAB, ABB, CAB) 2. Vedecké monografie vydané v zahraničných vydavateľstvách (AAA, ABA, CAA) 3. Odborné monografie, vysokoškolské učebnice a učebné texty vydané v domácich vydavateľstvách (BAB, ACB) 4. Odborné monografie a vysokoškolské učebnice a učebné texty vydané v zahraničných vydavateľstvách (BAA, ACA) 5. Kapitoly vo vedeckých monografiách vydaných v domácich vydavateľstvách (ABD, ACD) 6. Kapitoly vo vedeckých monografiách vydaných v zahraničných vydavateľstvách (ABC, ACC) 7. Kapitoly v odborných monografiách, vysokoškolských učebniciach a učebných textoch vydaných v domácich vydavateľstvách (BBB, ACD) 8. Kapitoly v odborných monografiách, vysokoškolských učebniciach a učebných textoch vydaných v zahraničných vydavateľstvách (BBA, ACC) 9. Vedecké a odborné práce v časopisoch evidovaných v Current Contents (ADC, ADCA, ADCB, ADD, ADDA, ADDB, CDC, CDCA, CDCB, CDD, CDDA, CDDB, BDC, BDCA, BDCB, BDD, BDDA, BDDB) 10. Vedecké a odborné práce v nekarentovaných časopisoch (ADE, ADEA, ADEB, ADF, ADFA, ADFB, CDE, CDEA, CDEB, CDF, CDFA, CDFB, BDE, BDEA, BDEB, BDF, BDFA, BDFB) 11. Vedecké a odborné práce v zborníkoch (konferenčných aj nekonferenčných, vydaných tlačou alebo na CD) A Počet v r. 2013/ doplnky z r B Počet v r. 2013/ doplnky z r C Počet v r. 2013/ doplnky z r / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 1 / 1 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 0 / 0 47 / 3 0 / 0 0 / 0 7 / 0 0 / 0 0 / 0

12 a/ recenzovaných, editované (AEC, AED, AFA, AFB, AFBA, AFBB, BEC, BED, 22 / 0 0 / 0 0 / 0 CEC, CED) b/ nerecenzovaných (AEE, AEF, AFC, AFD, AFDA, AFDB, BEE, BEF) 9 / 0 0 / 0 0 / Vydané periodiká evidované v Current Contents Ostatné vydané periodiká Vydané alebo editované zborníky z vedeckých podujatí 1/0 0/0 0/0 (FAI) 15. Vedecké práce uverejnené na internete (GHG) 0 / 0 0 / 0 0 / Preklady vedeckých a odborných textov (EAJ) 0 / 0 0 / 0 0 / Heslá v odborných terminologických slovníkoch a encyklopédiách vydaných * (BDA, BDB) 0 / 0 0 / 0 0 / 0 Tabuľka 2d: ohlasy OHLASY A Počet v r. 2012/ doplnky z r B Počet v r. 2012/ doplnky z r Citácie vo WOS (1.1, 2.1) 1198 / 35 0 / 0 Citácie v SCOPUS (1.2, 2.2) 175 / 16 0 / 0 Citácie v iných citačných indexoch a databázach (9, 10) 0 / 1 0 / 0 Citácie v publikáciách neregistrovaných v citačných indexoch (3, 4) 63 / 4 0 / 0 Recenzie na práce autorov z organizácie (5, 6, 7, 8) 0 / 0 0 / Aktívna účasť na vedeckých podujatiach Tabuľka 2e: vedecké podujatia Prednášky a vývesky na medzinárodných vedeckých podujatiach 72 Prednášky a vývesky na domácich vedeckých podujatiach Vyžiadané prednášky Vyžiadané prednášky na medzinárodných vedeckých podujatiach Klempa, B. Tatjana Avsic-Zupanc, Jan Clement, Tamara K. Dzagurova, Heikki Henttonen, Paul Heyman, Ferenc Jakab, Detlev H. Kruger, Piet Maes, Anna Papa, Evgeniy A. Tkachenko, Rainer G. Ulrich, Olli Vapalahti, Antti Vaheri. Complex evolution and epidemiology of Dobrava-Belgrade hantavirus: Definition of genotypes and their characteristics. IX International Conference on HFRS, HPS & Hantaviruses, Beijing, China, June 2013

13 Pastorekova S, Zatovicova M, Svastova E, Csaderova L, Takacova M, Kopacek J, Pastorek J. CA IX as a hypoxia-directed actor in tumor biology: to be or not to be acidic. Invited lecture. Book of Abstracts, Oxygen EU COST Action TD0901. Dealing with hypoxia: Regulatory aspects in cells, tissues and organisms, June 8-12, 2013 Oulu. Pastorekova, S., Zatovicova, M., Svastova, E., Csaderova, L., Takacova, M., Kopacek, J, Pastorek, J. CA IX role in ph regulation and signaling in cancer a subcellular context-related view. Abstract of the invited lecture, 4th Annual Meeting of the ISPDC, Munich, October Pastorekova S. Cell migration and invasion in cancer: The role of the ph-regulating machinery and beyond, Invited lecture, Symposium of Research Initiative in Membrane Biology. University of Kaiserslautern, September 16-19, 2013 Klempa, B. Molecular evolution and epidemiology of hantaviruses. "Epidemiology and Evolution of Emerging Viruses in Africa" Lecture Course, Cape Town, South Africa, March Vyžiadané prednášky na domácich vedeckých podujatiach v sledovanom období žiadne Vyžiadané prednášky na významných vedeckých inštitúciách Kocianová E., Špitálska E., Sekeyová Z. Rickettsiózy na Slovensku. Spolok Slovenských lekárov, Bratislava , NTÚ LFUK Bratislava, Sasinkova č.4. Benej Martin: Pokroky v proteomickom profilovaní: Metóda 2D-DIGE. Katedra mikrobiológie a virológie PF UK Bratislava Csáderová Lucia: Využitie konfokálneho mikroskopu na štúdiu biomakromolekúl. Katedra mikrobiológie a virológie PF UK Bratislava Kabát Peter : Ekológia a parazitologický význam kliešťov, PF UK Bratislava Patentová a licenčná činnosť na Slovensku a v zahraničí v roku 2013 v sledovanom období žiadna

