PATOGENINIŲ MIKROORGANIZMŲ BIOLOGIJOS DALYKO APRAŠAS. Dalyko (modulio) pavadinimas Patogeninių mikroorganizmų biologija

Transcription

1 PATOGENINIŲ MIKROORGANIZMŲ BIOLOGIJOS DALYKO APRAŠAS Dalyko (modulio) pavadinimas Patogeninių mikroorganizmų biologija Kodas Dėstytojas (-ai) Padalinys (-iai) Koordinuojantis: dr. doc. Nomeda Kuisienė Kitas (-i): dr.(hp), prof. Lilija Kalėdienė dr. Lektorius Tomas Kačergius Gamtos mokslų fakultetas, Mikrobiologijos ir biotechnologijos katedra Medicinos fakultetas, Fiziologijos, biochemijos, mikrobiologijos ir laboratorinės medicinos katedra Studijų pakopa Dalyko (modulio) lygmuo Dalyko (modulio) tipas Pirmoji pakopa - Privalomasis Įgyvendinimo forma Vykdymo laikotarpis Vykdymo kalba (-os) Auditorinis 6 semestras Lietuvių Reikalavimai studijuojančiajam Išankstiniai reikalavimai: nėra Gretutiniai reikalavimai (jei yra): Biochemija, genetika, molekulinė biologija Dalyko (modulio) Visas studento darbo Kontaktinio darbo Savarankiško apimtis kreditais krūvis valandos darbo valandos Dalyko (modulio) tikslas: studijų programos ugdomos kompetencijos...dalyko tikslas suteikti žinių apie patogeninius mikroorganizmus, jų patogeniškumo veiksnius ir patogenezės mechanizmus; supažindinti su jų reikšme žmonių sveikatai; suteikti žinių apie jų diagnostikos metodus, saugumo taisykles dirbant su patogenais laboratorijose ir gydymo įstaigose. Dalyko (modulio) studijų siekiniai Studijų metodai Vertinimo metodai - Studentas įgis žinių apie patogeninius mikroorganizmus, jų savybes. - Studentas susipažins su saugaus darbo su patogenais taisyklėmis ir reikalavimais. - Studentas įgis žinių apie patogeninių mikroorganizmų virulentiškumo veiksnius, patogenezės mechanizmus ir diagnostinius metodus. - Studentas išmoks pasirinkti tinkamą metodą patogeninių mikroorganizmų identifikavimui ir skaičiaus įvertinimui. - Studentas susipažins su pačiais moderniausiais metodais, taikomais klinikinėje mikrobiologijoje ir infekcinėje imunologijoje. - Studentas išmoks dirbti savarankiškai ir grupėje, analizuoti informaciją, diskutuoti grupėje. - Studentas įgis profesinių įgūdžių. Temos Kontaktinio darbo valandos Referatas, Savarankiškų studijų laikas ir užduotys

2 1. Įvadas į medicininę mikrobiologiją. Normalios mikrofloros samprata, patogeniniai, sąlyginai patogeniniai, oportunistiniai infekcijų sukėlėjai, jų išskyrimo ir identifikavimo metodai. 2. Bakterijų patogenezės mechanizmai. Bakterijų virulentiškumo veiksniai: agresyvieji, nespecifiniai, apsaugos veiksniai. Endotoksinų sandara. Invazynai, adhezinai. 3. Specialioji ir klinikinė bakteriologija. Pagrindinės patogenų rūšys. Diagnostika. 4. Probiotikai. Mikrobioma. Laktobacilos 5. Medicininė mikologija. Sukėlėjų taksonomija, paplitimas, dimorfizmas, dauginimosi organai, toksinai, mikozių klasifikacija ir jų sukėlėjai. Laboratorinė diagnostika. 6. Bakterijų patogeniškumo faktoriai ir mechanizmai.virulentiškumo genai. Adhezinai ir invazinai. Viduląstelinių patogenų invazijos molekuliniai mechanizmai. Patogeninių bakterijų toksigenezė. Toksinų klasifikacija ir veikimo mechanizmai. Toksoidai. Kolonizacija. Šeimininko ir patogeno konkurencija dėl maisto medžiagų. Paskaitos Konsultacijos Seminarai Pratybos Laboratoriniai darbai Praktika Visas kontaktinis darbas Savarankiškas darbas Užduotys seminarams, referato 9 Pasiruošimas 2 Pasiruošimas 7. Patogenų molekulinė biologija ir evoliucija: patogeniškumo salelės ir kiti mobilūs elementai. Patogeniškumo salelės ir patogenų evoliucija. Mobilių genominių elementų nomenklatūra. Mobilūs elementai patogenuose ir jų ryšys su 2 Pasiruošimas