14 2.8. Účasť expertov na hodnotení národných projektov (APVV, VEGA a iných) Tabuľka 2f: experti hodnotiaci národné projekty Meno pracovníka Typ programu/projektu/výzvy Počet hodnotených projektov Kostolanský František APVV, reg. c. APVV Kúdelová Marcela KEGA 2 VEGA 2 VV APVV Špitalská Eva APVV všeobecná výzvy 1 Švastová Eliška VEGA 1 Varečková Eva KEGA Iné informácie k vedeckej činnosti. Virologický ústav si uvedomuje zložitosť financovania vedy, hlavne základného výskumu na Slovensku a preto sa snaží rozvíjať aktivity a programy smerujúce do podpory užšej spolupráce so súkromným sektorom, či už domácim alebo zahraničným, s cieľom urýchliť aplikovateľnosť vedeckých výsledkov do praxe. Aby bolo možné vyššie uvedené ciele napĺňať, ústav sa zameriava na vybudovanie potrebnej infraštruktúry. V posledných rokoch bolo toto možné realizovať najmä vďaka projektom, kde sa podarilo vytvoriť veľmi dobré podmienky pre využívanie metód molekulárnej biológie, virológie, bunkovej biológie, imunológie atď. v rámci ústavu, SAV alebo kooperujúcich vysokých škôl v tomto združení. Ako naliehavá potreba sa javí udržať špecialistov, ktorí tieto unikátne prístroje obsluhujú. Najmä vďaka čerpaniu zo štrukturálnych fondov EÚ sa ústav snaží zadovážiť v rámci Slovenskej republiky unikátne prístroje a zariadenia, ktoré nám umožnia držať krok so súčasnými modernými trendmi vo vede. 3. Doktorandské štúdium, iná pedagogická činnosť a budovanie ľudských zdrojov pre vedu a techniku 3.1. Údaje o doktorandskom štúdiu Tabuľka 3a: počet doktorandov v roku 2013 Forma Počet k celkový počet Doktorandi z toho novoprijatí Počet ukončených doktorantúr v r ukončenie úspešnou obhajobou Ukončenie z dôvodov predčasné ukončenie neúspešné ukončenie M Ž M Ž M Ž M Ž M Ž Interná zo zdrojov SAV

15 Interná z iných zdrojov Externá Spolu Súhrn Zmena formy doktorandského štúdia Tabuľka 3b: počty preradení Z formy Interná z prostriedkov SAV Interná z prostriedkov SAV Do formy Interná z iných zdrojov Externá Interná z iných Interná z iných zdrojov zdrojov Interná z prostriedkov SAV Externá Externá Interná z prostriedkov SAV Externá Interná z iných zdrojov Počet Zoznam doktorandov, ktorí ukončili doktorandské štúdium úspešnou obhajobou Tabuľka 3c: menný zoznam ukončených doktorandov v roku 2013 úspešnou obhajobou Mesiac, Mesiac, Číslo a názov Meno a Meno Forma rok rok študijného organizácia doktoranda DŠ nástupu obhajoby odboru školiteľa na DŠ Mgr. Katarína Lapošová Mgr. Ľubomíra Lukáčiková Mgr. Alžbeta Nagyová IŠ z prostr. SAV IŠ z iných zdrojov IŠ z prostr. SAV IŠ z iných Mgr. Peter Pančík zdrojov Mgr. Lukáš Predajňa Mgr. Petra Švančarová IŠ z iných zdrojov IŠ z prostr. SAV 9 / / virológia 9 / / virológia 9 / / virológia 9 / / virológia 9 / / virológia 9 / / virológia Zoznam interných a externých doktorandov je uvedený v Prílohe A. prof. RNDr. Silvia Pastoreková DrSc., VÚ SAV prof. RNDr. Jaromír Pastorek DrSc., Virologický ústav SAV RNDr. Zdeno Šubr CSc., Virologický ústav SAV RNDr. Marcela Kúdelová DrSc., Virologický ústav SAV Ing. Miroslav Glasa PhD., Virologický ústav SAV RNDr. Tatiana Betáková CSc., Virologický ústav SAV Fakulta udeľujúca vedeckú hodnosť UVLaF Košice Prírodovedecká fakulta UK Prírodovedecká fakulta UK Prírodovedecká fakulta UK Prírodovedecká fakulta UK Prírodovedecká fakulta UK

16 3.4. Zoznam akreditovaných študijných programov s uvedením VŠ Tabuľka 3d : zoznam akreditovaných študijných programov s uvedením univerzity/vysokej školy a fakulty Názov študijného programu (ŠP) Názov študijného odboru (ŠO) Číslo ŠO Univerzita/vysoká škola a fakulta virológia virológia Prírodovedecká fakulta UK UVLaF Košice molekulárna biológia molekulárna biológia Prírodovedecká fakulta UK mikrobiológia mikrobiológia Prírodovedecká fakulta UK onkológia onkológia Lekárska fakulta UK Tabuľka 3e : účasť na pedagogickom procese Menný prehľad pracovníkov, Menný prehľad pracovníkov, ktorí boli menovaní ktorí pôsobili ako členovia do odborových komisií vedeckých rád univerzít, študijných programov správnych rád univerzít a fakúlt doktorandského štúdia RNDr. Tatiana Betáková, CSc. (virológia) Ing. Miroslav Glasa, PhD. (virológia) doc. RNDr. Peter Kabát, CSc. (virológia) RNDr. Elena Kocianová, DrSc. (mikrobiológia) MVDr. Juraj Kopáček, DrSc. (molekulárna cytológia) MVDr. Juraj Kopáček, DrSc. (molekulárna biológia) RNDr. František Kostolanský, CSc. (virológia) RNDr. Marcela Kúdelová, DrSc. (virológia) prof. RNDr. Jela Mistríková, DrSc. (virológia) prof. RNDr. Jaromír Pastorek, DrSc. (virológia) prof. RNDr. Jaromír Pastorek, DrSc. (molekulárna biológia) prof. RNDr. Silvia Pastoreková, DrSc. (virológia) prof. RNDr. Silvia Pastoreková, DrSc. (imunológia) prof. RNDr. Silvia Pastoreková, DrSc. (molekulárna cytológia) prof. RNDr. Silvia Pastoreková, DrSc. (onkológia) prof. RNDr. Jaromír Pastorek, DrSc. (SPU v Nitre) prof. RNDr. Jaromír Pastorek, DrSc. (STU v Bratislave) prof. RNDr. Jaromír Pastorek, DrSc. (SZU v Bratislave) prof. RNDr. Jaromír Pastorek, DrSc. (UK v Bratislave) prof. RNDr. Silvia Pastoreková, DrSc. (LF UK v Bratislave) prof. RNDr. Silvia Pastoreková, DrSc. (PriF UK v Bratislave) Menný prehľad pracovníkov, ktorí získali vyššiu vedeckú, pedagogickú hodnosť alebo vyšší kvalifikačný stupeň

17 Ing. Rudolf Toman, PhD, DrSc. (mikrobiológia) RNDr. Eva Varečková, DrSc. (virológia) 3.5. Údaje o pedagogickej činnosti Tabuľka 3f: prednášky a cvičenia vedené v roku 2013 PEDAGOGICKÁ ČINNOSŤ Prednášky Cvičenia a semináre doma v zahraničí doma v zahraničí Počet prednášateľov alebo vedúcich cvičení Celkový počet hodín v r Prehľad prednášateľov predmetov a vedúcich cvičení, s uvedením názvu predmetu, úväzku, katedry, fakulty, univerzity/vysokej školy je uvedený v Prílohe D. Tabuľka 3g: aktivity pracovníkov na VŠ Počet pracovníkov, ktorí pôsobili ako vedúci alebo konzultanti 1. diplomových a bakalárskych prác Počet vedených alebo konzultovaných diplomových a bakalárskych prác Počet pracovníkov, ktorí pôsobili ako školitelia doktorandov (PhD.) Počet školených doktorandov (aj pre iné inštitúcie) Počet oponovaných dizertačných a habilitačných prác 9 6. Počet pracovníkov, ktorí oponovali dizertačné a habilitačné práce Počet pracovníkov, ktorí pôsobili ako členovia komisií pre obhajoby DrSc. prác Počet pracovníkov, ktorí pôsobili ako členovia komisií pre obhajoby PhD. prác Počet pracovníkov, ktorí pôsobili ako členovia komisií, resp. oponenti v inauguračnom alebo habilitačnom konaní na vysokých školách Iné dôležité informácie k pedagogickej činnosti V priebehu roka 2013 sa vo VÚ SAV celkom školilo 22 doktorandov hradených z prostriedkov SAV a traja doktorandi hradení z iných zdrojov. Dúfame, že vďaka možnosti ich financovania z prostriedkov SAV, bude tento trend aj v budúcnosti pokračovať a počty doktorandov na ústave budú stabilizované respektíve nebudú klesať. V roku 2013 úspešne obhájili doktorandskú dizertačnú prácu šiesti doktorandi, pričom všetci sa stali zamestnancami VÚ SAV s pracovnými zmluvami uzatvorenými na dobu určitú.