3 toksinozėmis. Horizontalioji genomika. Svarbiausių patogeninių bakterijų mobilomai. 8. Patogenų strategijos, siekiant išvengti šeimininko imuninės sistemos.epitelio barjeras: įveikimo strategijos ir molekuliniai mechanizmai. Fagocitų barjeras: įveikimo strategijos ir molekuliniai mechanizmai. Atsparumo humoraliniam imunitetui molekuliniai mechanizmai. Patogeninės bakterijos: manipuliacijos citokinais. T- ir B- limfocitų funkcijų blokavimo molekuliniai mechanizmai. 9.Atsparumas antibiotikams: problema ir mechanizmai. Atsparumo siurblių veikimo mechanizmai. Antibiotikų modifikavimo in vivo mechanizmai. Antibiotikų taikinių modifikavimo mechanizmai. Su paveldimumu nesusijęs atsparumas antibiotikams. Įgytas atsparumas antibiotikams. Horizontalus atsparumo antibiotikams genų perdavimas. Mobilių elementų vaidmuo atsparumo antibiotikams plitime. 10.Genomika ir proteomika patogeninių bakterijų tyrimuose. Genomika patogenų populiacijų tyrimuose. Genomikos vaidmuo rekonstruojant patogenų plitimo kelius. Patogenų evoliucija. Funkcinė patogenų genomika. Lyginamoji patogeninių bakterijų proteomika. Proteomika virulentiškumo faktorių tyrimuose. 11. Infekcinis procesas, infekcinė liga, organizmo imlumas. Infekcinės ir invazinės ligos. 12. Imunitetas, jo rūšys, formos. Ląsteliniai ir humoraliniai nespecifiniai saugos veiksniai Pasiruošimas ruošimas. (Immunology of 5 Pasiruošimas ruošimas. (Immunology

4 Ląstelinio ir humoralinio imuninio atsako mechanizmai. Antigenai, antigeninė sandara. Imunoglobulinai, jų struktūra, funkcija. 13. Antivirusinis imunitetas. Interferonai. Imunodiagnostika. Imunologinės reakcijos.serodiagnostika. 14. Medicininė virusologija. Virusai, jų klasifikacija ir nomenklatūra. Virusų morfologija, struktūra ir reprodukcija. Virusinių infekcijų patogenezės mechanizmai. Metodai taikomi virusinių infekcijų laboratorinei diagnostikai. 15. Oro lašeliniu keliu plintantys 16. Kontaktiniu keliu plintantys 17. Alimentiniu keliu plintantys 18. Transmisiniu keliu (per pernešėjus) plintantys 19. Hospitalines infekcijas sukeliantys mikroorganizmai. Pagrindiniai patogenai, jų savybės, plitimo keliai ir sukeliamos infekcijos. Patogenezės mechanizmai. of 5 Pasiruošimas seminarams, referato ruošimas. (Immunology of 5 Pasiruošimas paskaitų paskaitų 20. Egzaminas 13 Pasiruošimas ruošimas, pasiruošimas

5 Iš viso egzaminui. Vertinimo strategija Referatas (pranešimas žodžiu visai grupei iki 15 min.) Svoris Atsiskaitymo proc. laikas 20 Seminarų metu Vertinimo kriterijai 2 balai tema išanalizuota labai išsamiai, detaliai, naudojant pačią naujausią mokslinę literatūrą; 1 balas tema išanalizuota pakankamai išsamiai, detaliai, tačiau naudota literatūra yra senoka arba remtasi tik vadovėliais; 0 balų tema išanalizuota nepilnai arba/ir su klaidomis. Dalyvavimas seminaruose 10 Seminarų metu Aktyvus bent 10 iš 16 seminarų vertinamas 1 balu. Egzaminas 70 Birželio mėn. Egzaminavimas vykdomas Kompiuterinės egzaminavimo sistemos pagalba. Egzaminą sudaro 50 klausimų. 7 balai % maksimalios taškų sumos; 6 balai % maksimalios taškų sumos; 5 balai % maksimalios taškų sumos; 4 balai % maksimalios taškų sumos; 3 balai % maksimalios taškų sumos; 2 balai % maksimalios taškų sumos; 1 balas % maksimalios taškų sumos. Autorius Privalomoji literatūra T.J. Kindt, B.A. Osborne R. A. Goldsby Edited by Stefan Kaufmann, Dieter Kabelitz, Adomaitienė D., Janulevičiūtė N., Kazakevičius R., Vaičiuvėnas V. P.R. Murray, K.S.Rosenthal, M.A.Pfaller B.A.Forbes, D.F.Sahm, A.S. Weissfeld Leidimo metai Pavadinimas Galutinį įvertinimą sudaro egzamino, dalyvavimo seminaruose ir referato įvertinimų suma. Periodinio Leidimo vieta ir leidinio Nr. leidykla ar leidinio ar internetinė tomas nuoroda 2006 Kuby Immunology, 7th edition W.H. Freeman & Company 2002 Immunology of Infection Max Planck Institute for Infection Biology, Berlin, Germany University of Kiel, Germany 2001 Klinikinės imunologijos įvadas Šviesa, Kaunas Medical microbiology 5 th edition Elsevier Mosby USA 2007 Diagnostic microbiology Mosby Elsevier er.com Papildoma literatūra Abbas A. K., 2000 Cellular and Molecular Lichtman A. H., Immunology Pober J.S.. Fourth ed. W.B. Saunders Company.

6 M. Sussman ed Molecular medical microbiology (3 tomai) Academic Press