18 Doktorandi sa aktívne zapájajú do vedeckého a spoločenského života na ústave. Oceniť treba najmä ich aktivity počas akcie s názvom "Noc výskumníkov". Okrem doktorandského štúdia sa viacerí pracovníci ústavu aktívne podieľajú na pedagogickom procese vedením bakalárskych a diplomových prác študentov ako aj vedením seminárov a praktických cvičení. 4. Medzinárodná vedecká spolupráca 4.1. Medzinárodné vedecké podujatia Medzinárodné vedecké podujatia, ktoré VÚ SAV organizoval v roku 2013 alebo sa na ich organizácii podieľala, s vyhodnotením vedeckého a spoločenského prínosu podujatia III. Labudove dni, Virologický ústav SAV, Bratislava, 100 účastníkov, Konferencia bola zameraná na zoonózy a patogény prenášané vektormi. Príspevky boli rozdelené do nasledovných sekcií: prírodná ohniskovosť nákaz, vektory a nimi prenášané mikroorganizmy séroprevalencia, diagnostika a epidemiológia zoonóz biologické aspekty parazitológie intracelulárne parazity, diagnostika a prevalencia Medzinárodné vedecké podujatia, ktoré usporiada organizácia SAV v roku 2014 The 5th Annual Meetimng of the International Society for Proton Dynamics in Cancer 5. ročník konferencie Medzinárodnej spoločnosti pre protónovú dynamiku v nádoroch (ISPDC) Kongresové centrum SAV Smolenice, 80 účastníkov, (Silvia Pastoreková, 02/ , virusipa@savba.sk) Hlavný predmet konferencie: fyziologické a molekulárne mechanizmy regulácie ph v nádoroch a ich impakt na progresiu nádorovej choroby Počet pracovníkov v programových a organizačných výboroch medzinárodných konferencií Tabuľka 4a : programové a organizačné výbory medzinárodných konferencií Typ výboru Programový Organizačný Programový i organizačný Počet členstiev Členstvo a funkcie v medzinárodných orgánoch Členstvo a funkcie v medzinárodných vedeckých spoločnostiach, úniách a národných komitétoch SR RNDr. Martin Benej European Association of Cancer Research - člen

19 RNDr. Tatiana Betáková, CSc. AAAS (Advancing science, serving society) - člen American Society For Microbiology (funkcia: člen) Československá spoločnosť mikrobiologická (funkcia: člen) prof. MUDr. Fedor Čiampor, DrSc. Československá biologická spoločnosť AVČR - podpredseda Československá mikrobiologická spoločnosť - člen Československá miroskopická spoločnosť AVČR - člen Ing. Miroslav Glasa, PhD. American Phytopathological Society - člen Mgr. Jaroslav Hollý Československá mikrobiologická spoločnosť - člen RNDr. Boris Klempa, PhD. Československá mikrobiologická spoločnosť - člen European Network for Diagnostics of "Imported" Viral Diseases (ENIVD) - menovaný reprezentant SR) Gesellschaft für Virologie - člen RNDr. Juraj Koči, PhD. Československá mikrobiologická spoločnosť - člen RNDr. František Kostolanský, CSc. Československá spoločnosť mikrobilogická - člen Europen Society for Clinical Virology - člen RNDr. Ivan Košík, PhD. Československá spoločnosť mikrobiologická - člen MVDr. Juraj Kopáček, DrSc. International Society for Proton Dynamics in Cancer - člen Mgr. Lucia Kotlárová Československá spoločnosť mikrobiologická - člen RNDr. Marcela Kúdelová, DrSc. Československá spoločnosť mikrobiologická - člen prof. RNDr. Jela Mistríková, DrSc. Československá spoločnosť mikrobiologická - člen prof. RNDr. Jaromír Pastorek, DrSc. Európska akadémia vied a umení - menovaný člen

20 prof. RNDr. Silvia Pastoreková, DrSc. European Organization for Research and Treatment of Cancer Receptor and Biomarker Group - menovaný člen Európska molekulárno-biologická konferencia - menovaný reprezentant SR International Society for Proton Dynamics in Cancer - člen Mgr. Margaréta Práznovská Československá spoločnosť mikrobiologická - člen RNDr. Gustáv Russ, DrSc. Československá spoločnosť mikrobiologická člen výboru RNDr. Zuzana Sekeyová, PhD. Československá mikrobiologická spoločnosť - člen European society of clinical microbiology and infectious diseases (ESCMID) - člen Mgr. Eva Špitalská, PhD. Československá spoločnosť mikrobiologická člen Mgr. Eliška Švastová, PhD. International Society for Proton Dynamics in Cancer - člen Ing. Rudolf Toman, PhD, DrSc. EU s R&D Expert Group on Countering the Effects of Biological and Chemical Terrorism, Brusel - člen European Working Group on Rickettsiae, Coxiella and Ehrlichiae -člen výboru International Endotoxin Society - člen United Nations Industrial Development Organisation (UNIDO), Viedeň - expert pre organickú chémiu a biochémiu Chemical Industries Branch - konzultant RNDr. Eva Varečková, DrSc. Československá spoločnosť mikrobilogická - člen Europen Society for Clinical Virology - člen 4.3. Účasť expertov na hodnotení medzinárodných projektov (EÚ RP, ESF a iných) Tabuľka 4b: experti hodnotiaci medzinárodné projekty Meno pracovníka Typ programu/projektu/výzvy Počet hodnotených projektov Špitalská Eva DAAD Najvýznamnejšie prínosy MVTS ústavu vyplývajúce z mobility a riešenia medzinárodných projektov a iné informácie k medzinárodnej vedeckej spolupráci

21 Miroslav Glasa Alžbeta Nagyová Budapešť, Maďarsko, 01/2013 Záverečné stretnutie projektu HUSK/0901/1.2.1/0126, zhodnotenie dosiahnutých výsledkov a možnosti ich aplikácie v ovocinárskej praxi. Miroslav Glasa Lukáš Predajňa Olomouc, ČR, 09/13 Stretnutie (small group meeting) v rámci projektu COST FA1104 zamerané na problematiku diagnostiky a molekulárnej charakterizácie vírusových patogénov čerešní využitím sekvenačných technológií novej generácie (NGS). prof. RNDr. Silvia Pastoreková, DrSc. MVDr. Juraj Kopáček, DrSc. Mgr. Joanna Obacz Kodaň, Dánsko, 01/13 Delft, Holandsko, 09/13 Pravidelné stretnutie konzorcia projektu EngCaBra, aktualizácia dosiahnutých výsledkov a konkretizácia spolupráce s partnermi konzorcia na ďalšie obdobie riešenia projektu. Na januárovom stretnutí sa tiež úspešne uskutočnila prezentácia výsledkov zástupcovi Európskej komisie. prof. RNDr. Silvia Pastoreková, DrSc. MVDr. Juraj Kopáček, DrSc. RNDr. Miriam Zaťovičová RNDr. Martina Takáčová Portorož, Slovinsko, 04/2013 Pozvané prednášky a postery na dvoch za sebou nasledujúcich onkologických konferenciách podnietili nadviazanie novej spolupráce, ktorá sa začína napĺňať pri príprave spoločného projektu, ktorého partnerom je aj Univerzita v Ljubjane. prof. RNDr. Silvia Pastoreková, DrSc. Prof. RNDr. Jaromír Pastorek, DrSc. Mníchov 04/2013 Nice 11/2013 Pravidelné stretnutie konzorcia projektu METOXIA, prezentácia dosiahnutých výsledkov a konkretizácia spolupráce s partnermi konzorcia na posledný rok riešenia projektu. Na stretnutí boli dohodnuté aj spolupráce pri podávaní projektov v rámci výziev Horizon2020. prof. RNDr. Silvia Pastoreková, DrSc. MVDr. Juraj Kopáček, DrSc. Mgr. Eliška Švastová, PhD. Mgr. Lucia Csáderová, PhD. Oulu 06/2013 Pozvaná prednáška a postery na meetingu COST projektu TD0901 HypoxiaNet umožnili dissemináciu vedeckých výsledkov.

22 prof. RNDr. Silvia Pastoreková, DrSc. Kaiserslautern 09/2013 Mníchov 10/2013 Pozvané prednášky na dvoch medzinárodných konferenciách priniesli nové možnosti vedeckej spolupráce a organizáciu ďalšieho ročníka ISPDC konferencie v Smoleniciach. RNDr. Eva Varečková, DrSc. RNDr. František Kostolanský, CSc. RNDr. Ivan Košík, PhD. Viedeň, Rakúsko, 04/13 Pravidelné stretnutie konzorcia projektu FLUPHARM, aktualizácia dosiahnutých výsledkov a konkretizácia spolupráce s partnermi konzorcia na ďalšie obdobie riešenia projektu. Zároveň boli prezentované najnovšie výsledky získané na VÚ SAV v oblasti výskumu medzidruhového prenosu vírusov chrípky A a PB1-F2 proteínu vírusu chrípky. RNDr. Eva Varečková, DrSc. RNDr. František Kostolanský, CSc. RNDr. Ivan Košík, PhD. RNDr. Staneková Zuzana, PhD. Brno, Česká republika, 08/13 Nadviazanie spolupráce medzi pracoviskami: CEITEC Středoevropský technologický institut v Brně, detašované pracoviště MENDELU a Virologický ústav SAV, Bratislava, v oblasti detekcie a analýzy chrípkových vírusov. Načrtnutie plánovaných spoločných experimentov a prezentácia hlavných smerov súčasného výskumu oboch pracovísk. Prehľad údajov o medzinárodnej mobilite pracovníkov organizácie je uvedený v Prílohe E. Prehľad a údaje o medzinárodných projektoch sú uvedené v kapitole 2 a Prílohe B. 5. Vedná politika VÚ SAV sa dlhodobo zameriava na riešenie principiálnych otázok a problémov virológie, molekulárnej biológie, mikrobiológie a onkológie a to v súlade s prioritami pracoviska, definovanými v zriaďovacej listine, s primeraným prihliadnutím na najnovší vývoj v jednotlivých vedných disciplínach. Vedecký záujem sa sústreďuje najmä na objasnenie molekulárno-biologických mechanizmov vírusovej replikácie, vzťahov medzi vírusmi, infikovanými bunkami a hostiteľskými organizmami, pochopenie mechanizmov vírusovej patogenézy, odhalenie funkcie vírusových komponentov, objasnenie imunitných odpovedí na vírusové infekcie, štúdium ekologických aspektov a vývoj postupov na detekciu spoločensky a hospodársky významných vírusov. Dlhodobú tradíciu má výskum štruktúrno-funkčných vlastností komponentov vonkajšej membrány rickettsií a chlamýdií, charakterizácia nových kmeňov a druhov týchto mikroorganizmov a ich medicínsky a ekologický význam. V predchádzajúcej dekáde VÚ SAV tiež zintenzívnil výskumné aktivity v oblasti molekulárnej biológie, normálnej a patologickej fyziológie a onkológie, súvisiace s vedeckým zámerom, ktorý vznikol na pôde ústavu a viedol k získaniu viacerých originálnych výsledkov. Jedná sa hlavne o onkologický výskum v oblasti nádorovej hypoxie, kde má ústav vďaka

23 objavu Karbonickej anhydrázy IX ako markera hypoxie, popredné postavenie vo svete. Vo VÚ SAV sa začali rozvíjať aktivity translačného charakteru v oblasti molekulárnej medicíny, a to najmä v podobe uplatňovania najnovších metodík molekulárnej biológie na vývoj detekčných testov vhodných na rýchlu a citlivú diagnostiku vírusových a nádorových ochorení. V poslednom období sa ústav snaží aktívnejšie rozvíjať spoluprácu so súkromným sektorom s cieľom zintenzívnenia zavádzania poznatkov vedy a výskumu do praxe. Virologický ústav SAV, má dlhodobo jasné vedné smerovanie vyplývajúce zo zamerania aktivít jednotlivých oddelení. Výsledkom týchto aktivít sú každoročne kvalitné vedecké výsledky, zhmotnené najmä publikačnými výstupmi. Dôležitá je skutočnosť, že ústavu sa darí zvyšovať kvalitu publikovaných prác, vyjadrenú najmä impakt faktorom časopisov a citačným ohlasom na tieto práce. Ústav venuje veľkú pozornosť mladej generácii a omladzovaniu vedeckých kádrov. V rámci vedeckej výchovy sa na ústave v priebehu roka školí okolo doktorandov, pričom každoročne sa vypisujú prijímacie pohovory na cca 5 nových miest interného doktorandského štúdia. Ústav sa snaží najlepších doktorandov zamestnať, aby prioritne uplatnili svoje vedomosti a získané skúsenosti pri riešení projektov VÚ SAV. V snahe získať mladých adeptov vedy sa pracovníci ústavu aktívne zapájajú aj do pedagogickej činnosti na univerzitách (prednášky, cvičenia, vedenie diplomových prác, preddiplomová prax) a propagujú výsledky vedeckej činnosti (médiá, konferencie, semináre, letné školy, dni otvorených dverí). Pre zabezpečenie súčasnej pozície a jej perspektívne zlepšenie Virologický ústav SAV: rozvíja aktívnu spoluprácu so zodpovedajúcimi inštitúciami na Slovensku a v zahraničí buduje nové a modernizuje existujúce laboratóriá podporuje publikovanie zásadných výsledkov v uznávaných vedeckých časopisoch intenzívne sa venuje výchove doktorandov a najlepších následne zamestnáva VÚ SAV podporuje primeranú súťaživosť v rámci ústavu hodnotením výkonnosti vedeckých pracovníkov čím podporuje ich vedecko-kariérny rast Virologický ústav SAV bol v rámci posledného pravidelného hodnotenia vedeckých organizácií SAV (akreditácií) zaradený do najvyššej kategórie A), čo svedčí o vysokej kvalite vedecko-výskumnej práce a ostatných zohľadňovaných ukazovateľov. 6. Spolupráca s univerzitami/vysokými školami, štátnymi a neziskovými inštitúciami (okrem aktivít uvedených v kap. 2, 3, 4 ) 6.1. Spolupráca s univerzitami/vš (fakultami) Názov univerzity/vysokej školy a fakulty: Lekárska fakulta UK Bratislava Druh spolupráce (spoločné pracovisko alebo iné): pedagogická činnosť Začiatok spolupráce: 2008 Zameranie: prednášky pre PhD študentov Zhodnotenie: pracovníci VÚ SAV sa zapájajú do pedagogického procesu vedením diplomových prác a formou prednášok pre PhD študentov Názov univerzity/vysokej školy a fakulty: Lekárska fakulta UK Bratislava Druh spolupráce (spoločné pracovisko alebo iné): spoločné projekty VEGA Začiatok spolupráce: 1989 Zameranie: spoločný zber a spracovanie biologického materiálu (napr. kliešte, rezervoárové

24 zvieratá), spoločné publikácie a príspevky na konferenciach Zhodnotenie: obojstranne výhodná spolupráca s Epidemiologickým ústavom LFUK v Bratislave Názov univerzity/vysokej školy a fakulty: Prírodovedecká fakulta UK Bratislava Druh spolupráce (spoločné pracovisko alebo iné): vo VÚ SAV sídli časť katedry Mikrobiológie a virológie Začiatok spolupráce: 1988 Zameranie: virológia a mikrobiológia Zhodnotenie: spolupráca je obojstranne výhodná a prináša spoločné projekty a publikácie Názov univerzity/vysokej školy a fakulty: Prírodovedecká fakulta UK Bratislava Druh spolupráce (spoločné pracovisko alebo iné): pedagogická činnosť Začiatok spolupráce: 1994 Zameranie: prednášky, semináre a cvičenia na Katedre mikrobiológie a virológie, Katedre molekulárnej biológie, Katedre biochémie, Katedre genetiky Zhodnotenie: pracovníci VÚ SAV sa zapájajú do pedagogického procesu vedením bakalárskych, diplomových prác, a formou semestrálnych prednášok, seminárov a cvičení pre študentov bakalárskeho a magisterského stupňa Názov univerzity/vysokej školy a fakulty: Univerzita Komenského v Bratislave Druh spolupráce (spoločné pracovisko alebo iné): spoločné projekty ŠF EÚ Začiatok spolupráce: 2009 Zameranie: translačný výskum v biomedicíne Zhodnotenie: partnerská spolupráca v rámci projektov Štrukturálnych fondov 6.2. Významné aplikácie výsledkov výskumu v spoločenskej praxi alebo vyriešenie problému pre štátnu alebo neziskovú inštitúciu v sledovanom období žiadne 6.3. Iná činnosť využiteľná pre potreby spoločenskej praxe v sledovanom období žiadne 7. Spolupráca s aplikačnou a hospodárskou sférou okrem aktivít uvedených v kap. 2, 3, Spoločné pracoviská s aplikačnou sférou Názov pracoviska: Priemyselný výskum v klinickej diagnostike infekčných patogénov Partner(i): BioScience Slovakia, s.r.o. Zameranie: Spoločné pracovisko, "Centrum pre inovačný výskum protinádorových a protivírusových stratégií" v rámci projektov ŠF financovaných z ERDF. Rok založenia: 2012 Zhodnotenie: pokračovalo sa v plánovaných výskumných aktivitách, ktorých cieľom je vývoj diagnostických reagencií a testov na detekciu vírusových infekcií na báze imunologických a molekulárnych prístupov

25 7.2. Kontraktový zmluvný výskum (vrátane zahraničných kontraktov) Názov kontraktu: Zmluvná vedecko - technická spolupráca Partner(i): HSC Development GmbH Začiatok spolupráce (v súlade s podpísaným kontraktom): 2013 Ukončenie spolupráce (ak ide o spoluprácu v krátkom období): 2014 Stručný opis výstupu/výsledku: testovanie antivírusových preparátov in vitro a in vivo, výber vakcinačných kmeňov a adjuvantov pre stimuláciu protektívnej imunity voči chrípke otestovali sme kombinácie troch rôznych potenciálnych adjuvantných látok v kombinácii s rôznymi variantami vírusov chrípky Zhodnotenie: jedná sa o perspektívnu spoluprácu, kde je po spoločných konzultáciách s partnerom aj predpoklad jej kontrahovania na ďalšie obdobie 7.3. Iná činnosť využiteľná pre potreby hospodárskej praxe Laboratórium diagnostiky a prevencie rickettsiových a chlamýdiových nákaz, sa v rámci vedecko-technickej spolupráce vyvíjajú a pripravujú diagnostické prípravky pre jednoduchú, rýchlu a spoľahlivú diagnostiku ochorení rickettsiového a chlamýdiového pôvodu. Najmä v oblasti diagnostiky Q horúčky je k dispozícii celá paleta diagnostických prípravkov umožňujúca širokú škálu sérologických vyšetrení na špičkovej úrovni. Pre potreby praxe sa vyvíjajú aj prípravky na diagnostiku iných rickettsiových nákaz zo skupiny ochorení týfusového pôvodu. Osobitný význam má vývoj/produkcia diagnostických prípravkov pre diagnostiku chlamýdiových infekcií vzhľadom na ich hojný výskyt u nás a vo svete. Laboratórium poskytuje vzorky diagnostických prípravkov, poradenskú a technickú pomoc. 8. Aktivity pre Národnú radu SR, vládu SR, ústredné orgány štátnej správy SR a iné organizácie 8.1. Členstvo v poradných zboroch vlády SR, Národnej rady SR, ministerstiev SR, orgánoch EÚ, EP, NATO a pod. Tabuľka 8a: členstvo v poradných zboroch Národnej rady SR, vlády SR, ministerstiev SR, orgánoch EÚ, EP, NATO a pod. Meno pracovníka Názov orgánu Funkcia prof. MUDr. Fedor Interacademy Medical Panel Čiampor, DrSc. Global Forum for Health Research Rada APVV pre MVTS a do 7RP MVDr. Juraj Kopáček, DrSc. Národná odborná vedecká skupina, Európsky úrad pre bezpečnosť potravín (EFSA) člen člen predseda člen RNDr. Otakar Kúdela, CSc. Národné vedecké skupiny EFSA člen Slovenská národná akreditačná služba expert prof. RNDr. Jaromír Pastorek, DrSc. Rada vlády pre vedu a techniku člen

26 prof. RNDr. Silvia Pastoreková, DrSc. Ing. Rudolf Toman, PhD, DrSc. Rada vlády pre znalostnú spoločnosť člen Komisia pre obhajoby doktorských predseda dizertačných prác Pracovná skupina pre prioritné oblasti člen aplikovaného výskumu a experimentálneho vývoja - biomedicínu a biotechnológie, Ministerstvo školstva, vedy, výskumu a športu SR Slovenská komisia pre vedecké podpredsedníčka hodnosti Národná sieť prevencie kriminality zástupca SAV Európska sieť prevencie kriminality zástupca SR 8.2. Expertízna činnosť a iné služby pre štátnu správu a samosprávy Názov expertízy: Detekcia vírusových patogénov Adresát expertízy: Odbor rastlinnej výroby, Ministerstvo pôdohospodárstva a rozvoja vidieka SR Spracoval: Ing. Miroslav Glasa, PhD. Stručný opis: detekcia vírusových patogénov v peli čerešní importovanom z USA pomocou molekulárnych metód (RT-PCR), poskytnutie stanoviska k hodnoteniu rizika. Názov expertízy: Akreditácia, reakreditácia a dohľad v medicínskych laboratóriách SR Adresát expertízy: Slovenská národná akreditačná služba Spracoval: RNDr. Marcela Kúdelová, DrSc. Stručný opis: posudzovanie a expertné vyhodnocovanie výkonu akreditovaných metód diagnostiky - 10 krát Názov expertízy: expertízne posúdenie Laboratória Gosudarstvennyj expertnyj centr ministerstva zdravoochranenija Ukrajiny, Kyjev, Ukrajina Adresát expertízy: Slovenská národná akreditačná spoločnosť (SNAS) Spracoval: RNDr. Zuzana Sekeyová, PhD. Stručný opis: posúdenie na mieste, v rámci dohľadu, Laboratória Gosudarstvennyj expertnyj centr ministerstva zdravoochranenija Ukrajiny, Kyjev, Ukrajina 8.3. Členstvo v radách štátnych programov a podprogramov ŠPVV a ŠO Tabuľka 8b Členstvo v radách štátnych programov a podprogramov ŠPVV a ŠO Meno pracovníka Názov orgánu Funkcia 8.4. Prehľad aktuálnych spoločenských problémov, ktoré riešilo pracovisko v spolupráci s Kanceláriou prezidenta SR, s vládnymi a parlamentnými orgánmi alebo pre ich potrebu V sledovanom období žiadne.

27 9. Vedecko-organizačné a popularizačné aktivity 9.1.Vedecko-popularizačná činnosť Najvýznamnejšia vedecko-popularizačná činnosť pracovníkov Tabuľka 9a: vedecko-popularizačná činnosť pracovníkov VÚ SAV Meno Spoluautori Typ 1 Názov Sabína Havlíková Jaroslav Hollý Peter Kabát Boris Klempa Ivan Košík Barák,Derdáková Ličková, Klempa Melničáková, Muchová, Žitňan Ondrisková Roller, Slovák IN iné iné PB IN RO IN IN Metodické listy k projektu DEVAK (ITMS ) Vývoj diagnostických postupov pre detekciu patogénov prenášaných kliešťami a postupov na prípravu vakcín proti kliešťom. Noc výskumníkov 2013 Týždeň vedy a techniky na Slovensku 2013 Prednáška pre zoológov v rámci zoológického krúžku Interview publikované v článku "Vedci sa snažia vyvinúť vakcínu proti kliešťom" Interview v rádiu Best o vývoji vakcíny proti kliešťom pri príležitosti zahájenia nového EU projektu Interviev o výskumných tažiskách VÚ SAV: Veda je výsostne sociálna záležitosť Interview o úlohe VÚ SAV vo vede, vakcínach a Noci výskumníkov TV komentár k H7N9 IAV infekciám v Číne PB Oživenie vírusu Španielskej chrípky. RO Relácia: Hosť týždňa Reportáž o TV transmisibilite H7N9 vtáčej chrípky Miesto zverejnenia Dátum alebo počet za rok internet 2013 Avion Shopping Park Bratislava CVTI SR PRIF UK portál Science.sk Rádio Best k/veda-avyskum/interview/ved a-je-vysostne-socialnazalezitost k/veda-avyskum/interview/ved a-je-vysostne-socialnazalezitost Markíza, TN VÚ SAV Radio Regina TV Markíza hlavné správy

28 Lucia Kotlárová Martina Ličková Kotlárova, Staneková, Hollý Praznovská Ančicová, Košíková Hrabovská Chalúpková Matej Stano Praznovská Staneková, Hollý Ančicová Hrabovská Wagnerová Chalúpková Russ, Hollý Praznovská Kotlárová Barák,Derdáková Havlíková, Klempa Melničáková, Muchová, Žitňan Ondrisková Roller, Slovák TV TV iné RO stanovisko VÚ SAV k rastúcej hrozbe corona vírusov vystúpenie v reportáži spravodajstva TV JOJ o vakcinácií Klónovanie vo virológií v rámci Týžden vedy a techniky na Slovensku 2013 Nočná pyramída na tému: Veda v živote mladého slovenského vedca a plánované krátenie rozpočtu SAV iné Noc výskumníka PB iné IN Prednáška: PB1-F2 proteín vírusu chrípky: David vs. Goliáš Týždeň vedy a techniky na Slovensku 2013 Metodicke listy k projektu DEVAK (ITMS ) Vývoj diagnostických postupov pre detekciu patogénov prenášaných kliešťami a postupov na prípravu vakcín proti kliešťom Markíza, TN TV JOJ CVTI Bratislava, Lamačská cesta Rádio Slovensko Avion shoping park a Stará tržnica Bratislava Ústav molekulárnej biomedicíny LF UK CVTI SR internet 2013 Jaromír Pastorek TV Hosť v štúdiu TA diskusia na tému veda Rozhlasová stanica Peter Celec RO a výskum Potrebuje Slovensko Slovensko vedu? Franc RO Túto hudbu mám rád RTVS Gubková RO Svet vedy rádio Best FM Silvia Pastoreková Heribanová TV Anjeli strážni Silvie Pastorekovej RTVS Tvarožek RO relácia Vec verejná Rádio Slovensko Margaréta Práznovská Noc výskumníkov Avion Shopping Park iné 2013 Bratislava Týždeň vedy a iné techniky na Slovensku 2013 CVTI SR Zuzana Staneková EX popularizácia vedy a techniky Centrum VTI SR